水生蔬菜主要有茭白、莲藕、慈菇和芋头等。水生菜田与旱地菜田环境不同，田里一般有水层，危害的杂草也多为水生和湿生杂草，所以除草剂也要适于有水条件。
1.茭白田化学除草技术
茭白依品种不同分为春、夏季种植，并在田间以地下休眠根茎越冬至初夏采收结束。主栽茭白品种春季定植后于当年秋季至翌年各收获1次，生长期长达1年以上。茭白在定植后及越冬期均有大量杂草发生，人工除草用工量较大。茭白春、夏季定植后发生的杂草基本上与水稻田相似，越冬期杂草则与麦田、油菜田杂草相似。
（1）春夏定植茭白田。茭白与水稻一样同属禾本科作物，春、夏定植时其生长环境和杂草发生危害与水稻极为相似。所以，适用于水稻田的某些除草剂，能用到茭白田中进行杂草防除。可选用的除草剂有丁草胺、苄嘧磺隆（农得时）、恶草酮（恶草灵）、恶及其他复配剂等。
（2）茭白越冬期。茭白越冬期是茭白一生中杂草发生最严重的时期，由于此时茭白地上部分枯死，地下根茎处于休眠状态，故采用茎叶处理剂或灭生性除草剂不会对茭白产生药害，而且除草效果好。可选用的除草剂有百草枯（克芜踪）、草甘膦和精氟吡甲禾灵（精盖草能）等茎叶处理剂。
2.莲藕田化学除草技术
一般要在莲藕栽后7～10d，气温升至25℃以上，水温稳定在20℃时，以药土法将药剂均匀撒于田中，可选用的药剂有扑草净、丁草胺。
（1）扑草净。50％扑草净可湿性粉剂40～50g／亩，与15～20kg细潮土拌成毒土，于栽藕后7～10d撒入田中。撒药时田间应保持3～5cm水层，用药后保水5～7d；藕芽不可浸在水中。
（2）丁草胺。60％丁草胺乳油100mL／亩，与15～20kg细潮土拌成毒土，于栽藕后7～10d撒入田中。撒药时田间应保持3～5cm水层，用药后保水5～7d；藕芽不可浸在水中。
3.慈菇、芋头田化学除草技术
这两种水生蔬菜田化学除草，也可以药土法撒施药剂，一般使用丁草胺。60％丁草胺乳油100mL／亩，与15～20kg细潮土拌成毒土，于移栽后7～10d撒入田中。撒药时田间应保持3～5cm水层，用药后保水5～7d。