是月，兵众云集，开设二十八宿营：角宿、戴捷，亢宿、林德，氐宿、郑荣，房宿、周全斌，心宿、周腾，尾宿、杨正，箕宿、郑文星，斗宿、林功，牛宿、谢对，女宿、蔡科，虚宿、洪承宠，危宿、赖策，室宿、廉彪，壁宿、唐邦杰，奎宿、华章，昴宿、杜辉，柳宿、姚国泰，井宿、陈习山，进攻漳州。守将王邦俊撄城固守，上下请援。本藩随分兵重围数匝困之。遣仁武营吴豪、义武营杨朝栋专札西门营盘堵御，以前冲镇万礼、礼武镇陈俸、尾宿营杨正为应援，另拨戎旗镇王秀奇提调兼应援，西门有失则罪王秀奇。〔遣〕护卫左镇沈明、正兵营陈埙、亲丁镇欧斌专札北门营盘堵御，以左冲镇杨琦、右冲镇柯鹏、亢宿营林德为应援，另拨提督前黄廷为提调兼应援，北门有失则罪黄廷。遣护卫前镇陈尧策、角宿营戴捷专札东门营盘堵御，以援剿左〔镇〕林胜、中冲镇萧拱辰、后冲镇陈朝、心宿营周腾为应援，以提督右黄山提调兼应援，东门有失则罪黄山。其南门专札营盘，以游兵营黄元札新桥头，后劲镇陈魁札旧桥头，信武营陈泽、智武营蓝衍为应援，另拨北镇陈六御提调兼应援，南门有失则罪六御。又拨氐宿营郑荣、柳宿营姚国泰专札八角楼营盘堵御，以英兵营黄梧为应援，定西侯张名振为提调，八角亭有失则罪名振。奇兵镇杨祖、援剿后〔镇〕蓝登、房宿营周全斌专札东岳一带大路堵御援兵，以中权镇黄兴提调兼应援，大路有失财罪黄兴。另拨亲随营李长、提督前黄廷、提督中甘辉、铁骑镇刘有才、昂宿营杜辉兼各处应援游兵。本藩驻札南院调遣。其余各镇分守漳浦、海澄、诏安、长泰、平和、南靖等县。
五月，虏援兵金衢马至漳，随会王邦俊督兵繇（由）东门进战。本藩随拨房宿营周全斌、援剿后〔镇〕蓝登伏东岳左边，牛宿营谢对、援剿右〔镇〕余新伏右边，大师屯札市尾两边，待敌虏入囗而进。本藩督令戎旗镇亲随营黄昌、前提督、中提督等贾勇杀进，而房宿、井宿两边冲击。虏随败走，擒其副将金凤，杀获甚多。后退守城中，不敢复出。藩论功陞赏各有差。传令各筑营盘围困。其营盘外开河沟一丈、鹿角一重、木栅一重，木栅内则竖籧篨，每籧篨三个隔一位，设一铜百子铳；另筑短墙如城一样困守之。此北将王有才所画进。传各营如式而行，以为久困之计。虏援绝不敢出战，仍坚闭固守。
是月，前军定西侯张名振议就镇门筑水灌浸漳城，缘工力浩大，水湍难防，弃之。
漳平县虏守将廉彪来见（彪身大数围，旅力过人，能左右射，百发百中），因副将蔡勤引见，藩礼敬之，授室宿营，令回札茶坊岭，招募克复上游。
陈金（锦）杀败，金衢马等来援，亦被杀退，漳围未改，遂集舟师数百只来犯中左，攻吾所必救，以改漳围。藩令一镇陈辉为总督，率右军闽安侯、后军周崔之、左军辅明侯、前镇阮骏、后镇施举等水师百余号往迎之，遇敌于崇武。时虏舟据上流，顺风冲下，我师少却。至流退风转，陈辉挥令冲犁。周瑞同施举二坐驾扬帆冲入虏阵奋击，虏不敢当。继而各船涌进协击，虏遂披靡退走。虏繇（由）崇武登岸而逃，夺其大船十余只而回。
六月，藩驾如浯洲青屿澳，赏罚水师官兵。传令漳城围困将领，加谨囗，毋致疏虞。赏右军周瑞、后镇施举首功，杀其退却副将四员。传令照旧防守泉港虏船。自是虏船再出来犯，被我舟师囗，焚其舟，并杀其副将。繇（由）是虏水师不敢复逞。
亲丁镇欧斌病故，以郭廷为亲丁镇。
七月，藩督师围困漳州。时城中乏粮，至食人肉，百姓多饿死。王邦俊等遣满骑欲冲出寨中取讨粮米，被我官兵伏杀无回。虏闻知，不敢再出，坚守饥饿待援。
八月，藩督师围困漳州。时粮米益尽，百姓饿死过半。虏兵有至食萍充饥者，有逃出降者，俱称欲夺路共逃，亦有欲降者。本藩传令攻城，撤去西、北两门营盘住兵，环攻东、南，听其夜遁，伏半路截杀。虏侦知，亦不敢遁，只得饿守。
九月十八日，报金固山砺统浙、直满、汉马骑万匹大队，星夜入援，至泉驻札。本藩集诸将议曰：『攻城未下，援兵已至，暂且解围，军于江东以待之，如杀陈金（锦）一样，则漳城亦如长泰，不攻自下矣』。诸将曰：『可』。时金固山闻，监江东覆辙，不敢直进，兼程繇（由）长泰小路进。藩侦知，随于二十六日解围，择札古县地方，据险以待。虏亦于是日进城。藩下营于田中高埠处。左边拨中提督甘辉统亲丁镇郭廷、左援〔剿〕、前冲、中冲等镇札于山顶，伏松柏林内；右边拨右提督黄山统右援剿余新、右冲镇柯鹏、护卫右洪承宠、礼武镇陈俸等阵于田中作头叠；以后冲镇、护卫左右冲等为应援，拨前提督黄廷督右先锋廖敬、亢宿营林德等往来驰援右边，拨前锋镇赫文兴马骑就中驰击应援左边。本藩自督戎旗镇驰援左右。碁布已定，金固山遂率城守并援兵万余骑前来对敌。
十月初一日，虏札营对垒，见我营伍星布碁密，未敢轻进。至初三早，西北风盛发，占据风上，遂分囗股而来。先以一股冲我左边。中提督挥兵接战，约数合，胜负未分。继而我林内兵抄断其后，合兵逼进，虏遂披靡，被我兵逐杀，死者过半，余者败回，作一堆齐拥，直冲我右边。右提督挥兵接战。我用火箭、火炮，神器齐发，一时西风猛烈，火烟被风打回，对面昏黑，遮不见人。虏遂乘烟突冲，我兵不能相顾，溃散而走。藩亲督戎旗等继进，已无及矣。虏遂遍野追来，我兵且战且退。藩驾随回札海澄。是晚查点，不见右提督黄山、礼武镇陈俸、右先锋廖敬、亲丁镇郭廷、护卫右镇洪承宠等回，已战没阵中矣。藩集诸将，欲治丧师之罪，尽杀之。甘辉言曰：『此番非人力不齐、将士不用命，乃反风所误，天时不顺，地利失据，以至败回，亦天未厌乱也』。藩默思良久曰：『尔言固是，但我见阵中旗帜未接即退者。此等不儆，将何以治兵』？于是定亢宿营林德先退，枭示徇军中；右冲镇柯鹏捆责削职。另议优恤阵亡将领家眷，并令礼官议礼迎入忠臣庙祭享。
藩驾拟回中左，派拨屯守海澄。随行前锋镇赫文兴提调房宿营周全斌、智武营蓝衍防守东门，义武营杨朝栋提调北镇中协唐邦杰、柳宿营姚国泰、氐宿营郑荣防守南门兼应援，又以援剿后〔镇〕蓝登、中权镇黄兴协守西北门，以副将蒋勤同谢子连协御西门、小水门。城内碁布已密，又拨都督王明驾铳船为首程，提督中镇为二程，防守乌礁水师；拨援剿左镇林胜、亲随营黄昌为二程，援剿前镇为三程，仁武营吴豪为四程，防守中洲水师。调遣已定，随率镇将回中左，并调遣南北征剿。
令冯工官吊（调）民夫增筑海澄短墙。
朱逿先先生曰：『增筑海澄城，此书记载甚略（仅云：「令冯工官调民夫，增筑海澄短墙」，）似不知其重要。阮旻锡记此事则较详，其言曰：「筑海澄城，所属地方，每家各出民夫一名。城高二丈余，旧有五都土城，连而为一，皆用灰石砌成，并筑短墙，安大小铳三千余号，周围环以港水，巨浸茫茫，外通舟楫，内积米榖军器，据潮州之咽喉，与厦、金二门，相为表里，以为长守之计。命冯澄世督其工（海上见闻录上）。据阮氏之记载，则更可见海澄之失，不特丧其辎重、军器为可惜也』。
十一月，藩驾驻中左。陞义武营杨朝栋为右冲镇，前冲镇副将陈鹏为义武营。其二十八宿营暂拨归镇。亲丁镇不设。右先锋、礼武等镇，候员另补。
遣中权镇黄兴为正提调，前冲镇万礼为副提调，率援剿右余新、护卫前陈尧策、护卫右沈明、英兵营黄梧、戎旗一营王怡、三营陈端、恢抚卢若骥等，往诏安、九甲、平和等处略地措粮。
是月，秦王孙可望移檄会师。安西王李定国复广西，杀伪王孔有德，遣使会师。藩遣效用官李景往广西，约师会期。
十二月，藩驾驻中左。知海澄县事参军黄维景失职不谨，逮系羁留，委正中军都督张英理县事。
虏侦知黄兴等驻师平和，遂遣三大人带马步数千前往追逐。一枝逐至大小墡地方，正提调黄兴等据险迎敌，虏不知地利，被我师用伏击杀，退败而走。一枝追至松柏坑，被副提调万礼据险设伏，擒杀殆尽，虏遂奔回。
七年癸巳（一五六三）正月，藩驾驻中左。漳虏大队到石码镇，被我官兵逐杀之，尽焚民居店舍奔回。藩令中军张英招徕安集如故。
太师平国公差周继武至自燕京，传清朝欲来议和，令藩议就之。藩差李德奉书禀复太师，言：『儿南下数年，已作方外之人。张学圣无故擅发大难之端，儿不得不应。今骑虎难下，兵集难散』云云。
二月，藩驾驻中左。中权镇黄兴等率众自诏安回，藩召集责之曰：『未闻帅令，擅自归回，是欲何为』？问谁为唱首，众俱以王怡、若骥对。王怡，令推出斩之；若骥，捆责革职。正副提调并各将领俱降级有差。
委五镇余宽镇守三都等处地方。
三月，藩驾驻中左。遣前军定西侯等水师恢复浙、直。先时，定西启曰：『名振生长江南，将兵数十年，今虏各处兵将，多系旧属。兹金酋既并力于闽，势必空虚浙、直，我以百艘，乘此长风破浪，直入长江，号召旧时手足，攻城掠野，因时制宜，捣其心腹，虏无暇南顾，藩主得以恢复闽省，会师浙、直，可指日待也』。藩从而遣之。并遣忠靖伯陈辉、中权镇黄兴、护卫右镇沈奇、礼武镇林顺、智武营蓝衍、后镇施举等一齐进入长江。
四月，报固山金砺吊（调）集水陆官兵船只，欲寇海澄、中左，即遣左军辅明侯林察、右军周瑞、后军周崔之、前镇阮骏、援剿前镇黄大振等督率官兵船只，前往堵御虏船。后遇飓风，辅明侯林察船漂入兴化港，被虏拘禁于狱，至郑贾来议和，出之。
十八日，报虏吊（调）集十县民夫二万，抬运攻城器椇，于是日同马步数万出城，驻札教场，来犯海澄。藩亦使令办守城器椇以待之。
二十八日，虏札营祖山头。
后冲镇陈朝病故，以叶章管理后冲镇事。
五月，藩驾到海澄。令正中军张英催督守城民夫器椇。拨北镇陈六御督义武营、仁武营、智武营防守县内。拨援剿左〔镇〕林胜堵御南门外桥头。拨左先锋镇堵御囗外岳庙前。拨护卫左镇沈明守中权关。拨正兵、奇兵等镇守土城、九都城。拨前锋镇赫文兴、戎旗镇王秀奇、护卫前镇陈尧策守御镇远寨，前冲镇万礼帮守镇远寨外。拨前提督黄廷、中提督甘辉札守关帝庙前木栅，连接镇远寨。本藩驻札妈宫，亲行督战。
又令水师杨权、蔡新等驾船击其旁。虏移炮击我水师，杨权被击死。
初四日，金固山率马步数万札营妈宫前，离我营半里之地。藩令我师击其营。虏是晚即逼营安籧篨、大小铳炮数百号，日夜连击，无瞬息间断，打透我营中，官兵多被击伤而死。至籧篨、木栅，多被打碎崩坏。藩传令立刻修筑完固。至初五午，诸将请令曰：『虏炮连续不绝，籧篨多被击碎，无可容身，各官兵俱愿出决一战，不肯坐受其击』。藩问：『谁敢领头叠冲击』？后劲镇陈魁、后冲镇叶章等向前愿领。于是随令诸镇各选精勇数百名，合力乘炮烟冲进。虏见我兵出营，炮铳齐发，我兵又多击伤。后冲镇叶章被铳打死，后劲镇陈魁右腿击折。藩令收军而退，只得固守。拔周全斌署理后冲镇事，杨正管理后劲镇事。礼葬叶章，陈魁发回中左调治。
虏连击两日夜，我营垒整而又坏，官兵无可躜立，损伤者多。兵将营中偶语，各无守志。藩颇闻之。
初六早，藩见营垒难堪，官兵面面惊愠（惧），遂唤旗鼓张光启往各营传令，光启不敢往。再唤宣令廖达进曰：『可往遍传大小将领官兵，此城不守，尚图恢复？再迟早晚，本藩有计杀虏，令其片甲不回。如有不敢守者，即报名来，听其回去。本藩于此土，生死以之，决无抽回之理也』。时参军冯举人参赞营中，亦言：『虽死无可去之理，恐将领未喻藩意耳』。于是再谕参军曰：『尔为我持此招讨之印，遍谕军中。朝廷以此畀我，我惟有效死勿去而已。诸将中有能率众得功者，愿以此题让』。于是参军持印传谕军中，无不感奋。诸将齐到请令。藩劳以酒。甘提督对众激言曰：『古云：「人生自古谁无死，留此丹心照汗青」，此番竭力以守，倘有不测，亦死得其所』！王秀奇等合声齐应曰：『此城是大家今日死忠营也』！藩壮其志，令人酣饮。藩遂率诸将上敌台观敌。诸将告以铳炮繁多，不可乘危。藩曰：『死生有命在天，虏炮如我何』？于是上台，指虏观视。虏见之，知其国姓，移炮向击，丛矢向射。时典膳役苏贵持战被向护，中提督挤藩下台，忽〔一〕声炮响，中击藩座，此一险也。