沼肥比我国农村传统使用的堆沤肥效果好。沼气发酵是农村获得优质有机肥的一个有效方法，对氮、磷、钾的回收率可达90％以上，并且总体矿化率低。沼肥与堆沤肥相比，磷的损失率为堆沤制肥的1／16，矿化率为堆沤制肥的1／5，堆沤肥的氮素损失率高达50％左右。
