公元1649年，沙俄再度侵入黑龙江，占领了雅克萨城。在平定三藩之后，康熙皇帝决定对沙俄展开斗争。公元1683年，清政府在瑷珲设立黑龙江将军，加强对边防的控制。
公元1685年初，为了彻底消除沙皇俄国的侵略，康熙命都统彭春赴瑷珲，收复雅克萨。5月25日黎明，清军对雅克萨发动猛攻，沙俄侵略军伤亡惨重，宣告投降，请求清军放行，撤退至尼布楚。侵略军被迫撤离以后，贼心不死，图谋再犯。公元1687年，在接到沙俄再犯的奏报以后，康熙皇帝下令反击。侵略军被围困一年时间，近1000个士兵最后剩下66个。沙皇急忙向清朝派遣使者议定边界，雅克萨反击战结束。