侦察探测系统负责收集有关敌军的各种情报。C3I系统的信息源都是靠侦察探测系统获得的。
它包括：特种情报系统，即军事和非军事敌方情报系统，如美国的中央情报局和前苏联的克格勃等；飞机和巡航导弹的探测系统，含地面雷达、空载（飞机、气球等）雷达和舰载雷达、红外、观察哨等；弹道导弹和间谍卫星探测系统，主要有雷达、超视距雷达和预警卫星等；电子侦察系统，有电子侦察站、侦察飞机、侦察船和侦察卫星、预警卫星等；地面和海面侦察系统，如雷达、光学仪器、照相、侦察飞机、侦察船、观察哨和侦察员等；水下探测系统，如声纳、光学仪器等。