B超应用于临床已近40年了，B超检查的安全性已得到肯定。理论上，高强度的超声波通过高温及对组织的腔化作用，可能会对组织产生损伤，但事实上，医学上使用的B超是低强度的，低于94毫瓦/厘米3，对胎儿是没有危险的，直至目前，尚没有B超检查引起胎儿畸形的报道。目前，多数专家认为B超是安全的，但也有少数专家指出，B超是一种高强度脉冲超声波，有很强的穿透力，对处于敏感期的胚胎和胎儿也会产生一定的不良反应。有些国外专家根据实验证明，B超对女婴的卵巢可能有影响，有可能影响将来卵巢所承担的生育和调节月经的功能。所以争早期尽量不做或少做B超为好。
正常的妊娠B超检查不应超过3次。
第一次B超检查时间最好安排在孕18～20周，此时可确定怀的是单胎还是多胎，并可测量胎儿头围等。因为这一阶段测得的多项胎儿B超指标误差较小，便于核对孕龄。
第二次B超检查时间最好安排在孕28～30周。此时做B超的目的是了解胎儿发育情况，是否有体表畸形，还能对胎儿的位置及羊水量有进一步了解。
最后一次B超检查最好安排在孕37～40周，此时做B超检查的目的是确定胎位、胎儿大小、胎盘成熟度、有无脐带缠颈等，进行临产前的最后评估。