风疹病毒感染是目前发现最主要的导致先天性残疾的生物因素之一。由于受风疹病毒感染的胎儿常常有多个组织的损害，故被称为先天性风疹综合征。先天性风疹综合征最常见的为三联症（耳聋、白内障以及先天性心脏病）患者。
风疹病毒感染的危害主要发生在妊娠早期。据研究报告，孕妇在妊娠第1个月患风疹，婴儿先天性残疾的几率高达50%；妊娠第2个月患风疹，婴儿先天性残疾的几率为22%；妊娠第3个月患风疹，婴儿先天性残疾的几率为6%；妊娠4个月后感染风疹，导致婴儿先天性残疾的机会将更小，但不能完全排除其可能性。有些感染了风疹病毒的婴儿并不是出生后立即出现先天性风疹综合征症状，而是在出生后数周、数月，甚至数年后才逐渐显现出来。
先天性风疹综合征无特殊的治疗方法。预防风疹病毒感染是预防先天性风疹综合征的重要措施。未患过风疹者最好的预防办法是接种风疹疫苗。用灭活风疹病毒疫苗进行接种可产生免疫力。接种疫苗后至少应避孕3个月，以免疫苗在孕早期导致感染。如已经怀孕，就不应接种风疹疫苗，以免发生胎儿感染。
在妊娠早期感染了风疹病毒的孕妇应在妊娠中期进行产前诊断，如发现胎儿已经感染或畸形，应当考虑补救措施。