苹果霉心病是北斗和元帅系品种上重要的果实病害。该病从果实外部看并无明显的症状，而在果实内部发生，从心室开始，逐渐向外扩展霉烂。心室内出现黑色、白色或粉红色霉状物。在生长期，霉心病果从外观不易识别辨认，但有的出现果面发黄、果形不正或着色较早的现象。病果易脱落，落地后继续霉烂。在贮藏期霉烂严重时，果实胴部可见水渍状，褐色，形状不规则的湿腐斑块，斑块可彼此相连成片，最后全果腐烂，病果味苦。
该病是由多种弱寄生菌为害所致，这些菌类在树体及其周围环境中广泛存在，据资料介绍，尚未发现有明显的集中侵染时期。这是药剂防治效果不理想的根本原因。
试验调查，早春喷波美5度石硫合剂，花前、花后结合防治红蜘蛛等病虫害，喷两次波美0.2～0.3度石硫合剂，霉心病的病果率可减少一半。
从果树现蕾期至落花期后10天，连续喷洒3次杀菌剂，有一定防治效果。药剂可用70％甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，或50％扑海因可湿性粉剂1000～1500倍液，或10％多氧霉素可湿性粉剂1000～1500倍液，或40％多菌灵胶悬剂800倍液。