一、保护区概况：
保护区根据新疆维吾尔自治区人民政府1982年批文建立，总面积为1733000公顷，主要保护珍稀动物资源及其生态环境。
二、地理位置：保护区位于新疆维吾尔自治区奇台、吉木萨尔、阜康、富蕴、清河、福海等6县境内，地处新疆北部准噶尔盆地古尔班通古特大沙漠的东缘、乌伦古河以南、北塔山的西部、将军戈壁以北。
三、自然环境：保护区东部属砾石戈壁，中部属卡拉麦里山、西部属沙漠。
卡拉麦里山东西走向，南北宽20—40公里，一般海拔高度1000米，相对高差不足500米。北面为低山丘陵，坡度较缓，相对高差仅几十米。山岭以南为将军戈壁，个别地段形成沙丘。保护区西部沙漠是古尔班通古特沙漠的一部分，有6条大的中速流动沙垅和大面积的格状沙丘链。山地丘陵、风蚀台原与沙漠的交界处形成大的泥漠，俗称：“黄泥滩”。气候干旱，年均温2.38摄氏度；年平均降水量159.1毫米，而蒸发量高达2090.4毫米。
四、植物资源：
山群南部及西南部，梭梭、白梭梭荒漠占有较大比重。西部半固定沙丘上为禾草—短叶假木贼草原化沙漠，并有少量琵琶柴分布。禾草类主要有针茅、沙生针茅、三芒草、驼绒藜、沙蒿等。在固定沙丘上，优若藜、小蒿荒漠是重要的植被。国家三级保护植物有梭梭、白梭梭等。
五、动物资源：
保护区的兽类有蒙古野驴、盘羊、鹅喉羚、草原斑猫、赤狐、沙狐、艾鼬、草兔和多种啮齿类。鸟类有金雕、玉带海雕、苍鹰、大鸨、小鸨。爬行类有荒漠麻蜥等。
国家一级保护动物有：蒙古野驴、金雕、玉带海雕、大鸨、小鸨等。二级有：草原斑猫、盘羊、鬣羚、苍鹰、纵纹腹小鸨等。已绝灭的动物有野马、高鼻羚羊。
蒙古野驴：国家一级保护动物，保护区内有近万只左右。它为大型有蹄类，外形似骡，体长2米左右、高约1.2米、体重约260千克。颈部有鬣毛，为棕黑色，鬣毛带窄，毛短而直立。尾较粗长，尖端毛较长，棕黄色。
它栖息于海拔3800—5000米的高原亚寒带开阔草甸和寒冻半荒漠、荒漠地带。以禾本科、莎草科和百合科的粗草为食。每年7—9月交配，妊娠11个月，每胎产1仔，幼子4岁性成熟。
准噶尔盆地是新疆重要的有蹄类野生动物保护区之一。近年来，随着人们保护意识的增强，鹅喉羚的数量明显增加。
野马的身世
野马的身世，可上溯到5400万年前生存在第三纪始新世的“始祖马”。一个有力的论据是，1867年，关于它的一枚非常完整的化石，出土于美国怀俄明州。
这是一个灵巧的小动物，体形与狐相似，背部隆起。前足有4趾，后足有3趾，适于在温热的森林、松软的土地上行走。它们以灌木的嫩叶为食。
这种小动物的足迹普遍布美洲，并通过当时的大洲陆桥扩散到欧亚大陆，直到4000万年前灭绝。
随着地球上草原的扩展，始祖马经过千百年演化，先后形成了极具奔跑能力的森林三趾马、草原三趾马以及晚近地质时期的真马。
在这个演化过程中，它们的体型逐渐变大，四肢由短变长，趾数由多变少，牙齿也由低齿变为高齿冠。同时，形成许多分支。其中，大多数分支后来相继灭绝。
大约600万年前，在美洲出现的“更新马”，被人们认为是现代马属的直系祖先。后来，扩散到欧亚大陆，并形成斑马、非洲野驴、中东野驴、野马等4个相关联的类群。
而它们在美洲的后裔，大约在8000年前印第安人入迁前后灭绝。直到1519年，西班牙移民带去16匹马到达墨西哥，马才再一次进入美洲大陆。
在过去的几百年间，法国、西班牙等国的洞穴里，人们曾发现许多野马壁画，由此断定，2万年前，野马在欧亚大陆上到处漫步。
在这期间，人类数量相对很少，对环境造成的威胁也小。在人类开始耕种，饲养牲畜的过程中，这些野生动物成为农场主的“敌人”，令他们大为头疼。
其中，野马是最大的麻烦。它们成群结队，大胆地闯进农场，砸碎围栏，啃食庄稼。公野马有时还会把农场主驯化的母性小马驹领走。
随着时间的流逝，人口和牲畜极速增加，人类越来越多的需求，将一片又一片野地拉上围栏，这意味着野马的家园越来越小。
到了19世纪，人类才发现，野马群仅限于波兰、俄罗斯南部。尽管有人怀疑这是不是真正的野马群（也许是家马跑出去），但不管如何，当科学家为此争吵、讨论得沸沸扬扬时，那里的野马也已经消失了。
人类经济活动的加剧，致使自然界各种野马相继绝灭。
野马进化中，在世界各地不同时期地层中，留下相当丰富的化石埋藏。例如，我国华北、江苏各地均有各式各样的“三趾马”出土。它们不但为探讨野马的系统演化、古地理环境变迁及生物进化提供有力佐证，也是进行地层地质年代断代的可靠依据。