医药学
拉齐（公元865～925？年）不但是一位杰出的化学家与哲学家，还是一位著名医学家。拉齐在医学上广泛吸收希腊、印度、波斯、阿拉伯（甚至中国）的医学成果，并且创立了新的医疗体系与方法。
他尤其在外科学（例如疝气、肾与膀胱结石、痔疮、关节疾病等）、儿科学（例如小儿痢疾）、传染病及疑难杂症方面具有丰富的临床经验与理论知识。
他是外科串线法、丝线止血和内科精神治疗法的发明者，也是首创外科缝合的肠线及用酒精"消毒"的医学家，还是世界上早期准确描述并鉴别天花与麻疹者。
拉齐注意到一种疾病出现的面部浮肿和卡他症状（如打喷嚏、流清涕），与玫瑰花生长及开放之间存在一定的关系，他第一个指出所谓的花粉热就是缘于这种玫瑰花的"芳香"。
拉齐的代表作《曼苏尔医书》是医学史上的经典著作。此外他还著有《医学入门》、《医学止境》、《精神病学》、《天花与麻疹》、《药物学》、《盖伦医学书的疑点和矛盾》等。
伊本·西那（公元980～1037年）公元980年出生于中亚的历史名城布哈拉附近，是代表阿拉伯帝国医学最高境界的里程碑。
他与希腊的希波克拉底（公元前460？～370？年）、盖伦并称医学史上的三位鼻祖，被尊为"医者之尊"。伊本·西那学识渊博，除了医学之外，他在其它方面也颇有造诣。伊本·西那的医学成就主要体现于一部极其著名的百万字医学百科全书--《医典》。
他在《医典》的开篇中说："医学是这样一门科学，它告诉人们关于机体的健康状况，从而使人们在拥有健康的时候珍惜健康，并且帮助人们在失去健康的时候恢复健康。"《医典》一书全面而系统，全书包括5部分，分别讲述医学总论、药物学、人体疾病各论及全身性疾病等内容。
感染性疾病曾经一直是人类疾病的第一位死亡原因，今天人们已经认识到，这类疾病是由病原体例如致病性细菌、真菌与病毒等引起的。
伊本·西那提出人本身以外的因素在引发疾病方面的作用，首先发现了"原体"可以是产生疾病的原因，指出肺结核就属于此类疾病，天花和麻疹也是由肉眼看不到的"原体"所致，而且还强调了"消毒"的重要性。
他发现水与土壤可以是传播致病物质的媒介。伊本·西那不但认识到钩虫病是由肠道寄生虫引起的，并能够做出准确的诊断。
他主张外科医生应该在早期阶段治疗恶性肿瘤，以确保对所有病变组织加以切除。伊本·西那在著作里强调膳食营养的重要意义，提出气候和环境与疾病有关的观点。
他研究过心脏瓣膜，发现主动脉有三个瓣膜，瓣膜的张开与关闭配合心脏的收缩与舒张，从而维持血液的流出与流入。
伊本·西那描述和记录了有关心脏病药物的提炼及皮肤病、性病、神经病（例如脑膜炎）与精神疾病等病症。他还能够将纵膈炎与胸膜炎相鉴别。
他也介绍了用烧灼治疯狗咬伤、针刺放血与竹筒灌肠以及音乐等疗法。
伊本·西那主张，在正式推广使用一种新药之前，首先应该进行动物与人体实验，从而保证药物的安全性。
公元10世纪的扎哈拉维（公元936～1013年）是出生在穆斯林治理下的西班牙的著名医学家，享有"外科学之父"的赞誉，其祖先来源于阿拉伯半岛的安萨尔部落。
扎哈拉维的《医学手册》是一部集其数十年医学知识与经验的著作，包括30篇的内容，涵盖大量临床问题，适用于执业医生与医学生。
这部著作附有历史上最早的外科器械插图与文字说明，而且数量相当丰富（200幅左右）。这些精致的插图（与文字说明）使其极具学术价值。
他还把外科治疗划分成几个部分，例如烧灼术、手术切除、放血疗法与接骨术。扎哈拉维不仅改进了一些器械，还发明了许多外科器械，例如一种引流腹腔积液的斜面套管，插入尿道治疗尿路结石的探头，以及一种用于切开脓肿的隐蔽式手术刀。
他还发明、引进了镊子、（羊）肠线以及今天妇产科医生使用的窥阴器与扩阴器等。在《医学手册》的第一与第二篇里，扎哈拉维归类了325种疾病，讨论了它们的症状与治疗，并且在第145页上首次描述了一种由"健康"母亲传递给儿子的出血性疾病，也就是现代医学所说的血友病。
在妇产科方面，扎哈拉维的著作包括指导训练助产士如何处理异常分娩，取出死胎与去除胎盘，以及剖腹产的实施方法等。
除了前述的一些医学专论之外，阿拉伯帝国的一些医学家还写作了很多关于特殊疾病及相关药物的著作。
例如侯奈因·伊本·易司哈格的儿子，易司哈格·伊本·侯奈因（公元？～910年）的介绍治疗健忘症药物的《健忘症治疗药物》、卡塔尼（公元951～1029年）的关于治疗体表疾病的《体表危险疾病的治疗》。
贾扎尔（公元895～980年）不仅专为旅行者写了一本介绍疾病、发热、有毒昆虫与动物叮咬，以及在没有医生的情况下如何治疗与处置此类病症的书籍，而且作为一名虔诚的穆斯林，他还非常热心于贫困人口的求医问药问题，《穷人医药》就是出自他的手笔。
此外，有一位犹太医生（1135～1204年）发表了一本介绍痔疮的小册子，一位11世纪的基督徒巴特兰还写了一本治疗修道士疾病的书籍。它们都是用阿拉伯语书写的。
在药物学方面，阿拉伯帝国的医生与药物学家做出了有益的尝试与大量的创新。
他们善于使用复方制剂，主药、佐药与替代药巧妙搭配，首先开始将樟脑、氯化氨与番泻叶等作为药物加以使用；在他们的处方里，还出现了来自中国、东南亚、喜马拉雅山脉以及非洲的药物；而糖浆、软膏、搽剂、油剂、乳剂或脂等剂型，以及丸药的金、银箔外衣则是他们首创的，甚至今天西方医学界使用的"Syrup"（糖浆）、"Soda"（苏打）等词汇，都是从阿拉伯语音译的。
当时的医学百科全书或综合性医学书籍都留有专门的章节介绍药物以及处方药物的搭配。这部分章节系统地讲解了药物与处方的构成成分与配制的程序和步骤。
伊本·贝塔尔（1188？～1248年）是中世纪最伟大的药用植物学家，他编写了两部医药学著作《药物学集成》与《医方汇编》，堪称经典之作，其中药物是根据它们的治疗作用进行编排的，而且除了阿拉伯语名称之外，还加上了希腊语和拉丁语名称，从而促进了医药学知识在欧洲的传播。《医方汇编》的拉丁语译本的若干部分，1758年还曾在意大利的克雷默那出版。