广州至澳门内河水道所经过的海关站已如上文所考，但是除粤海关总署和澳门总口以外，只涉及西炮台、紫坭、香山三个海关站，沿途还需要经过哪些地方不是十分清楚。所幸钦差大臣林则徐在道光十九年七月（1839年8—9月）曾与两广总督邓廷桢从广州前往澳门视察，其中初七、初八两日从广州南下至香山是取道水路，正是广州至澳门内河水道的香山县城以北路段，而林则徐在二十七、二十八两日从香山县北上赴虎门时，其中从香山至石壁间之水路大致也是走的这条内河水道的一部分。林则徐在日记中对其往返这条内河水道所经地点详有记载，其中某些地点为《中国丛报》所无，正可补缺，兹节录如下，以便讨论：
初七日，庚子（8月15日）。晴。早晨对客……申刻起程，与邓制军同赴香山，将军、都统、中丞、榷使俱送於天字码头，叙谈片刻，即开舟，司道以下送於凤凰冈。舟向南行……夜，长行未泊。
初八日，辛丑（8月16日）。晴。晨过紫泥，即沙湾（原注：有盐关），自省城到此七十余里。又过潭州、大小黄埔、横泾、广口，县、协皆来迓。戌（原文作“戍”，误）刻抵香山，登岸，住城内丰山书院。计自省城水路至香山二百一十里。
二十七日，庚申（9月4日）。寅刻行，黎明过平迳岭，巳刻至香山城，即登舟，行李皆在舟中，遂开行，赴虎门。未刻过横泾，计四十里。酉刻过大黄圃（原注：有墩台，村市大），则又三十里矣。上灯后过容奇头、潭州口，皆顺德所辖。又过乌珠，稍停复开。夜，长行，五鼓过紫泥。
二十八日，辛酉（9月5日）。晴。黎明过何滘，又过陈村，午过石壁，距省约三十五里。中丞遣弁来，府、县遣丁来。遂折而东，申过黄埔，见花旗国及琏国夷船六只泊此。又过鱼珠、乌涌。申酉之间，西风颇顺，闻由狮子洋行，比内河少行一百里，遂趁顺风放洋，舟不颠簸，黄昏收入斜西口，河势湾曲，晚潮已落，舟行仍缓。是夜四鼓甫抵虎门镇口。
从上述记载可知，道光十九年七月初七、初八两日从广州南下至香山，先后经过天字码头、凤凰冈、紫泥、潭州、小黄埔、大黄埔、横泾、广口、香山，涉及地名9个；二十七、二十八两日从香山北上至石壁，则先后经过香山城、横泾、大黄圃、容奇头、潭州口、乌珠、紫泥、何滘、陈村、石壁，涉及地名10个。初七、初八两日从广州南下至香山要比二十七、二十八两日从香山北上至石壁时航行的水路长，但所记地名反而少一些，有些地名也不十分准确，笔者推测除了夜行未泊以外，大概也与作者是第一次经过，不太熟悉沿途情况有一定关系。通计两次出行，在广州至香山的内河水道段实际上共涉及地名14个，由北而南分别是天字码头、凤凰冈、石壁、陈村、何滘、紫泥、乌珠、潭州（潭州口）、容奇头、小黄埔（圃）、大黄埔（圃）、横泾、广口和香山城，比前引《中国丛报》多了不少地名，兹分别考证如下：
天字码头：在广州城南永清门外苍前直街（今北京路南段）南口，位于五仙门外粤海关总巡口码头之东，为省城广州城南珠江水道（当时亦称省河或北河）上重要之码头，今仍如此。林、邓初七日赴香山，“将军、都统、中丞、榷使俱送於天字码头”，显然出于官场礼仪。
凤凰冈：今广州市海珠区凤凰冈一带，今其西北有广州港务局和洲头咀码头。清时凤凰冈码头当为由白鹅潭以南珠江南水道北口南下虎门、澳门等地之重要码头，林、邓初七日赴香山，“司道以下送於凤凰冈”，亦是出于官场礼仪。
石壁：今广州市番禺区境之石壁，陈村水道在西北呈西南—东北流向，通于三枝香水道。其地似在大黄滘水道南段（程鹏所绘的《沿海七省口岸险要图》之《广州口图上》作“马口溪”）与陈村水道北段（《广州口图上》作“哈密而登溪”）合流之处。林则徐二十八日北上时经此地东去虎门，初七日南下时的日记中未见，乃夜行未泊所致。
陈村：今佛山市顺德区北境之陈村，位于石壁之南，陈村水道在其东面大致呈西北—东南流向。林则徐初七日夜过之未记。
何滘：当在陈村之南，紫泥之北，近陈村水道。林则徐初七日夜过之未记。
紫泥：今广州市番禺区与佛山市顺德区交界处，市桥西南8公里的紫坭，清时设有粤海关挂号口，地属沙湾巡检司，林则徐谓“即沙湾”，当本于此。紫泥为广州至澳门内河水道所必经，但从紫泥由沙湾水道东出也可至虎门。林则徐初八晨过记之，二十七日夜过之亦记之，足见该地之重要。
乌珠：当即顺德县（今佛山市顺德区）北境之乌洲，旧属番禺县，同治十一年（1871）刻本《番禺县志》的《县境全图》上有标绘，宣统《番禺县志续志》也有记载，盖因林则徐不谙粤语读音而误记。其地位于紫泥之西南，两地隔潭州水道（顺德水道）相对。此地与紫泥近，林则徐初八日晨过之未记，但二十七日夜在此地曾短暂停泊，故见于日记。
潭州（潭州口）：潭州在程鹏所绘的《沿海七省口岸险要图》之《广州口图上》中有清晰标绘，位于顺德县东南，为略呈西北—东南向的窄长大沙洲，其上有潭州山，洲西南侧之水道称潭州水道（今亦称为顺德水道）。潭州口当指潭州水道（顺德水道）与容桂水道交汇处。林则徐两次经过皆记之，亦见此地之重要。
小黄埔：当即今顺德南境容奇镇东之小黄圃，位于容桂水道南侧。林则徐初八日过之有记，二十七日夜过之未记。将“圃”记作“埔”，或为误记之故。
容奇头：当即今顺德南境之容奇镇一带，位于顺德支流与容桂水道交汇处。《沿海七省口岸险要图》之《广州口图上》作“容基”，并标注有“砲台”。林则徐二十七日夜过之有记，初八日记中未记，或是直接从小黄圃南下未经此地。
大黄埔（圃）：在容奇之南，即今中山市北境黄圃镇一带。《沿海七省口岸险要图》之《广州口图上》标有“黄浦营盘”，当有驻军。今黄圃镇有港口，控扼黄圃水道。大黄埔（圃）容奇头和小黄埔（圃）似当有南北向支河直接相通，不必西经今南头或东凤一带。林则徐两次记之，亦知此地相当重要。但在其日记中，初八日记作“大黄埔”，二十七日记作“大黄圃”，亦显示出作为外地人的林则徐，对于香山地名的准确认知需要经过一定的过程。
横泾：当即今中山市阜沙镇政府南1.7公里处之横迳。据说1835年建村，因在横迳河东岸而得名。横迳河，因属南连小榄水道、北接阜沙涌的横向水道，故名。清时大黄埔（圃）与横沥似当有支河直接相通。林则徐亦两次记之，当亦是水道冲要之地。
广口：颇疑即今中山市北境之港口，亦林则徐不谙粤语读音而误记。今中山市港口镇区之港口，在石岐北7公里处，明宣德年间（1426—1435）形成聚落，清末发展成圩。因当时为石岐至广州必经的重要港口，故名。港口河北起港口咀浅水湖，南流，在石岐北面的沙咀一带注入石岐河。港口为从小榄水道转入港口河、石岐河而至香山县城必经之地，其地为香山县城北面之门户和重要的水道交通枢纽，故林、邓初八日赴香山至此地，香山“县、协皆来迓”。二十七日林则徐从香山北上必经之而未记，或行程匆匆所致。
香山城：在今中山市区。城西石岐河侧畔有港口（清代地方志中记作“县港”），粤海关在此设有石岐口，其地与广州城一样也有一个“天字码头”。城内有丰山书院，林则徐初八日以钦差大臣身份驻节香山县时即住在丰山书院。二十七日林则徐从此地登舟北上，日记中亦有记。