米格尔战争，又称两兄弟战争。葡萄牙王室成员米格尔接受其兄——巴西国王佩德罗一世颁布的议会宪章后，被任命为幼年女王玛丽亚二世的摄政王。但是，米格尔不久便背弃誓言。1828年5月，议会宣布米格尔为葡萄牙国王，从而导致了两兄弟战争。
葡萄牙殖民者被赶出巴西后，新独立的巴西处境非常艰难。当1823年巴西议会准备制定自由主义宪法时，佩德罗却宣布解散议会，称自己为佩德罗一世。1825年，葡萄牙国王若昂六世自称皇帝，承认巴西独立。1826年3月10日，若昂六世去世，佩德罗一世作为若昂六世的长子继承了葡萄牙王位，但葡萄牙人认为他既然已经是巴西的君主，就不应该做葡萄牙的国王。迫于压力，1826年5月28日，佩德罗一世将王位让给自己7岁的长女玛丽亚·达·格洛里亚，即玛丽亚二世，任命其弟米格尔为摄政王，并且要米格尔在玛利亚成年后娶她为妻。但是，米格尔不久便背弃誓言。1828年5月，听命于米格尔的议会，宣布米格尔为葡萄牙国王，称米格尔一世。正在从巴西前往葡萄牙途中的女王玛丽亚二世闻讯后转赴英格兰避难。
米格尔一世是一个专制主义者，自由党人在葡萄牙遭到镇压、处决或流亡，国内政治空气紧张。与此同时，佩德罗一世在巴西的统治也极不得民心，国内经济危机，人民普遍不满，加上1828年巴西在乌拉圭战争中失败，终于在1831年3月13日，爆发了里约热内卢居民和士兵联合举行的反专制主义示威，各地也纷纷起义。4月7日，里约热内卢安娜广场上爆发反佩德罗一世的暴动，佩德罗一世被迫将皇位让给儿子佩德罗二世，离开巴西，重回葡萄牙。
回到葡萄牙，已经不是巴西皇帝的佩德罗重新称为布拉干萨公爵佩德罗一世，并出访了英围和法国。由于弟弟米格尔一世篡夺了玛丽亚二世的王位，以及米格尔对自由党人的迫害，佩德罗开始组织领导自由党人反对米格尔。他来到了自由党的基地亚速尔群岛的特尔塞伊拉岛，组成了一支6500人的远征军，1832年7月在波尔图附近登陆，发起进攻。米格尔一世政府的军队仓皇防御，一片惊慌，边打边退。四天后，自由党人几乎没有流血就占领了波尔图，佩德罗自称葡萄牙摄政王。
在佩德罗的军队攻占波尔图后，米格尔的军队反攻，将佩德罗围困在波尔图。长达一年之久的围攻未果。1833年7月，米格尔的海军在圣文森特角被内皮尔率领的舰队打败，里斯本落入立宪主义者手中。因米格尔在科英布拉附近的基地窝藏专制主义分子、两班牙王位觊觎者卡洛斯，导致了西班牙入侵科英布拉，并抓获卡洛斯，促使英、法、西、葡等国结成维护立宪主义的神圣同盟。在西班牙的帮助下，葡萄牙立宪主义者的军队攻占维塞乌、科英布拉和托马尔。1834年5月，米格尔的军队在圣塔伦战役中被佩德罗的军队打败，米格尔在埃武拉蒙特宣布投降，放弃王位继承权，退隐德国，由米格尔背弃誓言导致的战争遂告结束。
同年，玛丽亚二世宣布成年，加冕为葡萄牙女王，佩德罗继任葡萄牙摄政王。玛丽亚二世亲政之后，吸取了米格尔时期的教训，提出了多项改革方案，如在海外殖民地逐步废除奴隶制度；鼓励农民和农场主；重新在殖民者之间分配土地；设立海外传教学校等，重振葡萄牙辉煌。