——刘裕对刘毅翻脸不认人是不对的，但是对诸葛长民这种不为民做事的人就做对了。这是帝王的缺点，时好时坏，让天下不安定的起因。
刘裕未称帝前为清除异己、伺机自立，想发兵征讨刘毅。
刘毅当时为荆州刺史，与刘裕同举义旗，兴复晋室。他功劳很大，与刘裕在伯仲之间，而且行事谨慎，宽以待人，受到众多朝臣的拥戴。
平时，朝事虽处处首推刘裕，但刘毅心中早已不服刘裕。
刘裕深知刘毅心怀雄才大略，是个不肯居人之下的人，怕长久下去，终生异端，故而想找机会将他杀掉。
同年九月，刘裕以谋乱为名，发兵征讨刘毅。
当时，豫州刺史诸葛长民被留在京城主持政事。
十月，王镇恶领兵攻下江陵，刘毅被杀。
公元413年2月，刘裕从江陵动身返回建康（今南京）。
当初，诸葛长民曾因荒淫骄横，遭到吏民的痛恨，刘裕念他与自己同举义旗，没有加以深究。
及闻刘毅被杀，诸葛长民对刘裕诛杀异己感到不满，对左右亲信说：“往年杀彭越，今年诛韩信，灾祸将来了！”这句借刘邦的讽语，不知被何人密告给了刘裕，刘裕因怕诸葛长民日后生乱，决定设计将他也除掉。
朝中众臣听说刘裕已从江陵返回京都，计算出该到之日纷纷前往新亭迎接他。诸葛长民也随众前往。
但等候了一日，也不见刘裕踪影。
其实，刘裕早已乘轻舟返回了京邑。
他心知，诸葛长民听到他回来的消息后必然前来拜访，于是令丁旰等十几名壮士隐于府内幔帐之后，准备随时出来击杀诸葛长民。
果然，诸葛长民听说刘裕已返回京邑后，赶忙前来拜访。
刘裕将他迎入府后，退去侍从，和他闲谈起来。
正当诸葛长民高兴之时，刘裕一声大喝，丁旰等突然从帐后奔出，将诸葛长民掀翻在地，拳打脚踢，不一刻诸葛长民便吐血而亡。刘裕见诸葛长民已死，立即命侍从将其尸体送交廷尉，并下令将长民的弟弟处死。
至此，在诛杀了刘毅后，刘裕又清除了一个棘手的对头，为他称帝进一步扫清了道路。
“攻其不备”是智者常用的策略，刘裕故意不在约定时间到达是因为他知道诸葛长民必会来找他。如果当时就拿下他，他很可能跑掉，倒不如先稳住他，谈些今古往来的琐碎小事，待他坐稳了板凳，腿松脚软，再宰他也不迟。