听完陈渠珍的入藏历险经历，田应诏既感惊奇同情又十分器重。他当即劝慰陈渠珍道：“玉鍪，你大难不死必有后福！孟子云‘天将降大任于斯人也，必先苦其心志，劳其筋骨，饿其体肤，空乏其身，行拂乱其所为，所以动心忍性，增益其所不能。’你既经过了这么多大苦大难，我看今后必会大有出息和作为！”
“多谢军门夸赞！军门若有所用，虽肝脑涂地，我亦在所不辞！”
“好吧，我现在就任命你为中校参谋！”田应诏道，“我所辖部队现在还是清朝绿营旧制，战斗力很差，我想照北洋军武备学堂训练办法先办一个军官团，把带兵者先培训好，为提高部队战斗力打好基础。你就担任军事教官吧！”
“是！我一定不负军门期望！”陈渠珍郑重接受了任务。
经过一番筹备，湘西军官团很快就在凤凰城皇殿办起来了，参加的学员有排长以上110多人。田应诏任命中营游击滕代春当了军官团的团长，陈渠珍、赵开忠、熊子候、尹锋等人为军事教官。其中比较出名的学员有戴季韬、陈斗南、顾家齐、谭自平、田杰时、田景福等人，他们大都是凤凰人。
在军事教官的授课中，学员们对陈渠珍的讲课最感兴趣。陈渠珍在长沙武备学堂学习时，本来成绩就很出众，加上近几年来的传奇阅历，见多识广，讲起课来生动传神，学员们都听得津津有味。有一次陈渠珍在讲课时说：“诸葛武侯有言：‘区区于笔砚之间，数黑论黄，舞文弄墨，寻章摘句，世之腐儒，何能兴邦立世。’我在沅水经校学堂当学生时就觉得，士生千古之下，而处斯世，遇斯事，岂宜区区于文字之间而已耶，……我国甲午之役，丧师赔款，全国震惊。余闻之，十分愤慨，认为国家兴亡，青年有责，爱国之心，油然而起。庚子之变，盛倡瓜分中国之议，我更痛心国事，遂决心投笔从戎。诸位学员不知是否有同感，你们投身军营，难道不也是想为报效祖国而有所作为吗？现在辛亥革命虽然已取得胜利，但时局仍很动荡，全国各地群雄并起，鹿死谁手，尚未可知，我们湘西欲求辖地之安全，就要坚固自己的军队，你们现在都已是带兵者，带兵者最要具备的本领就是有勇有谋。”
此时，学员顾家齐举手问道：“请问教官，怎样才算有勇有谋？”
陈渠珍随即答道：“勇者，有匹夫之勇和豪杰之勇的区分。苏东坡《留侯论》云：‘古之所谓豪杰之土，必有过人之节，人情有所不能忍者，匹夫见辱，拔剑而起，挺身而斗，此不足为勇也。天下有大勇者，猝然临之而不惊，无故加之而不怒。此其所挟持者甚大，而其志甚远也。’可见，一个军人，特别是一个带兵的军官，光具备匹夫之勇是微不足道的，最重要的还要看是否有大勇，即豪杰之勇。有豪杰之勇者必有大志，有大志者还需有大谋，只有有勇有谋者才是为将之道。故而兵法上曰将在谋而不在勇，兵在精而不在多，当然兵既精且多，将既谋且勇，那就更好了！”
这一番课有理有据，讲得头头是道，学员们听了茅塞顿开。课后有学员就议论陈教官的课讲得好，有水平。可是军官团团长滕代春听了这些议论却泼冷水道：“陈教官会讲什么课？他只不过耍嘴皮子而已！”这话传到陈渠珍耳里，他心里感到很生气，但一时忍住也没与滕计较。
时光如梭，转瞬即逝。不觉间一年过去，陈渠珍正全力帮田应诏训练军事骨干之时，有一天上午，田应诏将他叫进密室相告道：
“玉鍪，我接到袁总统从北京来的一份电令，他说你谋杀了罗长炜。命我将你逮捕解京！我看你赶紧逃避一下，到时我就说无法缉拿了事，你看如何？”田应诏说毕，就将密电让陈渠珍看了一下。陈渠珍万没想到此事又要吃官司，他想了想便郑重说：“军门对我信任有加，我将没齿不忘。不过这件案情实属冤案，罗长炜根本就不是我谋害，我想我是没有必要逃避的！”说罢，就将罗长炜前后的死因又详细向田应诏说了一遍。
田应诏听毕又道：“你虽然是属冤屈，但现在有人控告，袁总统又下令捉拿你，你若不逃避，岂不会解去枉送性命？”
“你放心，俗言有理走遍天下，无理寸步难行。我确实没做这桩亏心事，又怕什么鬼敲门呢！”陈渠珍坦诚地分析说，“我若真逃避，岂不弄假成真？反使无罪变有罪，而且不仅自己受害，还会连累军门，所以我不必逃避，你就按电令将我解送京城，到时我一定会把真相讲清！”
田应诏听陈渠珍讲得很合情理，于是只好吩咐人将陈渠珍逮捕，押送进京，一面又写了两封信暗里送去，一封给国务总理熊希龄，一封给高等军事裁判长傅良佐，请求二人为陈渠珍多加斡旋。
熊希龄接到田应诏信后，立刻给傅良佐又写信，让他在审判时务必澄清真相，找到真正杀罗凶犯。傅良佐亦是湘西乾城人，又是熊希龄的学生，此时见熊希龄和田应诏都来信为陈渠珍说话，他自己亦很顾念乡情，于是对此案审理得格外认真。
陈渠珍被解送到京后，被关在陆军监狱。几天后，军事裁判处进行庭讯，傅良佐亲自进行庭审。
傅良佐问：“请问原告，你是怎么知道你父亲是陈渠珍和钟颖谋杀的？”
原告罗青山即回道：“我是听周逊说的。周去年春上到过我家，把我父亲的骨灰带了回来，他说我父亲是被陈渠珍谋杀的。后来驻藏大臣联豫回到北京，我去问过他，联豫又说我父是钟颖谋杀的，我就认定钟颖和陈渠珍都是谋杀我父亲的凶手，请法官明察！”
傅良佐又传周逊出庭对证，并问周逊告陈渠珍谋杀罗长炜有何证据，周逊原有些理亏，他在甘肃诬告陈渠珍没有得逞，内心仍然不服，才跑到京城来鼓动罗的儿子告状的。这时他来到庭上，便又咬定说：“罗长炜是陈渠珍指使杀的，因为那几个行凶的士兵都是他手下的人。”
傅良佐再传联豫出庭作证，并问他：“有何证据钟颖杀了罗长炜？”
联豫道：“罗长炜是我驻藏时的军务大臣，我派他任协统一职，调钟颖任参务大臣，钟颖对此不满，拒不到任，还公然率兵抢了运藏饷银，后来又进兵拉萨逼我解了职。我回京把此事向袁大总统作了汇报，袁大总统才下令查实此事。后来钟颖又指认此事是陈渠珍干的，说凶手赵本立是陈部的司务长，所以袁大总统断定陈渠珍是杀罗长炜的主犯，为此才电令缉拿陈渠珍。这事到底谁是杀罗的主犯，依我看钟颖可能性更大一些。”
傅良佐遂又问道：“被告陈渠珍，你对此案有何辩说？”
陈渠珍于是讲述了罗长炜之死的前后详情，最后分析说：“罗协参赞开始取代钟颖任协统时，钟协统就很不满，他曾在德莫山下对众军官说，罗长炜是乘我之危，多方谋划，取我代之，悔不该认贼作友。钟协统既恨罗长炜，又恨联豫大臣。他不肯返藏，留在乌苏江观变，并纵兵劫夺联帅运藏饷银，又招变兵，据拉萨。罗参赞听信周春林密报，策划暗杀了十多名川籍官兵。兵变发生后，罗参赞去昌都，我劝他从东路走他不听，偏要从西路走，他带的随从又少，以至途中与变兵相遇，被哥老会士兵陈英、赵本立用绳索捆在马尾上活活拖死。这就是事情真相。至于我和罗长炜，平日关系一直友好，我对他可说是解衣推食，患难与共，这是有目共睹的，许多人可以作证。”