（二）打击病原体的模式
前面我们已经讲到，西医好比是警察，寻找病灶就像是追查罪犯的身份，以及追查罪犯的窝藏地点。诊断就是这个追查的过程。在此基础上，已经查清了罪犯身份（比如痢疾杆菌），并且知道了他窝藏在什么地方（比如肠道），接下来就是对罪犯实施打击。仍以痢疾杆菌为例，打击的位置就在肠道，所使用的武器就是抗痢疾杆菌的抗生素。打击病原体，是西医治疗的核心，也是最基本的模式。
虽然有些疾病看起来没有病原体需要打击，比如缺碘引起的甲状腺肿。但其思路与打击病原体是一致的。缺碘，于是补充碘质。这种点对点的对应在传统医学（尤其是传统内科）当中几乎不存在。传统医学基本上都是笼统地对人体进行调整，往往判断患者的病情就是整体偏寒还是偏热了，等等。即使进一步细分，也是笼统的人体组织，而在治疗方面，更不可能准确到特定物质的缺乏或过量。但是现代医学在通常情况下，则必须准确到单一物质列表，才能够有效实施治疗。缺碘就是缺碘，缺锌就是缺锌，如果检查结果含混笼统，往往意味着医师将束手无策。
另一方面，在准确清晰的检查结果的基础上，医师能否对病原体实施有效打击，还取决于医师是否掌握相对应的药物。比如葡萄球菌引起的肺炎，在第二次世界大战期间发明出医用青霉素之前，医师只能望洋兴叹。抗生素的发明，对于西医治疗学是划时代的进步。有人曾用玩笑的方式描述：“所谓医师，就是在绝大部分时间里把抗生素卖给你的那个人。如果没有抗生素，大概他所能做的就只有告诉你，你将怎样完蛋罢了。”时至今日，抗生素种类已经数不胜数，分类也是越来越细，针对性越来越强。比如支原体感染的肺炎，使用青霉素就无法获得疗效了，这种情况下就要改用大环内酯类抗生素，如阿奇霉素。这就是点对点的打击模式，不同的抗生素打击不同的细菌，不同的免疫制剂打击不同的病毒，不同的微量元素对应不同的功能失调。
如果病原体已经查清，但对应的抗病药物还没有研发出来，医师则往往无可奈何。比如每年几度的流行感冒，还有非典型性肺炎、获得性免疫缺陷综合征（艾滋病）等多数病毒感染的疾病，因为西医目前没有足够的有效抗病毒药物，所以面对这些疾病，医师通常只能开处抗生素以预防合并细菌感染，有能力的再加一些抑制症状的药物（如感冒期间抑制流鼻涕的药物），同时做些生活起居方面的建议。对于核心的致病病原体，虽有所知也无可奈何。
所以，当西医治疗进程不如通常顺利的时候，我们应当意识到，有3个方面可能出现了错误，其一是误诊病灶，比如不是肠道问题却被诊断为肠道疾病；其二是误诊病原体，比如支原体肺炎误诊为细菌肺炎；其三是医师没有有效的抗病药物，比如某些病毒感染。这种时候，患者可以询问主管医师，是否存在这3个方面问题。另外，在这种时候可以考虑尝试其他医疗与西医结合使用。
三、中医的诊疗模式