这且不说。在其离开杭州之际，武昌起义已经爆发，长江各省纷纷响应。他看到各地响应革命的多为新编陆军，一到伊犁，即采取断然措施：一面转移军械弹药库，调动满旗、绿营兵加强惠远城防；一面强行解散杨缵绪的混成协，迫令杨缵绪请假入关。而且，对遣散的官兵又迟迟不发放回家盘费，还勒令他们在遣散回家之前将所有皮衣皮裤全部交库。时值隆冬天气，逼迫新军脱下皮衣皮裤，这无异于将他们逼上梁山，弄得怨声载道，沸反盈天。志锐倒行逆施的结果，迫使冻馁交加、走投无路的新军官兵集体加入了同盟会。
针对这种形势，革命党人立即组织了领导武装起义的指挥机关，推举李辅黄为总指挥。定于1912年1月12日起义，后因谣言蜂起，又提前到1月7日。
1月7日，寒风呼啸，夜幕刚刚淹没军营，由69名骨干分子组成的铁血团，在惠远城南门外炮营秘密集会。邓瑜的身体虽然刚刚复原，但一接到通知，就按捺不住满腔兴奋，精神抖擞地提前来到会场。
会场上空气十分紧张。冯特民、李辅黄、郝可权扼要分析了一下形势之后，就决定当晚十二时举行起义。可是，正当大家瞪着一双双激动的眼睛，听取具体战斗部署的时候，担任警戒的同志突然进来报告：有两名锡伯族士兵，从水沟内逃走。
听到这意外的消息，总指挥李辅黄镇定自若地掏出怀表看了看，斩钉截铁，当机立断，发布了提前起义的命令：
“同志们：先下手为强！李辅黄、李梦彪、邓瑜负责攻打东门，并与南库黄立中接应夺取弹药，然后入城策应；冯特民、郝可权、马凌霄负责攻打将军署和北库。冯大树去秘密照会俄国领事馆，让其严守中立。现在，还有47分钟，分头行动。九时整，我鸣枪为号，举行起义！”
邓瑜听到自己的任务，手提五响马枪，带了仅有的五粒子弹，立刻紧随李辅黄，率部向惠远城东关扑去。
此时，志锐已得到这晚十二时革命党人将举行起义的秘密。一面慌忙调动满蒙各营入城守卫，一面急令部下务必在十二时之前攻占杨缵绪的协统署。就在这千钧一发之际，革命党人终于抢先一步，发动了震撼中外的伊犁起义。
九时整，一声清脆的枪响划破了边陲漆黑而死寂的夜空。李辅黄、邓瑜一路，首先攻占了东关，打开了东门，夺得了南库的枪支弹药。接着，冯特民、郝可权一路也很快攻下了将军署，并从隔壁的协领衙门大堂东夹道内，搜捕到了越墙而逃的志锐。连战皆捷，群情振奋，士气十分旺盛。
但是，被新满营盘踞的北库，凭借新式武器的火力和武备学堂学生的支援，在正蓝旗协领蒙库泰的指挥下拼死顽抗，久攻不下。
李辅黄下令放开东门，给响应革命的各族人民发放了武器，也组织他们参加战斗。同时，派邓瑜、李梦彪也去协同转攻北库。一场恶战打得十分激烈，眼看东方就要透亮，仍然不分胜负。怎么办？如再拖长时间，驻绥定的绿营防军必会前来增援，起义军就有遭到内外夹击的危险！
面对紧迫形势，革命党人立即开会商量，决定利用广福和志锐的矛盾，由杨缵绪亲自去邀请广福出面调停。由于广福与蒙库泰同为蒙古族人，素日关系亲密，再加听到志锐已被活捉，大势已去，经广福劝告，新满营即放下武器，交出了北库。至此，伊犁起义宣告胜利。
1月8日上午，将志锐拖到钟楼前枪决之后，以广福、杨缵绪的名义在商务会召开成立了一个“五族共和会”，组成了伊犁f临时政府。广福任都督，杨缵绪任总司令部部长，贺家栋（原伊犁知府）任参谋部部长，冯特民任外交部部长……李辅黄任前敌总指挥，徐国桢为东进支队司令，建立了一个由革命党、旧官僚、旧军人三结合的奇特的革命政权。
伊犁临时政府一成立，一面电促新疆巡抚袁大化赞助共和，宣布独立；一面募集各族人民，编练军队，准备东进。袁大化十分骄横，当即复电伊犁，要兵戎相见，派兵严守通往伊犁的要隘果子沟口，命令协统王佩兰率部向伊犁杀来。
大敌当前，李辅黄、徐国桢率部迎敌，双方在精河县西部的五台地区接火。起义军士气十分旺盛，打得清军节节败退，由五台退往精河，再退至沙泉子，又退到乌苏县附近的固尔图。但正在这大好时机，起义军骑兵团长钱广汉这个长庚的旧部，却秘密投敌叛变，致使李辅黄受骗上当被清军包围，几乎全军覆没！战略要地沙泉子又被清军占领。
消息传到伊犁，人心大为震惊。经过激烈辩论，决定由杨缵绪率部火速增援。邓瑜奉命随杨缵绪出发。部队星夜驰骋，赶到精河，收集东进支队突围溃散之残部，兵分三路，组织反攻，邓瑜担任右翼的攻击。双方在精河与沙泉子之间，展开了一场殊死决战。
二月的新疆，冰天雪地。沙泉子地势空旷，遍地流沙，除了一道道绵延起伏的沙丘，无险可守。清军依仗自己兵多势众，轮番猛扑，炮火轰鸣，子弹呼啸，马刀飞旋，卷起漫天烟尘。起义军右翼指挥官中弹阵亡，军心动摇，形势十分危急。正当部分士兵准备向后撤退之际，忽然一声大喊，18岁的邓瑜从一道沙梁上挺身跃起，挥手叫道：
“同志们！千万不能退啊！我们一退，全线就会崩溃，后果不堪设想……来，听我的指挥，坚守阵地！”
士兵们见有人出面接替指挥，顿时镇定下来。邓瑜组织大家，避实就虚，节省子弹，互相鼓舞，竭力苦战，坚守了整整一夜一天。在战斗的间隙里，他叮嘱大家抓紧时间休整，自己却一直爬在战壕边在望远镜里目不转睛地监视着敌人，分析判断着不断变化的敌情。直到第二天暮色苍茫，杨缵绪亲赴第一线督队，沙丘间摆满了清军的尸体，阵地还在起义军手中。
杨缵绪一见满脸烟尘血迹、嘴唇干裂、两眼熬红的邓瑜，大加表彰。邓瑜却淡淡一笑，当即提出了一条建议：
“司令！敌人左翼后路防守不严，如果派一支轻骑绕道抄敌后路，也许能转危为安。”
杨缵绪一听有理，接过望远镜看看，立刻派邓瑜率领一骑敢死队，包裹马蹄，衔枚疾驰，乘着夜色掩护，绕道去向清军左翼后方进行偷袭。
此时，清军指挥官王佩兰，正坐在指挥车里，跟几个幕僚一边饮酒御寒，一边等待前线报捷。原来，他以为起义军刚刚受到重创，在精河兵力不足，缺乏足够的进攻能力，因此并未将这次战斗放在眼里。看看前线，虽然激战一夜一天相持不下，但总认为自己兵多将广，稳操胜券。可是，酒喝到半夜，目眩头晕，天色昏黑，突然一阵兵刃相击之声响起。王佩兰的卫士猝不及防，邓瑜的敢死队已冲到指挥车前！
王佩兰狼狈逃窜，清军大乱，人马自相践踏，全线溃败。起义军一鼓作气，乘胜追击，收复了沙泉子和固尔图，直逼乌苏城下。
起义军总司令部对邓瑜的胆识谋略十分赞赏，当即以战功擢升为参谋。
此后，起义军与清军在乌苏对峙相持，清朝末代皇帝宣统退位。袁世凯爬上大总统宝座，电令袁大化改称都督，与伊犁临时政府停战议和。后来，杨增新继袁大化接任新疆都督，威逼利诱，软硬兼施，封官许愿，分化瓦解，迫使伊犁革命党人一再妥协退让，最后达成了由杨增新主持全疆军政，取消伊犁临时政府的协议。一场轰轰烈烈的伊犁革命烈火，终于被彻底扑灭！
和议告成后，杨缵绪调任喀什提督，冯特民、李辅黄、郝可权、李梦彪也都得到一个挂名职务，留在伊犁。邓瑜要求深造，被保送到将弁学堂去学习。1913年，当袁世凯撕下伪装对革命党人大肆屠杀的时候，阴险毒辣的野心家杨增新，在新疆也开始了疯狂的暗杀活动。他首先密派刺客潜入伊犁，伙同貌似忠厚、与世无争的广福，收买了起义军叛徒——绰号马大鼻子的马得元，将冯特民和李辅黄暗杀于惠远。接着，按事先拟好的一个长长的黑名单下令通缉，伸出一只只黑手，猛扑过来。19岁的邓瑜，也排在敌人这本变天账的前头几名。
那是1913年夏初，正在将弁学堂学习的邓瑜，突然收到郝可权逃走之前留给他的密信，要他火速离开伊犁。邓瑜收到此信，没有忍心去向阿娜尔道别，只匆匆去看望了一下正在患病的老师——那位正直博学的绍兴师爷，就忙找崔营副来商量对策。
半夜，邓瑜敲开崔营副的门，不料，老汉跟几个年轻军官正在喝酒。这些人邓瑜全熟识，平时也喜欢在一起喝两杯。一见邓瑜进来，自然抓住不放，非叫喝个痛快不可。邓瑜有事在身，哪敢喝酒？可崔营副不由分说，拉住硬灌，还边灌边骂，边骂边哭了起来：
“喝吧！老弟，你我一同出关，我就看中你的为人……喝了今儿，还不知有没有明儿呢……杨增新，狗杂种……69名铁血男儿，冯特民，李辅黄，委身荒烟野草，呜呜呜……”
老汉一哭，大家都陪着落泪。为了借酒浇愁，又是一阵狂饮。
邓瑜怕老汉过分伤心，一醉不起，忙扶他去休息。崔营副两眼血红，拍着裸露的圆鼓鼓的大肚皮，还连呼未醉。邓瑜扶他上床，去盖被子，不料自己已立脚不稳，竟一屁股坐到了崔营副肚子上，将老汉压得嘴里冒出血来！
在场的人，皆大惊失色。邓瑜吓出一身冷汗，也才想起自己来找崔营副的目的。趁大家抢救老汉之机，慌忙溜了出来。想想在绥定还有几个可靠的朋友，便只身连夜向那里逃去。
逃到绥定，找到一位哥老会的经商的朋友。那朋友花钱去俄国领事馆弄了张去俄国做生意的护照，将邓瑜化装成一名年轻的富商，送给一匹骏马，让其经霍尔各斯去出国逃亡。
万里无云，骄阳似火，晒得路上的石子儿滚烫。邓瑜骑着马，不时回头望望越来越远的银冠闪亮的乌孙山，想想在西域屡建奇功的张骞、段会宗，不胜惆怅地走着。伊犁起义之前，他一度心情很矛盾，曾打算听从姐姐的劝告，积攒起几个钱后，回乡去务农。可是，那场大病，不仅花光了他的全部积蓄，还使他负债累累。而且，不只是经济上负了债，在感情上也负了债。聪明、善良、豪爽而调皮的阿娜尔，给了他多么巨大的鼓舞啊！这个冰清玉洁的姑娘，使他深深地感到人生竟是那么可爱！如果不干出一番惊天动地的事业来，也实在愧为一个堂堂男子。因此，当伊犁革命的烈火终于熊熊燃起的时候，他像一块干柴一样把自己毫无保留地奉献给了它。但是，谁会想到，一场壮丽的事业，转瞬会成为过眼烟云，只剩下一堆灰烬呢？前途茫茫，流亡异国，何时才能替那些惨遭杀害的忠魂报仇雪恨啊！……
邓瑜边走边想，想到阿娜尔，不禁痛苦地闭上了眼睛。为了支援革命，他亲眼看见玉山巴依在自己的制革厂里，给起义军无偿地制作了大批马靴。阿娜尔的哥哥，甚至还扛着起义军配发的枪支，去参加过攻打北库的战斗。但是，对于他这个非穆斯林男子和阿娜尔的接触，玉山巴依跟阿娜尔的哥哥，却显然很不高兴。为了不使姑娘伤心，自从上了将弁学堂之后，他就跟阿娜尔有意地疏远了起来……
太阳快要沉没到异国的地平线下去了，前边不远处就是边境小镇霍尔各斯。邓瑜知道，在那太阳将要西沉的巴尔喀什湖以东以南的大片地方，早先也是中国的土地。只是由于清朝的腐败和无能，才变成了沙皇的领土。想到近百年屈辱的历史，他感到口干舌燥，跳下马来，在一条清澈见底的小溪边，跟马儿一起贪馋地痛饮着祖国的流水。忽然，一阵急骤的马蹄声从身后传来，警觉的邓瑜刚从溪边站起，一条飞舞的马鞭就轻轻落到了他的背上——
“哈！看你跑向哪里？”
一串尖脆的笑声，随鞭而落。邓瑜不用回头，就知道是谁！
阿娜尔，穿着节日盛装，梳着十几条发辫，耳环手镯丁当的阿娜尔，不仅用维吾尔族姑娘特有的方式表白了自己勇敢的选择，而且，眉毛一扬，挑战似的，也掏出了一张去俄国的经商护照……
注：
①哥老会：清末民间秘密团体，又称哥弟会，称首领为大爷，互称“袍哥”。初以“反清复明”为宗旨，辛亥革命后，往往为反动势力利用。
②引自曾问吾《中国经营西域史》第485页。
③米尔札：维语文书、司书之意。