1949年10月，四十七团与起义部队合编后，重要档案文件均由机关部门保管，这项工作做得较好，保存下来许多珍贵的资料。如1949年部队整编花名册、干部花名册、党团员花名册、独立三团花名册。1950年进疆后，参加剿匪战斗总结、生产建设总结及各种报表。部队生产分红花名册保管齐全。1950年，中共四十七团首届党员代表大会全套文件，党代会全体代表合影照片。
1964年建立档案室，设专人管理文书档案，初步建立收发登记签名制度。1965年根据哈管处指示，开展保密“三查”（查文件、查制度、查保密）工作。为把保密“三查”工作搞彻底，是年11月24日场长李官牛对机关和场直、事业单位进行动员教育，党委还责成张明鉴于12月27日召开连队干部和机关干部会议，进一步进行宣传教育，并集中人力2天结束清查文件工作。1966年1月，成立了保密委员会，由李官牛、徐向文、刘成铭、张明鉴、陈国文5人组成，陈国文任保密委员会主任。下设“三查”办公室，并从各单位抽调出身好、历史清楚、政治可靠、能自觉遵守保密纪律的党团员8人，负责保密“三查”具体业务工作。从1965年11月24日至1966年1月3日，历时68天时间，清出各类文件31895份，其中党内文件2816份，行政文件26917份；各种刊物2090份，工作笔记36本，收回了大量的分散文件和资料。
从1966年1月起逐步建立健全保密制度，专设保密档案室，规定文件必须由档案室一个口子收发的制度，并制定了文件收发、印制、借阅制度。
随着农场建设的发展，各行各业项目不断增加，档案资料逐渐繁多，同时保密档案设备也不断得到更新，逐步走向正规化、条理化、秩序化、制度化。1997年，农场设机要室。1998年3月正式成立机要科，由行政办公室副主任金巍兼管机要档案工作，廖陆赛专职负责管理机要档案，杜庆霭专职负责管理组织档案。同时成立了机要保密工作领导小组，场长兼党委书记赵木森任组长，党委常委副场长朱广超担任副组长，成员有安长永、廖陆赛。2001年，机要保密工作领导小组成员变动，党委书记朱广超任组长，成员有刘兆云、杜庆霭。