有一种传统的观念，认为稻米有两种基本亚种，一种是籼稻，被称为印度稻；另一种是粳稻，被称为日本稻。另有一种非洲稻，那是籼、粳齐全的。一提到水稻，人们就会想到这三地是其发源地。
是这样吗？历史是无情的，也是最雄辩的，多多少少的地下发掘资料证明了，水稻发源于中国，至少中国是水稻的发源地之一。
较早时，人们认为华南地区是我国稻谷的发祥地。在广东省曲江县著名的石峡遗址中，发现了为数相当可观的稻作农业遗存。石峡下文化层中有些火烧过的草拌泥（墙壁涂料）中，或灶坑边烧过的硬土块中，都有许多稻壳和稻草碎屑。有的灰坑中还发现有零星的炭化稻米。有九座墓葬中随葬品中有稻谷或稻米，发现时已与泥土凝结在一起成为团块。根据鉴定，这些稻谷和稻米均属于栽培稻，包括籼稻和粳稻两种亚种，而两种中又以籼稻为主。鉴于许多籽粒不够充实饱满，且大小不一，反映当时品种不纯，种植技术也还比较原始。
据此，相当一段时期，人们普遍认为岭南的两广地区是水稻发源地，长江流域的水稻品种和水稻种植技术是从岭南传播过去的。
华南大部分地区处于北回归线以南，气候炎热，几乎全年无冬，雨量充足，天然食物资料十分丰富。当时野生的稻类植物可能到处都有，人们完全可能通过采集走向种植，事实上也已经走向种植。但令人疑惑不解的是，在那里，其他可口的食物，包括水果，漫山遍野都是，华南人为什么偏偏会偏爱于水稻？要知道，培植水稻比起采撷果品和种植果树来，要困难得多。就是说，作为远古时代的华南人来说，没有迫切必要发展稻作农业。偶尔或少量种植一些，是可能的。石峡遗址的先民就可能是在这样的情况下试着种植的。
这当然只是一种揣测，但这种揣测被后来大量的长江流域的地下发掘证实了。
浙江余姚的河姆渡文化遗址发掘使人惊讶，在其第四层4000余平方米的范围内，普遍存在着稻谷、稻壳、稻草的堆积，最厚处有1米以上，经过换算，稻谷总量高达120吨以上。稻谷经鉴定，属于栽培稻籼亚型种中晚稻型水稻。这证明，在公元前五六千年，在这块土地上的先民已经学会了大量种植水稻。
后又在长江流域发现了新石器中期的城背溪文化和彭头山文华。