第三，狠抓《全民所有制工业企业转换经营机制条例》的贯彻实施，促使政府部门转变职能，全面落实企业应有的经营自主权。政府部门要按照《条例》要求，当开明“婆婆”，主动还权于企业。计划部门应把主要精力从过去的分钱、分物、审批投资立项，转为研究分析经济形势、市场动向和经济比例关系，研究制订和协调经济政策。要进一步缩小指令性计划，从计划思想、计划内容、计划形式和计划方法等方面都来一个根本转变，要把投资决策权交给企业，让企业成为投资体。企业主管部门或主管公司要把经营管理职能交给企业，取消主管部门和企业之间的“行政隶属”关系，并相应撤、并和调整管理机构，缩减管理人员。改革的去向是把一部分企业主管部门转为行业管理部门，有的可以改造为企业性大公司，有的也可以改造为国有资产经营公司。外贸部门应按照工贸结合的方向，更多地赋予有条件的生产企业外贸自主权。劳动部门在企业内部的劳动用工、工资、奖金分配等方面，应让企业自行决定。组织人事部门不应过多地干预企业的机构设置、人事安排，要逐步取消企业行政级别化和厂长“官员化”管理。工商管理部门应按照“规范、优质、高效”原则，简化企业登记注册程序和手续，改变以往把行政审批和登记注册一揽子包办、手续繁多、程序复杂的做法。今后，除国家指定专营、专控和专利项目外，企业有权选择自己的经营方向和经营范围。同时，企业要敢于和善于运用《条例》提供的法律武器维护自己的合法权益，培养竞争意识，提高竞争能力，积极主动走向国际国内市场。
第四，成立政府职能转变的监督机构，建立规范政府间接管理企业行为的法律规章和约束机制。要想切实有效地实行政企分开，转变政府职能，成立这样的监督机构和建立这样的法律约束机构是完全必要的。这种监督部门是在全国人大下面设置独立于政府的，其任务主要是按照经济法规和市场经济规律，目前主要是根据《条例》，督促政府部门转变职能，依法还权，保护企业自主权的顺利实施和不受任何外来势力的随意瓜分，制止行政机关对企业采取不必要的升级、评比、检查和向企业摊派人力、物力、财力。同时，制订有关规范政府部门宏观管理经济职能的法规，给政府部门建立必要的责任机制和约束机制，一旦在某个部门或某个人随意干预企业，给企业造成不应有的损失时承担经济责任和法律责任，以便保证企业充分享有经营自主权，让企业顺利进入市场，不断提高竞争能力，不断增强企业活力。
如何推进行政管理体制改革
市场经济是法制经济。在社会主义市场经济条件下，政府的经济管理行为必须依法行政。这也是党中央、国务院依法治国的基本要求。然而，依法行什么政？或者说政府应该做什么，不该做什么？这已经成为一个必须回答和尽快解决的问题。
改革开放20多年来，我国的经济法律体系框架基本建立，政府机构和政府职能得到大力调整，有效促进了经济和社会向前发展。但是，政府到底行使什么职能？它管理经济的权力究竟如何设定？对这一问题，我们至今仍未完全搞清楚。因此，政府在经济管理的手段和方式上，到目前仍然离不开计划经济的那一套。特别是近几年，计划经济回潮和利益驱动的现象还十分严重。其主要表现有：
一是政企不分，政府干预过多。这次机构改革虽然力度较大，但主要是对机构和人员在量上的变动大，其质（政府职能）的变动并不大。不仅如此，反而在某些方面出现某些逆转现象。这就难免政府仍把主要精力继续花在企业身上，做了许多属于企业做的事情，以政代企的做法再度显出。此外，据反映，有的部门不仅直接干预国有企业，而且还逐步把手伸到了私营企业和外资企业，成了所有企业的“娘家”。
二是抢权让责，行政审批增加。由于政府职能没有实现根本转变，权利一体、职责不明、权责分离等现象较为普遍，从而导致行政审批大量增加。目前，仅国务院及各部门的审批项目多达2000～3000项，有的一个部门就有170多项。据资料，1998年机构改革后，国家计委、经贸委等9个部门在对企业经营的189项审批中，新增审批占22%。各地也同样存在类似情况。另外是审批手续复杂，审批时间拉长。
三是政府垄断，与民争利突出。政府垄断不仅表现在对生产要素如金融、保险、证券、土地、进出口权等领域的控制上，而且对一些行业如电力、电信、民航、铁路等和其他基础设施领域，甚至对一些竞争性领域，政府也进行垄断。在具体操作上，对国有经济和非国有经济分别采取许多优惠和限制的不平等政策。这种做法，一方面使国有企业（包括垄断行业）内部缺乏应有的动力而产生各种矛盾和问题；另一方面，也使民间资本难以找到有利可图的领域而影响投入的积极性。
四是转移权力，间接剥夺企业。机构改革后，中央和国务院要求党政军各部门与企业脱钩。但是，由于缺乏有力的法律和制度制约，有的部门目前仍是明脱暗不脱，它们把原有部分权力转移给了所属事业单位或中介机构，让这些部门充当“二政府”的角色，并通过这些部门采取审批、培训、检查、评比、发证等方式间接干预企业，捞取好处。
这些状况的存在和所产生的诸如腐败这样的后果，已经到了严重制约经济和社会的正常发展与进步的地步。这一可怕的事实必须引起高度重视。为什么会出现和长期存在这些问题？其原因是复杂的多方面的，但最基本的原因是政府的行政管理体制改革严重滞后，政府管理经济的职能没有根本转变，缺乏有效的制约监督机制和法律制度武器。因此，必须按照市场经济的通行规则，下决心加快行政管理体制改革，实现政府职能的根本转变。目前，应着力做好以下工作。
第一，科学界定政府职能和部门权力。经过多次机构改革，政府职能趋向好转，但仍不合理，不科学。因为该做什么不该做什么并不明确，经常是该做的没有做好，不该做的又积极去做。部门之间也是经常出现权力打架的现象。为了消除经济发展中的这一主要体制性障碍，要尽快研究和科学界定政府职能，合理划分部门权力，使政府的职能少而精，行之有效，并把明确的职能和权力制度化、法制化，以便使依法行政和科学行政有严格的制度保证。从加入WTo的紧迫性和必要性以及老百姓的呼声考虑，这一工作应抓紧进行，不必等到下次机构改革。
第二，实现权责挂钩和权利脱钩，避免争权夺利。政府及各部门在依法行使所规定的权力时，必须承当相应的法律责任。这就是要从根本上克服政出多门、多头管理和无人负责的弊端。同时，要采取加快费税改革、加强预算外资金管理、实行罚缴分离和收支两条线等措施，促使权力与利益彻底脱钩。只有这样，才能正确使用权力，尽职尽责，公正执法，防止出现争权夺利的现象，从而从源头上制止腐败。
第三，大刀阔斧改革政府的行政审批制度。在确定政府行政职能和权力的基础上，当前要认真做好四件事：（1）彻底清理现有行政审批事项。
要把有关企业设立、经营资格、许可证、投资、人事、用工、分配、评比以及各种收费的审批，作为清理的对象和重点，该取消的一律取消。（2）大幅度缩减行政审批范围。对不该审批的坚决不搞审批；对确实需要审批的，要简化程序，简短时间。要实行招标投标制。（3）竞争性领域的投资项目要由行政审批制改为登记备案制。（4）建立重大项目的审计制度和责任追诉制度。目前，深圳、北京、上海、浙江等地已经做出示范，其他地方要加快步伐。
第四，加快投资体制改革。除了关系国家安全领域、特殊行业和重大项目外，政府投资要逐步退出竞争性领域，要调整市场准人和产业政策，鼓励民间资本投资和参与基础设施领域建设。要尽快确立企业的投资主体地位，企业投资要自主决策、自担风险，银行实行独立审贷。
第五，禁止政府部门直接从事各种经营活动和中介业务。国家独资和控股公司，要建立健全董事会决策制度，避免政府部门的直接干预。各政府部门不仅不得在竞争性领域从事经营活动，而且还必须与各类中介机构彻底脱钩，凡是企业和中介机构能干的事，政府都不必插手。
第六，大力推进国有企业改组改制。在提高国有经济控制力和竞争力的前提下，通过采取实行股份制、资产重组、产权出让等措施，认真解决国有经济范围过宽、数量过大和布局不合理的问题。同时，要改革企业的干部人事制度，建立市场培养企业家的机制。在这个基础上，政府对真正的国有企业只要改善管理方式，就可以不提政企分开了。因为实际上也分不开，而且国外也是不分的。有了这个基础，其他各类企业已经成为市场竞争的主体，这时在政府与企业的关系中，就有了或有效实现了真正意义上的政企职责分开。