这样的话令艾克尔伯格心情十分沉痛。此刻，他不得不行使麦克阿瑟给予他的权利。他马上召开了会议，在会上解除了前线总指挥哈丁的职务，又解除了许多情绪消极的指挥官的职务。他在会上斩钉截铁地说：“从现在开始，我要停止所有的进攻，用两天的时间来整顿我们的军队，建立起有效的指挥系统，规划好完整的进攻计划。”
12月5日，美军经过艾克尔伯格的重新调动，情况已有了很大的改观，此外，他们还刚刚得到美军第五舰队的支援。于是，艾克尔伯格下令对日军再次发进攻。可是，由于日军的碉堡火力极强，美军的进攻还是毫无收效。艾克尔伯格仔细分析了美军和日军的当前情况，发现如果没有一番惨烈的肉搏战，日军很难被击败。更令他无奈的是，经过了大概一个星期的战斗，美军的推进速度仍没有什么起色。艾克尔伯格开始重新深入士兵内部，鼓舞大家的士气，还不顾个人安危，到最前线视察了日军的碉堡和前线美军的状态。
12月9日，澳军攻克戈纳的消息让麦克阿瑟深受刺激。他连连致电艾克尔伯格，要他尽快拿下布纳。每一天，艾克尔伯格的办公桌上都摆满了麦克阿瑟的催促命令。
12月中旬，美军的后勤保障有了很大改观，军队的物资供应也得到了很好的解决。此外，还运来了十几门大炮和几辆坦克供艾克尔伯格调用。有了大炮和坦克，美军的进攻效率就大大地增加了，他们的进攻速度终于有了起色，甚至是突破性的进展。
艾克尔伯格命令博茨克中士带着12名士兵去突破日军的防线，摧毁他们的碉堡。接到命令后，博茨克中士带着12名士兵突入到通向布纳海滩的日军碉堡。他们刚一出现，就被日军发现了，日军对他们进行了疯狂的机枪扫射，企图将这13个人消灭。博茨克和他的12名士兵一次次的用手榴弹炸向日军，艰难地向日军一点一点逼近。终于，他们突破到了日军跟前，炸毁了日军火力最为猛烈的碉堡，还摧毁了许多日军的机枪和掩体。后来，攻克布纳的转折点，就是从他们突破的这块阵地上开始的。
美军在坦克和大炮的掩护下，节节前进，一直攻打到了距离布纳政府大楼730米的地方，这个地方是日军在布纳防御体系的核心阵地。虽然距布纳政府大楼如此之近，但要攻克它却并不容易，这里有日军最猛的火力和最顽强的抵抗。而且，这四周围还有许多沼泽，许多沼泽还极为隐蔽。每一个通往布纳政府大楼的路口，都有日军修建的最坚固防御工事。日军的每一个掩体都是一个小型的堡垒，这些堡垒，有的是用砖石垒成，有的是用混凝土筑成，有的则是用整块装甲板组成，还有很大一部分人工挖掘的战壕。这些堡垒上，都盖着泥土和植被等东西，异常隐蔽，让人防不胜防。许多掩体都有地下通道相连，能够让日军彼此之间互相照顾，互为支援。每一个掩体里面，都有足够的水和食物，足以供应日军士兵的生活，还能够抵御美军的长时期围困。每一个战壕、碉堡都有配备了很强的火力点。
然而，这一切都不能阻挡艾克尔伯格攻取布纳的决心。他命令部队以大炮和坦克开道，步兵随后掩杀，一步步向布纳的中心地带——政府大楼进攻。在胜利即将到来的时候，美军的士气也非常高昂，他们奋不顾身地向日军扑去，这场战斗更为惨烈，双方又有大量的士兵阵亡。
12月19日，伴随着隆隆的坦克声和响亮的号角，美军终于攻克了布纳，将驻在布纳的日军完全赶了出去。
艾克尔伯格走在布纳沉寂的战场上，看着地上的斑班血迹和无数的尸体，心中百感交集。他又来到了日军的那些防御设施面前，仔细地查看了日军的防御设施，这些防御设施令艾克尔伯格大为震惊，他从来没有见过这种集复杂性、隐蔽性和坚固性于一体的防御设施。看着眼前这些防御设施，回想起这段时间的惊心动魄的战役，艾克尔伯格长长地叹了口气。
至此，盟军终于赢得了布纳－戈纳战役的全部胜利，将日军赶出了布纳－戈纳区域。但是，盟军因此而付出的代价也是惨重的。有近半数的兵将在这场战役中阵亡和受伤，还有很大一部分士兵因为疾病而撤出。
布纳战役中，美军逐走了守在这里的2500余名日军，而自己方面的部队的伤亡人数高达2343人，因疾病减员2044人。戈纳战役中澳军的伤亡人数也大致如此。
总之，麦克阿瑟的部队每打死、打伤一名日军士兵，自己的一方就会有两人受伤或死亡，这样的代价是沉痛的。而通过这场战役，盟军的第32师元气大伤，必须要重建。
但是，麦克阿瑟毕竟赢得了胜利，赶走了驻在布纳－戈纳的日军。他发动这次战役的目的之一就是要歼灭日军在巴布亚的陆军，从战争的结果而言，麦克阿瑟的这个目的达到了。
4.攻克萨纳南达
攻克了布纳－戈纳之后，麦克阿瑟这才舒了口气。
此时，参谋长联席会议命令麦克阿瑟制定出一份占领拉包尔的计划。实际上，早在1942年7月，参谋长联席会议就要麦克阿瑟制定这样一份计划。但由于战争紧迫，麦克阿瑟并没有时间来制定这项计划。现在，布纳－戈纳之战胜利了，麦克阿瑟立即发表了一份公报，他在公报中宣称：巴布亚战役已经初步取得了前期的胜利，现在，即将要进入最后的阶段。在部分地区，日军已经停止抵抗，盟军正沿新几内亚海岸搜捕幸存的日军士兵。
1943年1月8日，取得布纳－戈纳胜利之后麦克阿瑟心情大好。他和肯尼一起前往布里斯班。几个月前的那个忧心忡忡的麦克阿瑟早已不见了踪影，取而代之的是一个积极乐观、充满活力的麦克阿瑟。他穿着擦得锃亮的低帮军用皮鞋，戴着白手套，信心十足地坐在布里斯班的司令部里。他在计划着下一步的行动——进攻萨纳南达。
因为，日军虽然退出了布纳和戈纳，但他们残余的部队败退到了萨纳南达，和驻守在那里的日军合兵一处。萨纳南达位于布纳和戈纳之间，这里也有许多日军修建的防御工事。在萨纳南达的战壕里，集结着7000余名日军。但在麦克阿瑟看来，攻取萨纳南达已经不成问题了。
1943年1月11日，麦克阿瑟命令艾克尔伯格指挥巴布亚的所有盟军，开始进攻萨纳南达。艾克尔伯格深知日军的顽强，他没敢大意，做好了最周密的计划。果不出所料，在萨纳南达，盟军遭遇了日军顽强的抵抗，双方都伤亡惨重。但是上天又一次帮了盟军，因为在战争陷入最激烈的阶段时，日军拉包尔司令部下令驻萨纳南达的所有部队全线撤退。就这样，日军一边撤退，一边进行着抵抗。
1943年1月20日，盟军消灭了萨纳南达未来得及撤走的残留日军，并对萨纳南达形成了包围之势。
1月22日，盟军攻占了萨纳南达。在这一天，战争结束了。
巴布亚战役的结束
盟军对萨纳南达的攻克，标志着巴布亚战役的正式结束。同时，也完成了盟军参谋长联席会议于1942年7月制定的战斗计划中第一阶段的目标。尽管这次目标的实现比原计划推迟了半年时间。但是，毕竟这次战役还是以盟军的胜利而告终了。西南太平洋司令部用大篇幅发了一个新闻公报，宣称自己取得的伟大战果。
无论如何，麦克阿瑟取得了新几内亚局部战争的最终胜利，虽然这次胜利付出了不小的代价。巴布亚战役持续的半年时间里，麦克阿瑟总共投入的3万部队中，有8500名士兵献出了自己宝贵的生命。
一年前的今天，日军占领了新不列颠群岛的拉包尔，对盟军形成了极大的威胁。接下来，他们又发动了两次以夺取莫尔兹比为目标的战斗，让盟军伤亡惨重，同时也接受了巨大的考验，最终化险为夷。
一年后的今天，日军企图征服巴布亚的1.4万精锐部队，被盟军打得四散奔逃，丢盔卸甲。这些参加巴布亚战役的日军，有的横尸荒野，有的躲在医院的病房里。他们的指挥者堀井也早已魂归西天。
在这场惨烈的战役中，盟军除了牺牲了许多宝贵的陆军生命外，还失去了许多飞机、舰船、一大批优秀的飞行员和水兵……
1943年1月23日，萨纳南达被攻取的消息传到麦克阿瑟司令部的时候，麦克阿瑟表情沉痛，他喃喃自语道：“所有在巴布亚战役中阵亡的将士们，你们可以好好安息了，胜利最终是属于我们的……”