腰果的花生于小枝的顶端，密集的花序又大又长。同一个花序上有3种花，即雄花、雌花和退化花。腰果树的花期很长，同一株树上有的正在开花，而有些果实却已经成熟。从10月至次年6月都能不断开花。按照植物的开花习性来说，一年中开花数次或全年花期不断，是热带雨林的特征之一。如在两广南部的番木瓜和杨桃，全年都在开花；番石榴、苹婆等一年也可以开花数次。腰果的果肾形，着生在膨大的花托上，果皮坚硬。成熟时灰白色，长2.5～4厘米，宽2～2.5厘米。成熟的花托梨形或卵形，多为红色或金黄色，肉质松软。
