然而，胤礽稍长，却越来越使玄烨感到失望。
第一，胤礽自幼得父辈恩宠，侍臣阿谀，养成任性骄纵的作风，对父皇亦少敬意。玄烨和胤礽之间首次显露嫌隙，是在康熙二十九年（1690年）七月。玄烨出塞远征噶尔丹时，中途得病，传信叫胤礽到行宫相见。见面时，胤礽毫无忧戚之色，对父亲的健康漠不关心，使玄烨很不高兴。
第二，玄烨生活节俭，从不妄用滥取，胤礽却奢侈贪婪，甚至倚仗皇太子身份派人向地方官敲诈勒索。康熙四十六年（1707年）玄烨带胤礽南巡，江宁知府陈鹏年在主办行宫事务中供奉简朴，又无礼仪馈赠，胤礽大怒，竟要将陈处死。
第三，玄烨待人宽和，胤礽却任意凌虐臣属，甚至连亲贵也随意挞辱。胤礽在诸皇子中地位优越，恣意妄为。当然，同辈兄弟出于忌恨，拨弄是非，也促使了胤礽与父亲关系的恶化。
从玄烨一方讲，立储受挫也有自身原因。他22岁时册封皇太子，未免操之过急。尽管为树立太子威信和培养从政能力煞费苦心，却未注意在制度上防止皇储越分，形成对皇权的干扰。比如在礼仪上，一开始就规定，皇太子服御诸物俱用黄色，一切仪注几乎与皇帝相同。玄烨事后总结说，胤礽“骄纵之渐，实由于此”。他又规定，每逢庆典，大臣们朝拜皇帝后，需往东宫行礼。这些优遇，反而助长了太子的骄纵和非分之想。加上一些阿谀奉承之辈麇集太子周围，为其出谋划策，逐渐形成所谓“太子党”，使玄烨感到皇权受到威胁。
最终促使玄烨决心废黜胤礽的是两件事。
第一件：胤礽失宠后，引舅氏索额图为靠山。索额图是开国勋臣索尼之子，胤礽母亲的叔父，任大学士、领侍卫内大臣多年，康熙四十年（1701年）以老乞休，但在朝中仍拥有强大势力。索额图是太子胤礽最倚信的支持者，朝廷中索额图党逐渐演变为“太子党”。康熙四十二年（1703年）五月，据索额图家人告发，索额图“背后怨尤，议论国事”，又发现助太子“潜谋大事”。索额图交宗人府拘禁，后死于狱中。玄烨与胤礽的矛盾日益深化。
第二件：康熙四十七年（1708年）五月，玄烨率领诸皇子行围塞外，皇十八子胤祄病重，留中途调理，不久病情恶化，玄烨回銮临视，非常忧戚。胤礽对弟弟病危却无动于衷，毫无友爱之意，玄烨对他加以责备，胤礽反而大发雷霆，任意挞辱随行诸大臣侍卫。甚至每夜窥伺玄烨所居幔城，使玄烨惊惧不安。
康熙四十七年（1708年）九月初四日，康熙帝在巡视塞外返回途中，在布尔哈苏台，召集诸王、大臣、侍卫、文武官员等至行宫前，垂泪宣布皇太子胤礽的罪状：
第一，专擅威权，肆恶虐众，将诸王、贝勒、大臣、官员恣行捶挞；
第二，穷奢极欲，吃穿所用，远过皇帝，犹不以为足，恣取国帑，遣使邀截外藩入贡之人，将进御马匹，任意攘取；
第三，对亲兄弟，无情无义，有将诸皇子不遗噍类（意即“没有活下来的人”）之势；
第四，鸠聚党羽，窥伺朕躬，起居动作，无不探听，伊每夜逼近幔城，裂缝向内窃视；
第五，从前索额图助伊潜谋大事，朕悉知其情，将索额图处死。今胤礽欲为索额图复仇，结成党羽。朕未卜今日被鸩，明日遇害，昼夜戒慎不宁。（《清圣祖实录》卷二三四）
罗列罪状之后，康熙帝说：不能让这不孝不仁的人为君。康熙帝“且谕且泣，至于仆地”。谕毕，命人将胤礽羁押。
同日，康熙帝为了打击皇太子集团的势力，下令将索额图的两个儿子格尔芬、阿尔吉善及胤礽左右二格、苏尔特、哈什太、萨尔邦阿等人“立行正法”。
随后，玄烨召诸皇子入乾清宫，宣布：“诸阿哥中，如有钻营谋为皇太子者，即国之贼，法断不容。”
但是，胤礽废后，太子虚位，希冀储位的诸皇子竞争纷起，争斗更加不可遏制。
就在同一天，皇十八子胤祄死。这对康熙帝来说，真是祸不单行，感情上受到沉重的打击。康熙帝为了政治上的需要，不得不废斥皇太子。但废斥之后，又很难过，愤恨、失望、惋惜、怜爱，复杂的心情，交织在一起，一连六日“未尝安寝”，对诸臣谈起此事，“涕泣不已”。
九月十六日，康熙帝回到北京。命在皇帝养马的上驷院旁设毡帷，给胤礽居住，又命皇四子胤禛与皇长子胤禔共同看守。当天，康熙帝召集诸王、贝勒等副都统以上大臣、九卿、詹事、科道官员等于午门内，宣谕拘执皇太子胤礽之事。康熙帝亲撰告祭文，于十八日告祭天地、太庙、社稷。将废皇太子幽禁咸安宫，二十四日，颁诏天下。
皇太子从康煕十四年（1675年）初立，至康煕四十七年（1708年）初废，长达33年之久。这时康熙帝55岁，皇太子35岁。为了培养皇太子，康熙帝可谓费尽苦心。废皇太子一事使康熙帝悲愤交加，格外痛心，心力交瘁。此时，康熙帝已经进入老年，而接班人却变得渺茫。他哀求皇子们说：“在同一时间里发生皇十八子死和废皇太子两件事，心伤不已，你们仰体朕心不要再生事了。”然而康熙帝的儿子太多，他在位时间又长，“夜长梦多”，皇子们早已形成了几个利益攸关的政治集团。他们之间的争斗，不是争夺房子、银子、珠宝和土地，而是皇位。巨大的诱惑，使这种争夺由表及里、由隐到显、由缓到急、由温到烈，势不能止。康熙帝废掉皇太子的举动不仅没有制止这种争夺，反而让一些皇子仿佛看到了希望，因而储位之争更为激烈。