马耳他首府瓦莱塔的一家普通居民的房屋地基下，在1902年发现了一个巨大的洞穴，这个洞穴中隐藏着一个庞大的史前建筑遗迹——一座地下神庙。
考古学家通过勘察发现，整座地下建筑共有3层，最深处离地面12米，里面由许多上下交错、多层重叠的房间组成，有一些进出的洞口和小房间，旁边有一些大小不等的壁龛。中央大厅耸立着一些直接由巨大的石料凿成的大圆柱和小支柱支撑着的半圆形的屋顶，天衣无缝的石板上耸立着巨大的独石柱，整个建筑线条清晰，棱角分明，平整舒展，没有发现用石头或其他东西镶嵌补漏的地方。
然而，这样规模宏大的史前地下建筑，设计修建者是谁？在石器时代，为什么花费如此巨大的精力来修建这些地下建筑？这些问题始终是撩人遐思的谜。
在马耳他岛的塔尔克辛村，人们发现了又一个巨大的石制建筑，经过考古学家发掘和鉴定，这是一座石器时代的庙宇的废墟，人们把它叫做塔尔克辛神庙。塔尔克辛神庙是欧洲最大的石器时代遗址之一。这座约在5000年前建造的庙宇，占地8万平方米，整个建筑布局精巧，雄伟壮观，许多祭坛上都刻有精美的螺纹雕刻。在石制壁龛上，刻有公牛和母猪的形象，一些人认为这些动物形象是祭祀品的象征。这座神庙的废墟上，一道宏伟的主入口的形状非常真切，它通往厅堂和走廊以及那些迷宫般的房间。
其实，在19世纪，人们已经在马耳他岛上的哈加琴姆、穆纳德里亚等地，发现了一些精心设计的巨石建筑遗迹，这些石制建筑包括庙宇和一些巨大的“石桌”，在神殿里还发现了一些小型母性神的雕像。人们把这些母性神像叫做“马耳他维纳斯”。其中一尊无头神像有着结实健壮的大腿、饱满的腹部和丰腴下垂的乳房，似乎隐喻了人们对生殖的崇拜。这些发现吸引人们来到马耳他进行游历和采风，穆纳德里亚的庙宇激起了艺术家们的创作灵感，那些写生被创作成漂亮的带有些迷离情调的风景画。
穆纳德里亚的庙宇，俯瞰着地中海，半椭圆形的底层设计是马耳他岛上巨石建筑的特征。这座庙宇大约建于4500年前，有些石块因为峭壁的遮掩保存得相当完整，这座庙宇又被称为太阳神庙宇，它实际上是一座天象馆，根据太阳光线投射到神庙内祭坛和石柱上的位置，可以准确地显示一年中春分、夏至等节令。庙宇里设有祭坛和壁龛，公羊的图像被栩栩如生地刻画在石头上。而据另一种推测，这座神庙可能建成于公元前10205年，那么，1万多年前，是谁在这里修筑了这个太阳神庙呢？
在马耳他西部的一些地面上，遗留着至今令人们迷惑不解的大型“车辙”，这些“车辙”不仅在地面上，而且弯弯曲曲地延伸到地中海42米深处的海底，而这里又找不到任何曾经下沉的痕迹。对这些“车辙”，人们无法鉴别它留下的年代，即使用放射性碳元素的方法也得不到任何结果，如果真的是在运送那些庞大的石块时留下的，那么，人类又是从什么时候才拥有了能够运载这样大体积巨石的车辆的呢？在目前的想象力水平下，人们只能把它作为一个待解之谜悬置在那里。
小小的马耳他岛及其附近更小的岛上，已经发现了几十处巨石遗迹，这些巨石遗迹充分体现了它们的建造者们高超的天文、数学、建筑学方面的造诣。一些考古学家和地理学家认为，在1.8万年前，在亚、非、欧三大洲的交界之处，曾经出现过一个非常繁荣的文明，后来，一场全球性的洪水使这个文明被彻底湮没，只有这些巨石得以留在地面上，撩拨人们的探索欲望。