这棵大神树全用青铜铸造，共分上、中、下三层，每层有九枝，每枝成弯弓形，从上升弯到下垂，每枝的弓顶端站着一只鸟，共九只鸟。那鸟有粗犷的勾喙（鱼凫嘴），头顶有花冠，一对机灵的大眼睛凝视苍穹，展开一双小小的卷花翅膀，翘着长长的尾巴，其势欲飞。每层的三个枝头上垂着像吊钟花，花蕊中生着一个圆球似的果实，这样的花和果实在每层中又有一个并蒂枝，因而每层就有四个垂着的花果，共十二个吊钟似的花果。再加上每只鸟站立的地方，是一朵向上开放的花，鸟就站在花蕊中的圆果上，这样，每层就有七朵花，三层共二十一朵花。神树的顶端残缺，但留有插孔，估计是全树的精华所在，可惜没有保存下来。神树的基座是三支反S型的粗状的脚，粘接在一个圆盘上，那脚的三面刻有精美的图案，有云雷纹、回纹、S纹等。
每只脚旁还站着一个武士般的小人。神树上有一条龙，从树顶上蜿蜒而下。那张巨大的喙紧咬着整齐的牙齿，那牙齿是由上下三个圆圈表现出来的，加上那巨大的眼睛，象牙一般的大角，令人十分恐惧，敬而远之。龙的腰上生着两只长爪，其中的一只却是人的手掌，手指特别长，另一只爪却是一把长剑，剑柄上刻着精致的花纹，龙的背上长着鳍翅，那翅却是一把悬空的长剑，总之，这条龙很奇特，浑身带着刀剑，仿佛是时刻准备着战斗，所向披靡。
在三星堆的两个祭祀坑发掘中，还出土了共计80多枚象牙，它的来源和作用在学术界有多种观点，有的认为是通过贸易而来，有的认为在远古四川的生态环境适合大象的生存，其证物主要是在当地发现大量的半化石状乌木，单体巨大。但无论其来源怎样，都可以认为它是统治者财富的象征。
三星堆还出土了一些陶器，以高柄豆、小平底罐、鸟头形把勺为基本组合定式，其中还有瓶形杯，它被做成喇叭口、细颈项、圆平底，很像今天我国北方地区用来烫酒的陶瓷酒瓶，与日本人喝清酒用的酒瓶极为相似。玉石器则以祭天礼日的璧、璋为多，尤其是号称“边璋之王”的玉边璋，其残长达159厘米，厚1．8厘米，宽22厘米，其加工精美，棱角分明，器身上刻有纹饰。
这么大件精美玉器，在国内现有的考古发现中仅发现有一件。
在三星堆的发掘中，很少工具类的文物出土，当时也缺乏比玉石更硬的金属，那么这些玉器是如何加工的呢？三星堆文物魅力无限，内涵丰厚，极具吸引力和震撼力，三星堆文物是具有世界影响的文物，属世界文化遗产范畴。
然而，三星堆遗址及其出土文物的许多重大学术问题，至今仍是难以破译的千古之谜。
虽然专家学者对其中“七大千古之谜”争论不休，但终因无确凿证据而成为悬案。
第一谜，古时祭祀坑多为五个一起出现。
在三星堆发现的两个坑若确实为祭祀用坑的话，还会有第3、第4、第5个坑被发现吗？会有历史更古久、更精美、更令今人难以理解的文物出土吗？第二谜，三星堆古蜀国已建立了城市、产生了高度发达的青铜器，并有了大型的宗教祭祀场所，这些都是早期国家产生的标志因素，但出土物中没有可称得上文字的符号———“铭文”，真难以想像在没有文字的社会环境中，古代蜀族居然能创造那样高水平的物质文明。
第三谜，三星堆的奇异人物造型，如纵目人面像，很容易就让人联想到古代神话中的“千里眼、顺风耳”形象，这会是天外来客的外形吗？或者这些东西是用于天人相通的器物？或者它们就是天外来客的遗存物？出土的三星堆人高鼻深目，颧面突出，阔嘴大耳，耳朵上还有穿孔，表情似笑非笑，似怒非怒。面对这些造型诡异的青铜器，人们对此的感觉是“不像蜀人”。专家们认为，三星堆人有可能是来自其他大陆的“老外”。因为对照三星堆出土的金杖、金面具青铜像等文物来看，与其他大陆的文明有很多相似之处。
人们确实有理由设想：既然在一万年前，亚洲先民就可以远涉另一块大陆，那么四千年前的三星堆古蜀国为何不能出现来自南亚乃至欧洲的“老外”呢？三星堆文明这种迥异于中原文明的独特气质无处不在证明，这是多种外来文化在三星堆“杂交”的结果。
第四谜，玉、石器主要堆积在东北角，尤其是玉璋和戈，在出土的器物上都有被火烧烟熏的痕迹。许多变形、残损的铜器、玉石器，除一部分是由于在填土过程中打夯挤压所致外，有的是被火烧坏。还有大部分是入坑前当时人们在进行某种活动时而损毁。如有的铜器一侧或一端烧变形呈半熔化状态；有的玉石器被打碎，出土时残断部分位于坑内不同部位，有的甚至分为五处；有的拆为两段而重迭在一起；有的端刃或柄残断了，发掘时将填土进行筛过，也未发现残缺部分。
这显然是器物在入坑前就残损了。
那么，为什么人们要将一件件国之重器先破坏再埋掉？第五谜、三星堆出土的大量青铜器中，基本上没有生活用品，绝大多数是祭祀用品。表明古蜀国的原始宗教体系已比较完整。
这些祭祀用品带有不同地域的文化特点，特别是青铜雕像、金杖等，与世界上著名的玛雅文化、古埃及文化非常接近。
有的学者认为，大量带有不同地域特征的祭祀用品表明，三星堆曾是世界朝圣中心。
在坑中出土了5000多枚海贝，经鉴定来自印度洋。
有人说这些海贝用做交易，是四川最早的外汇，而有的人则说这是朝圣者带来的祭祀品。还有60多根象牙则引起了学者们“土著象牙”与“外来象牙”的争议。“不与秦塞通人烟”的古蜀国，居然已经有了“海外投资”，不可思议。
第六谜、将出土青铜器进行检测，在所有的样品中均未发现锌的存在。自然界中单一的铅矿很少，铅和锌往往是伴生在一起的，冶炼铅常用的矿石也称为铅锌矿。因此在使用了铅的合金中，往往都会发现微量锌的存在。
在三星堆青铜器的成分分析结果是：微量锌是不存在的，在全部样品中未发现锌的踪迹。
这表明：蜀人使用来冶炼青铜的铅矿可能不是通常使用的铅锌矿，而是无锌伴生的铅矿，这与同一时期中原地区冶炼青铜的原料之一———铅矿的产地是不相同的。
但这样的铅矿在四川没有被发现，古蜀人如何能得到它？第七谜、三星堆文明又为何突然从成都平原消失？对于这座东方巨城突然消失的原因，有的专家们认为，三星堆毁于一场大洪水。从三星堆古城布局看，当时的三星堆很像今天的成都，北邻鸭子河，马牧河由西而东贯穿全城，三星堆的古蜀先民“择水而居”的理念成就了它的繁荣也埋下了巨大的隐患。但考古学家并未在遗址中发现洪水留下的沉积层。
有的专家们认为，三星堆毁于战争。遗址中发现的器具大多被事先破坏或烧焦，似乎也应证了这一解释。但后来人们发现，这些器具的年代相差数百年。
有的专家们认为，三星堆毁于迁徙。
这种说法无需太多考证，但它实际上仍没有回答根本问题：人们为什么要迁徙？成都平原物产丰富，土壤肥沃，气候温和，用灾难说解释似乎难以自圆其说。
那么，古蜀国消失在历史长河的真正原因究竟是什么呢？尽管三星堆尚有许多未解之谜，但伴随着三星堆文物的影响与日俱增，对三星堆文化研究的深入，谜底终有揭开的一天，神秘梦幻的三星堆古蜀国亦终将再现于世人面前，三星堆文物也必将以其无穷的魅力，闪耀出迷人的光华。