目前，发展网络商店主要面临着有七个方面的障碍。
（1）没有网络商店的目录
因特网是计算机合作世界，而不是一个盈利性的联机服务，所以这里没有市场指导来把所有网络商店组成一个完整的联机商场。在因特网的网络商店买东西，如同在没有地图或者向导的情况下，到一家从没有听说过的商店去买东西，除非你碰巧路过一个有你想要的东西的商店，否则，你会不知所措，你不知道怎样寻找你所需要的东西。
（2）很难在相似的商店之间作出比较
在因特网上，对商店进行比较是很困难的。当然，网上联有大量的计算机，但是没有办法把它们一一罗列出来，况且在目前情况下要找到它们也要花一番工夫。因特网网络商店的商人们好像对列出诱人的价格这个传统的零售手段也显得有些犹豫。一些因特网网络商店甚至对是否该公开价目存有疑问。
（3）网络商店的安全得不到保证
因特网是一个公开的网络，“网络黑客”能轻松地闯入并拿走他们想要的东西。因特网的安全问题是因特网商业的一个十分重要的关键问题。当我们大谈因特网上的电子商务的光明前景时也应看到它的负面影响。网上购物，也有上当受骗的。目前网络上相继开张的购物中心虽然货品琳琅满目，但是也有消费者遇到自己的信用卡被刷走之后，才发现该店只是虚设的店面。多数消费者很难为了几十元的缘故而要求索赔，只能自认倒霉。
（4）没有足够的消费者
虽然因特网网民近1亿，但手头阔绰的消费者在网上仍然不多。此外，仅仅400万个因特网的用户能够观看因特网上带有图形界面的虚拟商店，并且超过半数的因特网用户仅仅能收发电子邮件。当然，所有这一切正在发生变化，商业服务网络正在开始向它们的用户提供使用因特网的手段。但直到目前为止，因特网上的消费者与因特网商店的比例仍然太低了。
（5）不够有趣
因特网站虽然有漂亮的超文本链和图形，但没有真实商店中有长凳、喷泉和冰淇淋的诱惑，并不是一个令人满意的地方。
（6）缺乏有效的电子支付手段
开展网上购物业务时遇到的最大难题是缺乏有效的电子支付手段。这使得网上购物与电视商场购物甚至传统的邮购销售方式相比，并未显出明显的优势。
（7）网上购货方便退货难
网上购物正在成为美国人的一种时尚，但一些美国人发现，网上购物虽然方便，但退货难确是影响这种新型销售方式发展的难题。