在起居方面，孙思邈于1000多年前就告诉人们“起居有常度”，“卧起有早晚，兴居有至和之常制”，还强调夙兴夜寐，生活有序，审四时，防六淫（风、寒、暑、湿、燥、火），要“依时摄养”，适应季节变化而活动。
居住条件对于养生具有重要的意义。污染、噪音、生活和卫生条件等是人衰老的重要原因之一。孙思邈一生很讲究居住条件，这是他获得141岁高寿的重要原因之一。
1.环境宜山林
孙思邈注重地理环境的选择，长期隐居名山胜境之地。据明代乔世宁《耀州志》载：“太白、终南、峨眉、五台（今陕西耀县药王山），皆真人隐居处，而太白最久，故史称隐于太白山。”孙思邈也自称为“太白处士”。慎重选择居处这一思想很早就形成了，在《千金要方》中曾谈到“问我居止处，大宅忽林村”。太白山、终南山等均系秦岭山脉。太白山为诸山中的主峰，山上奇花异草，遍地皆是，药用植物，种类繁多。山泉淙淙，清澈甘美，山幽鸟鸣，仙境人间。寺观林立，僧道云集，采药圣手，络绎不绝。当然更是适宜孙思邈长居隐栖之地。难怪孙氏自号“太白处士”。至于耸立在四川盆地西南之缘的峨眉山，是中国佛教名山之一，山势巍峨，峰峦挺秀，寺庙雄浑，草木繁茂，古树参天，药材丰富，环境幽雅。当然更是具有强力的诱惑。至于“五台”，即今日药王山。早在南北朝时就是佛教活动之地，自古迄今，五山环拱，古柏荫翳，洞壑幽邃，殿宇轩昂，尤其是遍地药香，存藏丰富。自古就是关中渭北的千古名胜之一。同时孙思邈历游祖国各地名山，据载如：华山、嵩山、衡山、太行山……至今在很多地方都留有他的遗迹或动人的故事。当然这些传说不可能都是真实的，但却反映了历史的影子。
孙思邈一生大多处居于山林中。山林环境是一种自然的养生长寿之地。森林中的枯枝落叶散发的浓郁香味有奇特的新药理作用，呼吸这种空气可使人轻松镇静，精神愉快，对神经衰弱、植物神经紊乱等疾病患者有良好的治疗作用。另外，山林地区空气中灰尘少，许多树木如白皮松、黑胡桃等能分泌出多种杀菌素，在药物治疗配合下，对肺病、气喘和各种痨病有提高疗效的作用，尤其对喧闹噪音和紧张工作引发的神经失常和肠胃、心脏、循环系统障碍等疾病的恢复有益。
2.择地宜安静
孙思邈对居处的环境选择，不仅考虑自然因素，也考虑社会因素。山林深远，固是佳境，但独自居处，脱离社会群体，会带来生活的不便。
孙思邈长期隐居名山胜地，到了晚年，回到故里耀县，依其医疗实践、养生之经验整理完成了又一部巨著《千金翼方》，次年唐永淳元年（682）长辞于世。他在《千金要方》中专列“养性”，又在《千金翼方》卷十四再专列“养性”、“退居”等，其主旨是如何告老还乡，应当懂得进退得失，安心颐养天年。
孙思邈早在1000多年以前就提出的“退居”似乎相当于我们今天讲的“退休”！人到了一定年龄，要思退、知退、即退，年老就要息心静养。要静心颐养就必须选择好处居环境，孙思邈在《翼方·退居》中专述“择地”。指出：处居要择“地势好，居者安”的环境，“山林深远，固是佳境，独往则多阻，数人则喧杂”，要求“必在人野相近（郊外），心远地偏，背山临水，气候高爽，土地良沃，泉水清美，如此得十亩平坦处，便可构居”，还进一步强调“若得左右映带，冈阜形胜，最为上地。地势好，亦居者安，非他望也”。这就是说应当选择离城市还不远的山野，交通较为方便，又不受人声鼎沸，喧嚣噪音之苦。选择深山老林，固然安静，空气清新，但交通不便，单独前往，多有险阻。多人同去，喧哗杂乱。而又与世隔绝，生活供给，大成问题。同时还考虑到人情世故，可耕种“十至二十亩，更不得广”，否则就会因经营而使人劳心伤神，添加烦恼，这些都是很有道理的科学见解。他还指出：“家事付与儿子，不得关心，所营退居，去百里、五十里，但时知平安而已。应缘居所要，并令子弟支料顿送，勿令数数往来，愦闹也。”甚至“左右供使人”也要求“精选小心，少过谨谦者”，目的是为了“事闲，无须相恼，令人气和心平也”。总之，这些养生长寿之要，显然为进一步探讨人体生命科学提供了依据。
3.宅居宜法谛
选宅居过后，就要营造房舍，数千年来，我国黄土高原上一种独有的古老建筑——黄土窑洞，因山造势，自然成趣，经久不衰，相沿至今。孙思邈从小就出生成长在陕西耀县的孙家原老堡子的土窑洞里，至今全国很多地方都有因孙思邈的隐居而谓称“孙真人洞”、“孙真洞”和“药王洞”者。充分地利用了黄土高原上黄土的特性：可塑性、易凿、保温性及干土的坚固性与耐久性等。居住在挖掘出来的黄土窑洞里，不仅安全、遮风、蔽雨，还冬暖夏凉。同时对外界噪音引起的紧张和不良影响很少，受大气中放射性物质的影响很小。科学家认为：窑洞生活方式带来的好处是长寿，温度在10—22℃范围内，相对湿度在30%—75％范围内。就温度和相对湿度的稳定性来说，窑洞看来具有最合适的生活环境。难怪孙思邈常住窑洞，“得山水之势，享自然之乐”，如太行山茱萸峰的“孙真洞”，华山的“药王洞”，西安的“药王洞”，耀县的药王山“真人洞”……长期住于窑洞中生活可使哮喘、支气管炎等呼吸道疾病、风湿病、皮肤病等大为减少，现在国内外不少建筑学家对黄土窑洞产生了浓郁的兴趣，大概原因不仅是在建筑方面，更重要的在于适应人的生命需要吧！
孙思邈在《翼方·退居·缔创》中开宗明义“看地形向背择取好处”，多认为住宅，坐北朝南为佳。在我国农村的多数民房至今也都是这样，我国位于北半球，绝大部分领土处于北温带，太阳多从偏南方东升西落。冬季，太阳高度角较小，住宅的门窗朝南，可使更多的阳光斜射进室内，保持室内温暖，在隆冬季节可避开西北寒风，起到了防寒保暖的作用。夏季，太阳高度角增大，太阳射入门窗的光射就少，能保持宅内凉爽。盛夏期可避下午最热时的直射阳光，起到遮阳避暑的作用。因此，孙思邈说“地势好则居者安”，人的疾病与所居地理环境密切相关。这里主要指的是小环境同样对人体健康会产生大影响。
孙思邈又非常注意美化环境，在房前屋后，门内门外，栽植各种花草树木，使整个房舍掩映在绿阴花木之中。面积半亩大的水池，水深3尺即可，“常会水满”，池内种植荷、莲藕、菱角、芡实之类，既可摘食药用，又可观赏悦目，恬性遣情。“境幽人长寿”，据现代科学家考证研究说明，幽静的环境可使人延寿3年，住宅绿化尚好可延寿8年，长住农村、山区、海滨和温寒地区的人能延寿10年。这些论断是否确切且不论，但幽静良好的环境，能够使人长寿延年是可以肯定的。