在中国古代，后人为了表示对历史名人的崇敬和爱戴，建祠立会予以纪念。经朝历代，这种纪念活动往往把名人先后衍变、幻化成神，烧香焚裱，修殿建庙，由地方性的神转化为全国性的神。人们相信，名人既然生前强而有力，德高望重，死后仍然可有力地保护人们。即把追念变为崇拜，进而发展为祈求保佑。孙思邈也不例外，人们为了纪念他而在全国好些名山胜地供奉建设的祠庙殿宇，甚至在佛教寺院也有供奉。建立在陕西耀县药王山上的药王大殿（亦称真人祠，药王庙等），就是如此。在药王大殿内不仅有他的“药王父母殿”，而且还有唐代以前中国古代“十大名医”的彩色塑像和很多相关的医药碑碣石刻，成为以孙思邈为主的中国历代医药学家纪念馆。
古往今来，人们为了纪念这位历史上的医药科学大师，每年农历二月初二举行隆重热闹的以耀县为中心的传统药王庙会，持续半月之久，拜谒之众，四方云集，摩肩接踵，诚表对药王孙思邈的怀念和崇敬之情。
药王山纪念孙思邈的活动从唐代开始，游人不断，瞻仰焚香，不过主要局限于药王山故宅（隐居地），规模不大。由于道教的影响和人们对先师的推崇，自北宋嘉四年（1059）孙真人祠在其故地创建后，纪念孙思邈的活动在南庵定时兴盛起来，并于元丰四年（1081）为纪念孙氏逝世400周年举行礼仪和刻碑垂范活动，加之崇宁二年（1103）宋徽宗的敕赐庙额“静应庙”，第二年又敕封孙思邈为“妙应真人”后，华原县令张鲂鸠工修葺“栋宇之制，始称其嘉”，纪念活动更加隆盛。此后，历经金、元，以至明嘉靖三十六年（1557），纪念中心场所均在南庵。正如金兴定二年《华原令何钟钧题记》碑文所载：“适值中和之节（即农历二月初一），郡人多会于静明宫，熙熙然登春台。”元至元二年《祀太玄妙应真人记》碑载道：
“完者台皇后懿旨曰：尝闻五台静明宫，为唐孙真人道场也。”据明嘉靖三十七年《孙真人祠殿记》碑载：因道士赵演斌在北洞（即太玄洞）前增建“祀殿三大楹”，“于是四方辐辏，不远千里，每岁二月二悉集焉”。又据明乔世宁《耀州志》载：“由于嘉靖时中心场所开始转移向北洞，于是向往五台者，自千里外不绝也。”沟通南庵、北洞的“通玄桥”（即通元桥）和石蹬踏步等相继完成。历史悠久，约定成俗，大规模的“二月二”庙会也就以北洞为中心正式开始了。明代会期较长，据清顺治十一年《施饭碑记》载：“秦人男女远近无少长，人马丁嚷之声尽夜，经月余不绝，即秦晋潘王，士大夫，靡不登临而拜。”庙会由州城四街轮流筹办，收取布施。二月初一开洞门，初二正式起会。群众上山烧香化裱，以示崇敬怀念之情，又带儿女祈求药王保佑，行崇乞拜谒之礼。清代改会期为10天，事先将药王山打扫得干干净净，挂上宫灯，摆好祀器，贴上对联，做好一切过会的准备。初一开洞门，初二起会，十二结束。光绪十八年耀州知州顾曾在《赛药王》一诗中写道：“曼衍重龙马戏场，分棚啸侣各行觞，春人来去纷如织，箫鼓千村赛药王。”后注云：“岁以仲春极赛五台，游侣坌集，借地群欢，靡闲宵旦。城东数里燃灯于路，望若星灿，门不下灶者见数夕。”这是对清时药王庙会盛况的又一生动写照。民国时期仍沿清制，会期十天，药王大殿香烟缭绕，钟磬喧天，烛光闪烁，供品堆积。各地群众，扶老携幼，骡马成伍，男男女女，三两群集。从“一天门”登上殿内，瞻仰药王塑像，进行拜谒，深表崇敬怀念之情。通元桥和附近大路两旁，商贩众集，摊棚林立，风味小吃，品种繁多，土产杂货，星罗棋布。广场上耍马戏杂技，戏楼上演秦腔大戏。旧俗初二正会这天，群众除上山烧香外，妇女们还要带上孩子请药王“戴锁”或“换锁”，祈求药王保佑，直至孩子12岁为止。从初六开始，直至最后一天唱“天明戏”。在通元桥戏楼，能够演出的大都是关中有名剧团。这天也是庙会的最高潮，往往是万人空巷，倾城而出，蜂拥云集，南北两路，途为之塞。
从县城东门外开始，沿上山南路两旁，“路畔灯”直到“一天门”前，每灯相距一丈左右，道路光明可晰。十一日黄昏渐暗时，东城楼上花火冲天，接着“路畔灯”一齐点亮，蜿蜒曲折，灿如星点。
瞬间在“路畔灯”的照耀下，狮子、龙灯开始上山，灯火辉煌，锣鼓喧天，欢声雷动。火龙多从南庵坡而下，穿行于古柏丛中，半折竞行，忽隐忽视。铁屑花火，倾天雨泻，此起彼落灿若繁星，蔚为奇观。
“天明戏”又于午夜开锣，黎明收台，往往观者彻夜不眠。药王大殿内善男信女，顶礼膜拜，祠祝焚香，青烟缭绕，灯火通明，又有“自乐班”助兴，管弦悠扬，更是一番别致的情趣。不少人在古会游览返回时，还要折一枝柏针（即一枝或一朵柏叶），插在头上（主要是妇女）或衣领上，或持手中。其意是除病健身、药王保佑。又表示已朝山拜过“药王”了。古云：“凡有功于民，民则祀之。”孙思邈不仅是祖国医药界的垂范楷模，而且被后世誉为“药王”，敬若神明，全国不少地方都有奉祠他的庙，有各种各样的妙趣神奇的传说故事，这些都表达了人民群众对他医德、医术、医风的讴歌和赞美。
解放后，人民群众约定成俗的千古盛会，每年如期隆重而热闹地举行。尽管“****”期间庙会废除，但历史悠久，约定成俗，群众依然届时上山。正如1959年田汉同志游药王山时曾写的《游药王山二首》其一所云：“岩上宫墙下戏场，山南山北柏枝香，千金方使万人活，箫鼓年年拜药王。”随着药王山的不断修复和人民生活的逐步提高，随着旅游事业的蓬勃发展，特别是近10年来，春节、清明前后，拜谒旅游者络绎不绝，成为旅游旺季。至于一年一度的农历药王山“二月二”古会更是高峰迭起，每日上山游人逾万，星期天更达数万之众，热闹壮观。基本仍保留着古代传统药王山庙会的风格习俗，可见孙思邈对我国传统文化的影响极为深远。
1986年对外开放后，五大洲40多个国家的外宾和各种团体，特别是日本书道院组团考察观赏者连年不断。风景殿宇和名石贵碑，古迹古建，传说遗址，医药碑方，各类展馆，为前来朝山访古的中外游客带来了莫大的兴趣。正如清代白俊德石刻题诗曰：
洞中日月有长春，山径尘销万古人。
历历隋唐无寸土，祇今柏影尚如新。