当然，要是内行厂就干点儿折腾平民老百姓的事儿，就未免太大材小用了。内行厂的一个特殊功能，就是监视东、西二厂，节制东西厂的提督，一方面监视可能对刘瑾形成威胁的所有太监，另一方面就是将京城所有的特务机构都掌握在了自己的手里。东厂的提督马永成和西厂的提督谷大用原都是“八虎”中的成员，后来他们找刘瑾办事，刘瑾都不给通融，所以在心里都记恨刘瑾，可是刘瑾大权在握，他们又不得不对刘瑾低声下气。
但是这下子锦衣卫的身份却更加卑微了，东厂掌权之日，锦衣卫从平起平坐沦落到上下级的关系，后来简直就演化成了东厂的狗腿子。等到西厂出现，日益压过东厂，锦衣卫又不得不让西厂的太监踩在自己的上面，好不容易汪直失势，谷大用虽然再次掌权西厂，但是毕竟风光不与旧时同，东、西二厂也只能平分秋色。可如今又出来一个内行厂，锦衣卫的日子可真是举步维艰了。
由于侦缉工作需要大量人手，而宫中的太监数量又毕竟是有限的，所以东、西两厂多使用锦衣卫的人员作为行刑人员或干事，遇到重大事件就会命令锦衣卫指挥使大批量地从锦衣卫调派人手。平常东、西两厂开会，锦衣卫指挥使都得以掌班或领班的身份参加，东、西两厂比较和气的时候，开会时间还岔开，这样锦衣卫指挥使还应付得来。等到内行厂设立以后，经常和东、西厂的事件冲突，马永成和谷大用都不好惹，但是更得罪不起刘瑾啊，锦衣卫指挥使通常也只能率先选择内行厂，在完事之后再高抬着屁股去东厂或西厂等着挨骂或挨板子。
最热闹的还是在遇到重大事件抽调人手的时候，锦衣卫指挥使只能把人手都调给内行厂，东、西厂的太监们也只能拿锦衣卫指挥使撒撒气而毫无办法。当然，这还是内行厂刚成立的时候，再往后锦衣卫的指挥使石文义和张采攀附刘瑾，东、西二厂就不敢再造次了。刘瑾为了专权，大肆以暴虐手段实施酷刑以树威，满朝文武无不成为惊弓之鸟。都察院递交上来的审录重囚的奏折，让刘瑾不满意，左都御史屠滽闻讯后立刻带着十三道御史去谢罪，他们跪在台阶下听刘瑾斥责，头不敢抬，连大气都不敢喘。
东、西二厂也开始逐渐受到内行厂的检查和骚扰，凡是对刘瑾不敬的东、西厂太监或锦衣卫都难以逃脱刘瑾的报复。至此，刘瑾的政治生涯到达巅峰，锦衣卫也由东厂的下属机构，转而成为内行厂的下属机构，曾经叱咤一时的锦衣卫彻底失去了左右自己命运的权力，沦落为宦官政治的附属品。
因为同时拥有内行厂、东厂、西厂、锦衣卫，明朝的特务机构在刘瑾专权时期达到了其特务机构最饱和的阶段。锦衣卫在内部出现了钱宁、于永、江彬这样为了得到皇帝的宠信不择手段的奸佞，外部则受制于内行厂及东、西二厂，实际上已经不再作为完全独立的特务机构存在了。但是鉴于锦衣卫历经洪武朱元璋的发展和永乐朱棣的完善，已经成为明朝特务机构中最为专业和强大的一支队伍，内行厂及东、西二厂在实际工作中依然需要依赖锦衣卫来完成很多工作。所以锦衣卫并没有因此就被边缘化，依然在特务机构中占据不可或缺的位置，我们甚至可以说，虽然有内行厂及东、西二厂的太监专权，但是真正在进行最前沿的特务工作的人员，依然是锦衣卫。只不过锦衣卫所执行的任务，大部分都是内行厂及东、西二厂布置下来的，锦衣卫不再是主导者，更多的是担任执行者。
3．落寞的锦衣卫
刘瑾的内行厂节制所有的特务机构，并且对满朝文武都进行监控和压迫，终于引发了朝廷上下的强烈不满。正德五年（1510年）八月，宁夏安化王的叛乱被镇压，在回师的路上，右都御史杨一清秘密会见了负责总督军务的太监张永，杨一清几番试探张永之后，就低声告诉张永，他想联合内廷太监趁这次奏捷的机会，向皇上陈奏刘瑾所有的罪状。这是一件无比机密的事件，杨一清为了能够绝对安全地会见张永，谋划良久，费了很大力气才取得了与张永单独会面的机会。张永原也是“八虎”之一，自从刘瑾当上司礼监大太监之后，就与刘瑾不和，这次得到杨一清和外廷不少朝臣的支持，又经过杨一清的鼓动，欣然应允。
右都御史杨一清和太监张永的这番对话很可能成为我们论证“锦衣卫不是出色的特务”的一个论据，但是情况却并不是这样的，杨一清如果没有得到锦衣卫的暗中点头，怎么可能那么轻易就见到张永？刘瑾向来重视对于军队的监控，更何况是杨一清和张永这两个对于外廷和内廷来说都非常重要的人士。这个时候，那位满腹花花肠子的锦衣卫同知于永出来帮了忙。
刘瑾作为弄权者，他深知王振和曹吉祥之流当年失势的教训多么惨痛，所以他在接受形形色色的小人的同时，也拉拢了不少有才干的人。在刘瑾结交的人中，让刘瑾最为信任、欣赏，谓为至交的官僚叫做张彩。张彩为人好色，但却才智出众，而且对刘瑾有着积极的影响。张彩虽然好色，但是却对于永教唆皇上连功勋臣子的老婆都霸占这样的事很不满，张彩曾经对刘瑾说，“公左右用事者多骗财坏事”，这显然有影射于永之流的意思。张彩的话直接导致了刘瑾“疏同类”，以致类似于于永之类的人带着礼物去看望刘瑾都被拒之门外。
于永在被刘瑾疏远以后，东厂大太监马永成趁机来亲近于永，所以到外廷朝臣杨一清一个一个拉拢内廷的太监们准备推翻刘瑾的时候，于永实际上已经站在了刘瑾的敌对阵营里。八月甲午日这一天，刘瑾刚刚离开皇宫，张永就悄悄走到皇上的面前，递上报捷的檄文之后，就开始陈奏刘瑾所有的罪行。有道是墙倒还得万人推，东厂提督马永成和深受皇上宠信的于永站了出来，把刘瑾平素的所作所为添油加醋地描述了一遍，热爱运动和游戏的朱厚照毕竟不是白痴，仔细一琢磨还真是，刘瑾这老小子，听大家伙这么一说他分明是想造反啊！也不调派东厂或者锦衣卫了，朱厚照就直接带着自己的御林军去了，把刘瑾逮住押进了天牢。
但是朱厚照和刘瑾的交情毕竟不是一天两天了，他还是不忍心杀掉刘瑾的，只是想把刘瑾“降为奉御，谪居凤阳”，就像明宪宗对待汪直那样得了。可是等朱厚照进了刘瑾的宅子，看见伪造的穿宫牙牌、衣甲弓弩，以及玉玺什么的，终于忍不住了，原来刘瑾他是真想叛乱啊！还谪居什么啊，朱厚照当时就让人改成了凌迟。
刘瑾死后不久，内行厂就被关闭，此后外廷朝臣再次上奏，又关闭了西厂。在这一次对刘瑾的清算中，明朝历史最悠久的两个特务机关东厂和锦衣卫取得了最后的胜利，但是锦衣卫同知于永并没有因此而持续自己的仕途。
一来他让朱厚照霸占西域籍功臣的家眷一事实在得罪了不少朝臣，二来他本身的想象力实在有限，能想出的馊主意就这么两个，后来更加大胆和奸佞的江彬逐渐得势，于永终被朱厚照疏远。
在刘瑾死后，余下的几个“八虎”成员也都垂垂老矣，在朱厚照执政后期，再也没有出现宦官专权的情况，但是这并不能改变明朝开始真正地由盛转衰，朱厚照此后更加放纵和肆无忌惮，几乎将整个明朝搞得鸡犬不宁。也终于让他在临终之际，连个继承者都没有留下。
没有扰乱朝政的臣子出现，太监里也再没有出现嚣张跋扈的弄权者，锦衣卫在正德年间以后的岁月里终于开始崭露头角。明朝不再是朝臣们玩弄权术的舞台，而成为了大小孩朱厚照的游乐园，他让他的王朝扭曲、颠倒、混乱，最终在他的死亡之际也开始走向了死亡。
锦衣卫指挥使钱宁和江彬主宰了此后的明朝政坛，他们为朱厚照构建起了那个光怪陆离的游戏世界，于是，锦衣卫仅剩不多的赞誉被这些蝇营狗苟的后来者挥霍干净了，刚刚经历过“中兴”的大明王朝无法回头地走向了衰败。
钱宁与江彬之间智力的比拼让明武宗的生活越过越刺激，也让明朝的江山越来越残缺。等到明武宗死后，江彬被凌迟处死，热热闹闹了几天的锦衣卫在给荒唐的正德朝画上一个意味深远的句号之后，彻底走进了历史的夹缝里。