选配是人们有目的有意识地确定公母藏獒的交配，人为地组合后代的遗传基础，创造符合人类意愿的理想型藏獒个体的技术过程。通常认为选配是选种的基础，选种又可以促进选配，二者互相促进，不可偏废。通常选配原则是：选择有共同优点的公母藏獒进行交配，有相同缺点的公母藏獒不能交配；最理想的是壮龄配壮龄，壮龄配老龄；禁止近亲交配。
藏獒的选配有三种技术方法：
（1）按性状组合进行选配。这种交配方式适合于犬群组建时间不久，规模较小，犬只来源较复杂、类型较多的犬场。
根据与配公母獒的品质对比而决定与配犬，选取在性状表现，性能特征，体质类型以及与适应性有关的性状上相同或不相同的个体进行交配。前者称为同质选配，后者称为异质选配。这两种选配方法有时单用，有时同用。具体地说，就是根据公母獒在体形外貌、体质、体尺（体高，体长，胸围，管围）、头型、嘴型、耳型，以及骨量和毛色等方面的表现，分别选取品质相同或不同的个体交配。有时可能先同质，后异质；也可能某几个性状上是同质，另外的性状上是异质。进行品质选配应有计划，计划应尽可能详细。如果是异质选配，公獒应在体尺、头型、嘴型、耳型和骨量上有优势，表现出类拔萃；母獒在体长、体高、繁殖力等方面有良好表现。
这样的公母獒交配，后代一般会秉承父母双方的优点，形成优良的性状性能。
（2）按血统选配。按血统选配的方法适用于具有系统选育的历史、对藏獒的选育有明确的目的与计划，犬只类型已逐渐分明，血统记录清晰的犬场。
按血统选配的含义是指以血统或家系为单元，在家系内或家系间开展有目的的选配，其意义在于保持并巩固场内各血统或家系的品质特征，保持不同的犬只类型，巩固其遗传性。可以有效地将不同血统公母獒所具有的性状与特征集合在一起，创造出理想的藏獒个体，也可以把各血统犬只所具备的优良性能和特征稳定下来，保持下去。按血统选配方法与按家系留种的方法应科学结合使用，一方面按家系留种，规定在世代更替中，必须为每只优良的种公獒留有一个儿子，以继承其血统。也规定为每只母獒留一个女儿，以保持其遗传性。这样可使各家系的特征得以保存。另一方面，并不排除各血统间或血统内公母獒间的交配。
按血统选配能最有效地促使优良基因的纯合，固定优良性状并保存某些优良个体的血统，使某一理想藏獒的品质性能尽快变成群体所共有，实现创造和培育优良藏獒的目标。
（3）按等级选配。即按《藏獒综合评定等级标准》对与配公母藏獒进行等级评定，确定公母藏獒的等级后，再确定公母藏獒的配对或交配。通常公藏獒的评定等级应高于母藏獒，每世代主配公藏獒应达到特级，不低于一级。而基础母藏獒或与配母藏獒应达到一级，个别具备独特性能或特征的母藏獒容许二级。公藏獒的等级按特级或一级要求，原因在于公獒影响面大，选择品种性能或特征优良的公藏獒配种，利于提高獒群的整体水平，并使藏獒群性状整齐，表现一致。
坚持等级选配，是全面推进藏獒系统选育，全面提高藏獒品质性能的必由之路。