在中国古代文献中，有关商代历史的记载比较少，连司马迁写《史记》时都觉得资料匮乏。而甲骨文的发现，正好弥补了史料记载的不足。甲骨文所涉及到的内容非常广泛，包括了农业、畜牧业、田猎，还有天文、历法、医学、祭祀等内容，为我们研究商代的历史提供了重要的资料。
特别是甲骨文本身的发现，在我国文字发展史上有着重大的意义。它是我国至今发现的最早的文字，有着严密的系统和规律。它不同于西安半坡遗址和河北篙城台西村遗址陶片上的类似文字的记号或象形符号。后者数量极少，既无系统又无规律，在严格意义上来讲不能算作汉字体系。甲骨文的发现，证明了中国在距今3500年前就已经形成了完整的文字体系。在甲骨上刻字，笔画只能直来直去，因此形成了中国方块字的风格。
甲骨文文字与现代汉字对照表甲骨文中对气象的记载比较详细，比如仅对雨量的描写就有大雨、小雨、系雨（毛毛雨）、沚雨（延绵不断地下雨）等。对雨的预报在一定程度上也比较准确，比如有一则卜辞是这样写的：己酉，自今旬雨？三月，辛亥雨。”其意思是：3月己酉这天卜问，从现在起，这一旬（十天）下雨吗？到了第三天就下雨了。这些预测从文字上来看似乎有些迷信，但是如果没有丰富的气象观察经验，是很难得出比较正确的判断的。这也说明了在中国的商代已经能对雨这种自然现象有所预报了。
甲骨文中对天文历法的记载更有价值。其中有关日蚀、月蚀、星辰的记载是世界上最早的有关天文学的宝贵资料，对于研究世界天文学史有着重要的意义。有一条这样的卜辞：“癸酉贞：日夕有食，非若？”意思是：癸酉这天卜问：如果傍晚有日蚀，是吉利还是不吉利？日蚀一般发生在白天，而此次可能发生在傍晚，因此商王很担心，才来占卜的。此外还有关于新星、新大星、鸟星、大星等星辰的记载。
除此之外，甲骨文中还有关于生男生女、狩猎是否顺利、征伐是否成功、奴隶在田间劳动会不会逃跑等内容。总之，丰富的甲骨卜辞为我们研究商代历史提供了大量而可靠的资料。
但是，围绕着甲骨文亦有许多未解之谜等待着人们去探索。比如甲骨文至今已发现了4500多个单字，但目前已辨识的只有2000个，剩余的2500多个单字尚不能辨认，大都是地名、人名或专用字。这也是甲骨学对现代学者所提出的一大挑战。在已辨识的字中，亦有无法认定含义的。如“日又哉”这一卜辞，有的人认为这也指的是日蚀，但亦有人认为这是最早的关于太阳黑子的记载。哪种说法正确，目前仍无定论。在甲骨文研究中，类似这样的问题还不少，如甲骨文中有关地名、河名的记载与现在的有关地名、河流有什么关系等等。
另外在20世纪70年代，在陕西周原遗址所出土的西周甲骨文，为甲骨学的研究提供了新的资料。但是，其中一块甲骨上的文字要用5倍放大镜才能看得清楚，那么在微雕技术还不发达的西周时代，这么细小的文字是如何刻上去的呢？至今仍是一个难解之谜。