九阜山自然保护区位于尤溪县西南部，面积2308公顷。保护区内最高峰是尖峰顶，海拔1222.4米。保护区的植被区划属于中国东部湿润森林区，中亚热带常绿阔叶林地带，鹫峰山北部常绿槠类林小区，具有典型的地带性森林植被——中亚热带常绿阔叶林。区内森林资源丰富，森林覆盖率达96%。区内分布的野生植物有171科1113种，野生动物有58科171种。区内山泉溪涧遍布。其中，九阜溪流最大，贯穿中部核心地带，总长约10千米，溪中多急流飞瀑，乱石险滩，水质极佳。保护区内为山地森林小气候，特点为四季均匀，温凉湿润，是避暑、旅游的胜地。2001年9月，尤溪九阜山被列为省级自然保护区。
大仙峰自然保护区位于大田县屏山乡许山村境内，总面积6893公顷，其中，核心区1848公顷。该区主要保护对象为国家一、二级重点保护动植物。大仙峰有主、次两峰。主峰海拔1553.4米，直插云霄，为大田县最高峰。山腰原有一座建于宋代的崇圣岩寺，寺庙占地2000多平方米，有上、下两佛堂、17个佛厅、70余间僧舍，占地2000平方米，可容纳千余人。该寺毁于1959年的山洪，惟留旧址。2003年初，大田大仙峰被列为省级自然保护区。
第四、河流
闽江源位于建宁县均口镇。福建省闽江流域规划开发管理办公室于1991年10月组织了地质、水文等有关专家对10条主要闽江支流进行了周密的考察，1992年2月又进行了第二次补充考察。根据“河源唯远”的原则，考察队得出结论：位于建宁县均口镇严峰山西南坡的水茜溪源头为闽江正源头。1992年2月，省闽江办在严峰山水茜溪源头处留下摩崖石刻——闽江源。同年7月，闽江办提出的《闽江源考察报告》，经省水电厅、测绘局、地矿局、师大地理系等单位34位专家教授认真审议后，获得一致通过，从而解决了学术界长期争议的闽江发源地问题。
沙溪为闽江流域的主要源流，发源于建宁县均口镇严峰山，其源头水茜溪向南流至溪口与泉湖溪汇合后称东溪，后向西南流至宁化合水口与西溪汇合后称九龙溪。九龙溪自合水口向东南流经鱼龙、横锁、肖家（宁化）、南岐、东华、嵩口、沙芜（清流）、安砂、永安市区，折向东北流至贡川镇，再向北流经莘口镇、三明市区、洋口仔、凤岗、高砂、青州镇至南平黄沙口，注入闽江。而贡川镇至洋口仔河段称为沙溪。
东牙溪位于三明市东南部，是沙溪河的支流，在三元区中村乡境内由东向西注入沙溪河，流域出口集水面积为184平方千米，主河道长30千米，年径流量1.62亿立方米，上游有居阳、筠竹、长祖坑、张坑、白水5条小支流。
角溪为明溪县内第一大河流，属富屯溪水系，由夏坊溪、中溪、盖洋溪等河流在夏坊乡李沂村的沙坪附近汇成，于盖洋镇北部的坂渡村流入泰宁县，流域面积671.49平方千米（境内543.61平方千米），河长48.35千米。
黄沙溪为明溪县内第二大河流，属沙溪水系，发源于沙溪乡梓口坊村，流经棉布、瑶奢、官洞等地，在车头坑村附近流入三明市境，河长46千米，流域面积560.06平方千米（境内542.06平方千米）。
渔塘溪源出明溪县城关乡五通凹，向东流经城关、瀚仙、沙溪村，途中多处与小溪汇合，流量渐大，从沙溪村起可通木船，下行至三明市区莘口镇汇入沙溪，全长52千米，集雨面积529平方千米，年平均流量8.15立方米/秒，天然落差305米。
燕江是永安市第一大河流，为九龙溪下游的一个河段（西门至兴平河段称燕江）。燕江得名由来因沙溪永安河段形式燕子的尾巴故名。燕江流域面积占全市总面积的83%。九龙溪经清流县嵩口入永安市安砂、曹远，折向西北至市区，经龟山公园、兴坪，从贡川出境，境内河道长78.7千米，集雨面积8000平方千米，年平均流量250立方米/秒，天然落差46.5米。已开发建成安砂水力发电厂和鸭姆潭水轮泵电站2个梯级电站。沿岸布有大中型工矿企业加福煤矿、福建化纤厂、永安火电厂、永安化肥厂等。
修竹湾为桃源洞风景区的一部分，是自永安市区北郊尾村以下的沙溪河中长约5千米的河段。这里水流平缓，两岸篁竹、石竹、斑竹茂密，成从成片，故名“修竹湾”。桃源洞风景区的主要景点大都在修竹湾沿岸。修竹湾的景色除茂林修竹绿水外，以临溪丹崖上的摩崖石刻最为突出。明代延平郡守梁永植盛赞修竹湾为“巫山不可及，蓬莱果如何”。
龙津河为九龙溪上游的一个河段（峰头至嵩口河段称龙津河），因位于九龙溪上游处且沿河山青水秀，风光绮丽，河水清澈见底，故得名龙津。其主要支流有基头溪、白石溪、小横溪、大横溪等。九龙溪呈S形流经清流城区，后流经东华、嵩口，注入永安安砂水库，其中县内河道长53千米，境内流域面积467平方千米，比降为万分之11.3，多年平均径流量1.972亿立方米。下游建有装机容量6400千瓦的嵩口坪水电站，水资源理论蕴藏量15606千瓦，已开发6800千瓦。
翠江在宁化县境内，为九龙溪上游的一个河段（从合水口至肖家河段称翠江），以宁化县城内有翠华山而得名，经鱼龙、横锁、水口、龙下、肖家流入清流境内，全长21千米。
西溪为翠江第二大支流，源自方田泗坑，流经方田、禾石漈至石壁镇纳石壁溪，至陂下纳刘村溪，至分水坳纳辛田溪，一路再纳村头溪、古武溪，经陈岗纳石漈角溪、雷溪，至介犁嘴上纳武层溪，至城关合水口与东溪汇合，溪长42.5千米。
均溪发源于大田县屏山乡的溪头下前溪（源头段俗称屏山溪），其支流主要有屏山溪、武陵溪、小湖溪、周田溪、仙峰溪、洪崎溪、湖美溪、和平溪、富裕坪溪，流域面积1271.2平方千米（县境内1039.9平方千米），经梓溪、坑口、石牌、城关、京口、昆山、高才，于富裕坪出境，与文江溪汇合于街面七里潭入尤溪。
文江溪发源于永安市青水乡，经槐南乡于鲤鱼坑入境，经下坪、桃舟、大安、朱坂、文江、大中、德州、沧州、大安坂至璞溪口，与璞溪小溪汇合后，于尤溪街面七里潭与均溪汇合，流域面积1385.5平方千米（大田县境内838.2平方千米）。其主要的支流有朱坂溪、铭溪、广平溪、奇韬溪、建设小溪、民主小溪、梅山小溪、张地小溪和汤泉小溪。
尤溪尤溪上游有二源：一是均溪，发源于大田县南部，在坂面镇街面村流入县内；二是文江溪，发源于永安市青水乡南部，流经大田县（中下游约有10千米流经尤溪县新阳镇高士、中洋村，称赤目溪），在坂面镇厚禄坪村流入县内。两溪在下尾自然村汇合后始称尤溪。尤溪由西南向东北流经坂面、城关、梅仙、西滨和尤溪口等5个乡镇，注入闽江。主要支流（指流域面积50平方千米以上的支流）有新桥溪、溪口溪、街面溪、京口溪、清溪、台溪、青印溪、新洋溪、源湖溪、吉木溪、华兰溪、际后溪等。
青印溪发源于尤溪县西部八字桥乡玳瑁山北麓，经坑头、八字桥、洪田、柳塘（水库）、湆头、西城，于城关入尤溪，长55千米，以城下河道中有大青石如印而得名。主要支流有西溪口溪、管前溪、文峰溪、东村溪、七尺溪。溪口建有公路桥，名青印桥，为闽沙公路所经行。
虬溪为沙县最大河流，是沙溪自三明洋口仔附近入境后在城区河段的别称，沙溪由西南向东北横贯县境，在青州镇洽湖下7.5千米处的沙溪口与富屯溪汇合流入南平市，县境内全长约50千米，流域面积约1800平方千米。
东溪为沙溪在沙县境内最大的支流，呈北——南流向，自茂溪始至城关东门流入沙溪，主河道全长约63千米，县内流域面积约823平方千米。东溪上游的三大支流为夏茂溪（又称茂溪）、高桥溪和富口溪（又称富溪）。诸流在高桥镇桂口、马山石口汇入东溪。
洛溪又称豆土溪，全长41.7千米，流域面积109平方千米。上游有三大支流，最长的支流发源于沙县湖源乡东南的大帽山。另有两条支流，一条发源于沙县南霞乡龙泉，称龙泉溪；另一条发源于沙县牌坊岭，称溪源溪。两条支流在双溪会合后进入虬江境内，在虎跳和洛溪会合，由南向北经罗布从洛溪桥注入沙溪。
金溪因上游产砂金而得名，为三明市第二大河流，也是闽江上游富屯溪重要的支流之一。由宁化宁溪（发源于宁化安远乡武夷山麓）和建宁澜溪（发源于建宁客坊乡中畲）自宁化合水口汇合后始为金溪。金溪自合水口向东北经濉溪镇、器村、袁庄入泰宁县，后经茅店、杉城镇、池潭（水库），从万全乡界头村入将乐县境，流经万全、常口、大言、将溪、黄潭、祖教、肖坊、孔头、蛟湖、城关、积善、高唐、会石等地，于高唐镇黄坑口村出境，流入顺昌富屯溪。境内河道长80.3千米。
上清溪位于泰宁县东北部、金湖的上游，发源于上青乡川里村，穿过上青腹地，经杉城镇长兴村，于瑶坪上流入朱口溪。上清溪全长50多千米，其中从崇际至长兴段，曲折绵延15千米，现已开发为上清溪峡谷生态漂游景区，有“华东第一漂”之称。其沿岸幽奥的丹霞地貌与武夷山风景区的九曲溪和武陵源著名的金鞭溪相媲美，全程九十九曲、八十八滩、七十七弯、六十六峰、五十五岩、四十四景。上岸处有两大人文景观：一为我国著名道仙梅福隐居炼丹处——栖真岩，距今2000多年；另一处为宋朝曾任工部、刑部及礼部尚书的邹应龙少年读书处——状元岩，距今1000多年。