1956年成立国防会议。1986年7月“安全保障会议”取代原“国防会议”，负责处理各种突发事件和一切与国家安全有关的重大事宜，由首相任主席。防卫厅隶属总理府，长官由文职人员担任，受首相之命，通过陆、海、空军幕僚长（参谋长）统率陆海空自卫队。2006年6月，日本政府通过了将防卫厅升格为防卫省的法案，并提交国会审议。同年12月15日，日本参议院全体会议投票通过了将日本防卫厅升格为防卫省的相关法案。由于众议院此前已经批准了这项法案，所以在获得参议院的批准后，相关法案将正式生效。从2007年1月9日起，防卫厅正式升格为防卫省，防卫厅长官也随之升格为防卫大臣。
统合幕僚会议（参谋长联席会议）是防卫厅长官的辅助机构，负责拟定和调整三军的作战、训练和后勤补给计划，搜集分析军事情报。
2006年3月27日，日本防卫厅设立统一指挥陆海空自卫队的统合幕僚监部（联合参谋本部），取代过去的统合幕僚会议。日本陆海空自卫队的幕僚长过去分别听从防卫厅长官指挥，各自向所属自卫队下达命令。
今后，统合幕僚长将在防卫厅长官授权下，统一指挥陆海空自卫队，并在“紧急”情况下组建“统合任务部队”，执行弹道导弹防御、大规模地震救灾、国际救援等任务。
自卫队的最高统帅是首相，最高军事决策机构是内阁会议。“安全保障会议”是内阁在军事上的最高审议机构，由首相、外务大臣、财务大臣、内阁官房长官、国家公安委员长、防卫大臣等内阁主要成员组成，负责审议国防方针、建军计划及处理各种突发事件等。防卫省相当于国防部。参谋长联席会议由主席和陆、海、空军参谋长组成，负责拟定和调整三军作战、训练和后勤计划，搜集研究军事情报，在实施两个军种以上的联合作战、演习时，实施统一指挥。
第五节 日美同盟为轴——日本外交
日本外交政策的基本取向是坚持以日美同盟为核心，以亚洲为战略依托，重视发展大国关系。重视加强日美安全合作，同时致力于稳定对华关系，深化与东盟关系，加强对欧关系，改善日俄和日朝关系。
积极参与地区和国际政治、经济和安全事务，力争成为联合国安理会常任理事国。
知识小百科
联合国安理会常任理事国
联合国安理会常任理事国是联合国安全理事会中的5个创始成员国，是“二战”期间反法西斯同盟国中除法国外的4+1个大国。（法国在1940年战败，被德国占领，故没参加反法西斯同盟）。
“二战”结束后，同盟国成立联合国。其《联合国宪章》第二十三条第一款中明文规定：“中华民国、法兰西、苏维埃社会主义共和国联盟、大不列颠及北爱尔兰联合王国及美利坚合众国应为安全理事会常任理事国。”
1971年，中华民国的席次为中华人民共和国所代替。
1991年，苏维埃社会主义共和国联盟的席次为俄罗斯联邦所代替。
同美国的关系上，1945年9月至1951年9月，日本处于美国直接军事占领之下。1951年9月8日，美日签订《对日和平条约》（即《旧金山和约》），结束对日本占领。同日，日美签订《日美安全保障条约》，结成军事同盟关系。1960年1月19日，日美修改该条约。根据条约，两国将共同发展和维持抵抗军事攻击的能力，对任何一方的军事攻击将被视为对另一方安全的危害，若美国在日本领土外遭到攻击，日本为了防卫美国将不受宪法上任何禁止境外军事行动的限制。1996年4月17日，日美发表《日美安保联合宣言》。1997年6月，日美发表新的防卫合作指针中间报告，提出“周边事态”新概念。同年9月双方批准最终报告并发表联合声明。2010年1月，日美两国外长和防长就《日美安全保障条约》修订50周年发表联合声明说，两国将进一步深化在广泛领域的安保合作。
2006年5月1日，日美再次举行安全磋商委员会会议（“2+2”会议），就驻日美军重新部署达成一致，发表日美《关于实施驻日美军重新部署的路线图》以及“2+2”会议联合声明。
按照计划，2014年底前，1.8万人的驻日海军陆战队中，约8000人将转移至关岛，日本将支付的相应费用预计高达28亿美元。同时，美国将把冲绳县美军普天间基地移至同县名护市。
“9·11”事件后，日本全力支持美反恐行动。奥巴马当选美国新总统后，日美同盟将继续强化。日本前首相鸠山由纪夫2009年10月表示，日本将在地区和全球问题上与美国加强合作，深化“多层次的”日美同盟关系，并在这种信赖关系之中坦率地就两国间悬而未决的问题进行对话。
2009年12月11日，美国与日本达成一项“开放天空”航空协议，以促进两国人员和货物运输航空服务。根据这项协议，美日双方将取消目前对两国航空公司在飞行线路、目的地、班次乃至定价等方面的限制，允许两国航空公司依据市场需求选定或调整飞行线路以及航班次数。此举将大大减少两国对民航业的种种限制，有利于促进航空业的发展和保护消费者的利益。
大选期间，民主党承诺会在日美外交政策上表现得相对独立，并谴责自民党对美国卑躬屈膝的态度。执政的民主党人希望摆脱对美国的依赖，想让同盟关系表现得更为平等。
在同欧盟的关系上，伴随欧盟一体化程度提高，国际地位上升，日本近年不断扩大与欧盟在各个领域的对话与合作。双方政治上保持协调，经济上扩大合作。1994年起日欧建立“规则改革对话”机制，每年轮流在东京和布鲁塞尔开会。
在同俄罗斯的关系上，1991年12月苏联解体后，日本立即承认俄罗斯联邦政府，承认其他共和国独立。北方领土问题是影响日俄关系发展的主要障碍，迄今双方已举行多次谈判，未取得实质性成果。日本希望将政治和经济作为两个车轮同时推进，致力于最终解决双方之间最大的悬案北方四岛问题，并与俄罗斯缔结和平条约。日本将把俄罗斯定位为其在亚太地区的伙伴，强化对俄关系。
在同韩国的关系上，日韩两国于1965年12月缔结基本关系条约并建交。近年来，两国关系因历史问题和岛屿（日称竹岛、韩称独岛）归属问题而受影响。
在与中国的关系上，中日两国是一衣带水的近邻，自古以来交往频繁。1972年9月29日，中日两国签署《中日联合声明》，实现邦交正常化，翌年1月互设大使馆。中国在大阪、福冈、札幌、长崎，日本在上海、广州、沈阳和香港地区分别开设总领事馆。日本在大连设有驻沈阳总领馆办事处，在重庆设有驻华使馆领事部办事处。1978年8月12日，两国签署《中日和平友好条约》，同年10月邓小平副总理访日，双方互换《中日和平友好条约》批准书。
1998年11月，江泽民主席对日本进行国事访问，这是中国国家元首首次正式访日，中日两国发表了《关于建立致力于和平与发展的友好合作伙伴关系的联合宣言》。
2006年10月8日至9日，安倍晋三前首相对中国进行正式访问，中日双方发表联合新闻公报，双方同意，努力构筑基于共同战略利益的互惠关系。2007年4月，温家宝总理对日本进行正式访问，双方发表了《中日联合新闻公报》，就构筑“基于共同战略利益的互惠关系”达成了共识。
2007年8月底，国防部长曹刚川对日本进行正式友好访问。同年９月，全国政协主席贾庆林对日本进行正式友好访问。2007年12月27日至30日，福田康夫前首相对中国进行正式访问。2008年5月6日至10日，胡锦涛主席对日本进行国事访问，胡锦涛和福田康夫签署了《中日关于全面推进战略互惠关系的联合声明》，中日两国发表关于加强交流与合作的联合新闻公报。2008年6月18日，中日两国政府同时宣布，双方就东海问题达成原则共识。2009年4月29日至30日，日本前首相麻生太郎对中国进行正式访问。2009年9月21日，中国国家主席胡锦涛在美国纽约出席联合国系列会议期间会见日本前首相鸠山由纪夫，就中日关系和共同关心的问题交换意见。2009年11月，国务委员兼国防部长梁光烈与日本防卫大臣北泽俊美举行会谈并发表《中日防务部门联合新闻公报》，并就今后的主要交流达成9项共识。