1966年8月26日上午，82名搜查员来到神户市滩区条原本町，对田冈一雄的豪宅进行搜查。搜查一直进行到黄昏，连庭院的石灯笼底下也被挖了一遍。警方查缴了数额巨大的股票、存折等有价证券。
与此同时，警方陆续搜出田冈藏在他处的财产。9月底在田冈的一个亲戚处搜出现金8600万日元；10月初在三友企业一个职员家中，搜出用橘子箱装着的现金1.32亿日元；另外交给组员曾承光男隐藏的4300万日元，和地道行雄隐藏的2800万日元，全被警方搜缴了。
紧接着，又传来十九组解散的噩耗。十九组是山口组属下的中坚组织，做的是金融生意，被指控违反高利贷条例。1966年10月13日，55名警员搜查了十九组事务所。10月15日晚，组长松本国松来到田冈的病榻前讨教对策，田冈看出十九组人心已散，只好痛心地答应他们解散。
松本国松为了彻底脱离干系，声明与田冈一雄断绝一切关系。继冈精义和安原武雄之后，松本国松是第三个和田冈绝交的。
山口组的最高决策机构“七人众”至此只剩4人，其中支持山口组解散的地道行雄被逮捕，松本一美、藤村唯夫病倒在床，能够自由活动的，只剩下神户艺能社长三木好美孤零零的一个人了。
当时，田冈发表了这样的慨叹：“人们都是以自己为本位，觉得自己至关重要，自身处于危难时，就会无情地放弃信念，抛弃友情，只想自己残存。”又说：“一起处于美满状态时，很容易融洽相处，但一到危急关头，人就很容易变。大家平时都不过是装模作样地披着美丽的羊皮生活而已，一旦到了生死关头，才开始明白人类的真正价值。就算只领悟到人性的悲哀，对我也是很宝贵的一课。”
噩耗继续传来———
1966年10月28日，坂口组解散。
1966年11月7日，石井组解散。
田冈依然冥顽不化：“金崛部长扬言要把我送进监狱，想起这话我就生气！就算只剩下我一个人，我也绝不会让山口组解散！绝不解散！绝不……”
1966年12月5日，山口组“七人众”之一的藤村唯夫，因肝病死于日本国立大阪医院。对田冈而言，这是伤口上撒盐。
为了垂死挣扎，经田冈同意，山口组花重金保释被捕的支柱人物。1966年12月7日，冈精义以日本有史以来第一巨额的保释金1200万日元被保释出来。12月12日，地道行雄也以200万日元被保释出来。
1966年12月13日，山口组“事始仪式”在愁云惨雾的气氛中举行。田冈没有出席，只让人带去几句话。20分钟便散会了，晚宴也没举行。冈精义、地道行雄虽被保释在外，但没有出席仪式。山口组“七人众”中只有三木好美一人参加。
自冈精义被捕以来，到1967年初，8个月的时间内，山口组共有129人被拘捕。新年伊始，警方更是实行“推土机战略”，对残存的山口组大小头目展开攻击。这时，田冈病倒在床上已超过一年半。田冈称这是一个“漫长的、万念俱灰的雌伏岁月”。
1967年1月11日，因糖尿病住院的山口组总干事助理菅谷政雄，因涉嫌恐吓被捕。1月23日，大阪府警方以涉嫌赌博为罪名，逮捕了沟桥组组长沟桥正夫属下14人。
1967年7月21日，兵库县警总部部长金崛一男，因围剿山口组有功，荣升九州管区警察局局长，他的职位由大阪府警察总部的警务部部长松元秀之接任。兵库县警总部对山口组实施剿灭政策，首先把目标对准山口组内部反对解散帮会的小西音松。按照“先挖基石”的策略，8月4日，首先逮捕了小西音松的把兄弟、重本组组长重本国，然后才将小西音松这棵大树砍到。小西会是山口组在广岛的最大下属组织，会长便是小西音松。
1967年8月，小西组属下的打越会被迫解散，组长打越信夫成了散兵游勇。9月7日，盘踞在四国今治，并在松山发展了12个团体的矢岛组组长矢岛长次被捕。
山口组的外围组织遭到毁灭性的打击，警方乘胜追击，把网口渐渐收拢，最后决定依据掌握的罪证，对病床上的田冈一雄进行审问。对田冈一雄的轮审，于1967年11月6日开始断断续续进行了两个多月。
这个时期，山口组内部一直在讨论组织解散问题，但是迟迟未决。这主要受到田冈“绝不解散”的立场的影响。
这时山口组属下最精锐的力量———柳川组也受到围剿。柳川组总部设在大阪府，而属下小组织则辐射到整个日本。柳川组组长是柳川次郎，他紧紧追随田冈一雄，坚决拒绝解散。早在1966年，警方刚开始围剿山口组的时候，曾出动大批警察在一次大规模的扫黑行动中，突袭了山口组设在兵库县的本部，杀死、捕获了数百名山口组成员。不久田冈一雄组织反击，以柳川组为主力的山口组成员对警察进行疯狂反扑，许多日本警察被打死，警方居然抵挡不住被迫撤退。初战失利，日本警方大丢颜面。
为挽回公众形象，1967年，日本出动数千名警察，在广岛等地展开了一场惊心动魄的“仁义之战”，目标是消灭山口组中最精锐的部队———柳川组。警方这次设下圈套，围点打援，先以小股精锐部队佯攻柳川组本部。柳川组当时在本部只有几十人，但多为骨干。面对警察部队，柳川组殊死抵抗，无奈寡不敌众，忙向田冈一雄求救，待田冈派来的地道中雄等四大金刚赶来时，却发现已陷入警察的重重包围之中。一番垂死挣扎后，这些亡命之徒死伤惨重，剩下的人见大势已去，只好投降。
1968年春夏之交，大阪警方对柳川组实施包围，步步紧逼。1968年4月上旬，大阪警方出动180名搜查员，设立“柳川组集中取缔总部”，意欲将柳川组彻底粉碎。在短短7天之中，警方连续发动袭击，先后逮捕了87名柳川组组员。进入1969年，柳川组属下最大组织神田组解散，第二代柳川组组长谷川康太郎又被指控涉嫌恐吓罪，行将入狱。谷川康太郎设法与在名古屋监狱服刑的首任组长柳川次郎取得联系，经过商议，终于在4月9日，向大阪府警方声明解散柳川组，并传令全国的柳川组各下属组织统统解散。
1969年4月25日，神户地方检察府根据警方提供的罪证，指控山口组第三代头目田冈一雄，涉嫌两项恐吓罪和一项以无形压力妨碍业务罪，并向神户法院正式提出诉讼。
“起诉也好，公审也好，希望能借此证明我的清白。假如硬要把我当成罪犯，我便要叫他们看看我的男儿本色！”瘫卧在床，瘦得皮包骨头，体重剩下42公斤，年届57岁的田冈一雄如是说。