母种是一级种，是生产其他菌种类型的原始种。母种一般以玻璃试管作为容器，菌丝生长在斜面培养基上，因此又叫试管种。母种要求纯度高、质量好，一般生产单位均从有信誉的科研单位购置母种，然后再转管扩大培养。
母种培养基是分离母种或扩大繁殖母种用的培养基。制作平菇母种培养基，常用以下配方。
（1）马铃薯琼脂培养基（PAD培养基）。马铃薯（去皮）200克，葡萄糖20克，琼脂20克，水1000毫升。
（2）马铃薯琼脂综合培养基。马铃薯（去皮）200克，葡萄糖20克，磷酸二氢钾3克，硫酸镁1.5克，维生素B110～20毫克，琼脂20克，水1000毫升。