公元2020年，因未知原因，数码世界与人类世界的大门开启，一时间，数码世界和人类世界交汇通融，双方遂签订协议，和平相处，但是却仍有些不安定的势力在阴影之下蠢蠢欲动……
对此，世界树?伊古德拉希尔010：瑟蕾娜开展了『北斗计划』。
故事，也便从『北斗计划』的成员之一开始了。
