藏传佛教五大教派之一，由西藏昆氏家族的后代昆·贡觉杰布创建于公元1073年，因该教派主寺萨迦寺所在地呈灰白色，故得名“萨迦”（藏语意为“白土”）。由于该教派寺院围墙涂有象征文殊、观音和金刚手菩萨的红、白、黑三色花条，故又称“花教”。贡觉杰布从创教开始就决定，法位以家族相传的形式向下延续，使政教两权都集中于一个家族之手。
花教在形成教派体系、扩大宗教影响、伸展封建势力的过程中，出现过历史上著名的“萨迦五祖”。其中，萨迦四祖萨班智达·贡噶坚赞，于公元1247年受元太宗之皇子阔端的邀请，携侄子八思巴到凉州，商洽西藏归顺元朝的条件。之后，由萨班撰写了著名的《致西藏僧俗的书信》，联络西藏各个封建势力归顺元朝。萨班去世后，忽必烈召见萨迦五祖八思巴，封八思巴为“国师”、“帝师”、“大宝法王”。八思巴还在藏文的基础上，创建了蒙古文字。萨迦派也由此成为元朝在西藏统治的代表。明朝时期，萨迦派高僧贡噶扎西前往南京朝见永乐皇帝，受封为明朝三大法王之一的“大乘法王”。