首先是在《水晶头骨之谜》中描述的，它具有催眠的作用，安娜称当人注视水晶头骨的眼睛时就会被催眠。有关专家猜测，水晶头骨很可能是玛雅人在医疗上使用的一种工具。其次安娜还提到，水晶头骨在光的照射下会发出蓝色的光，而且将它放到电脑前时，曾多次导致了电脑硬盘“崩溃”。
那么，水晶头骨真像美洲传说的那样有着神秘的力量吗？科学又将对水晶头骨作出怎样的解释呢？
水晶头骨是一个天大的谎言
说水晶头骨具有催眠作用，真是这样的吗？科学家们认为，水晶是一种神奇的东西，它晶莹剔透的质感很容易令人着迷，再加上头骨的造型就更容易产生催眠的效果，因为一般人看到头骨就很容易联想到死神和死亡，将水晶雕刻成头骨的样子，科学家认为水晶本来就具有的催眠作用一下子就增强了，所以容易受到暗示的人就会被它催眠，产生幻听、幻觉，那么水晶头骨具有催眠的作用是很自然的事情了。
2005年，一份调查报告的出炉，让人觉得一直以来都被一个天大的谎言欺骗了。究竟是怎么回事呢？2005年1月，一起震惊考古界的事件发生了:英国不列颠博物馆的墨西哥古阿兹特克人的水晶头骨被科学家正式鉴定为是赝品，考古界为之哗然。英国不列颠博物馆所珍藏的水晶头骨，据称最早是在墨西哥古阿兹特克人遗址上被发现的。而科学家发现这个水晶头骨是用轮式工具打磨并且切割的，而这种技术在当时的美洲大陆根本就不存在，人们便疑窦丛生。米歇尔·黑吉斯头骨自然也成为人们首先发力的质问对象。
虽然这两颗头骨的来源不同，但总体形状却非常相似，而且都是以一具女性头骨为模型，不同的是，不列颠博物馆的头骨是一整块水晶，而米歇尔·黑吉斯头骨的下颌则是独立的，可以拆下，做工更为精致，但是两颗头骨的惊人相似，让人很难相信它们是独立制作的。
调查者还发现，在印第安人中，只有古阿兹特克人有雕刻头骨的习惯，而古代玛雅人并没有这样的习惯，这就更使得笼罩在这颗头骨上的神秘光环显得越来越虚假了……
而且这块水晶头骨的拥有者安娜的陈述也露出了很多破绽。她在1962年接受采访时说，水晶头骨是在三十年代末，由她的父亲在一次挖掘玛雅遗址的时候发现的；1968年，她给一个研究水晶头骨的专家写信时又说头骨是在1926年发现的；1982年，她回答学者尼克尔的询问时称，发现头骨的日期是1924年；最后在1995年出版的《水晶头骨之谜》里，又说水晶头骨是在自己17岁生日那一天发现的。前后的矛盾更加深了人们对它真实来历的怀疑。
2008年，由英国和美国科学家组成的研究小组使用电子显微技术和X射线结晶技术对不列颠博物馆和美国史密森尼博物馆内珍藏的水晶头骨进行了检测，水晶头骨表面的详细分析显示，在眼眶、牙齿和头盖骨附近有极细微旋转划痕，很明显这种切割打磨技术源自一种叫做“旋转轮”的珠宝加工设备，而古玛雅人并未掌握这种加工技术，这种工具在前哥伦布时代的美洲大陆上根本就不存在。研究人员推断这些水晶头骨是在欧洲加工制造，其材料是巴西无色水晶。很可能是这些水晶头骨制造完成后，又被作为古玛雅阿兹特克人的神秘遗物出售给收藏家，目前许多博物馆都取消了水晶头骨展示，对其来源产生质疑，认为它并不具备考古研究价值。
为了确定水晶头骨中的佼佼者“米歇尔·黑吉斯水晶头骨”的价值，有关方面曾请求其拥有者安娜对其作个鉴定，但此提议遭到了否决。
众多疑惑开始让人觉得，所有关于头骨的传言只是一个不实的谎言，所谓的预言就更不可能是真的。但那些水晶头骨的忠实拥护者却始终不肯相信这一点。
他们指出，古代玛雅人并非做不出在解剖学上很精确的头骨来，他们不是一群无知的人，而是数学、天文学和历法方面的专家。他们所拥有的技能可以与现代技术相匹敌，甚至还可能超越。毕竟我们对玛雅文明并不十分了解，但是从现在的考古发现来看，又没有确凿的证据能够表明古代玛雅人真的曾经拥有过水晶头骨。有一些证据倒是能表明古代玛雅人有可能制作过水晶头骨，但也有另外一些证据表明，是后来的阿兹特克人和墨西哥中部及高原上的印第安人制作的。这些古代人都善于在水晶上雕刻一些美丽的物品，也很频繁地使用过头骨这一意象。
有人还指出，现在被发现的水晶头骨大多是纯度很高的天然水晶，其自身就十分珍贵，人们没有必要把它做成一个赝品。
甚至还有极端者指出，不列颠博物馆的鉴定只是一个陷阱，他们想借虚假的鉴定来将所有头骨聚集起来，好获得头骨中的信息。
迄今为止，除了不列颠博物馆中存在的三个水晶头骨外，其他私人收藏的水晶头骨都未曾作过类似的鉴定，我们也无法分辨谁真谁假，当然，这一切对我们而言仍然是个谜。如果传说是真的，2012年12月21日这天又会发生什么呢？
“千年”不腐尸身的奥秘
我们都知道，生物圈中存在大量的分解者，它们是世界赖以生存的一部分，它们能分解复杂的动植物尸体，并释放出为生产者所能重新利用的简单化合物，如果没有它们，那么整个生物圈将无法运行，这个地球也将因此覆灭。人作为一个生活在地球上的有机体，在死后尸体被这些分解者吞噬，是自然的现象，但所有理所应当的事情总难免出现一些意外，在人类历史上就曾出现过很多令人疑惑的“不腐尸身”。
史上最知名的古尸——埃及“木乃伊”的奥秘
据我们所知，埃及人有着长久的制作木乃伊的传统。古埃及人相信人的生命在死后还会继续，认为完整的尸体是灵魂在来世栖息的必要场所。因此，他们对死后保存尸体和对生前保持身体的健康同等关切。制作木乃伊是古埃及特有的传统，也是古埃及文明留给后世的一份特殊的遗产。制作木乃伊的技术，是在长期的实践过程中逐渐积累和提高起来的。人们知道当时的古埃及人已经掌握了相当先进的防腐技术，要不然他们也无法做出那么多完美的木乃伊来，但可惜的是古埃及人没有为后人留下有关木乃伊制作方法的记载。有人说，木乃伊的制作方法是不外传的，不能记载，只能口授，因此，当那些技师与技艺逐渐消失后，就再也没人知道怎样制作木乃伊了。
随着科学技术的进步，我们才得以逐渐了解木乃伊的整个制作过程。我们知道古埃及人制作木乃伊时，制作师先通过鼻腔吸出脑髓，注入药物洗净脑部。然后在腹部拉一个口子，取出肺、胃、肠等器官，体内留下心脏。再用椰子酒和捣碎的香料冲刷体腔，填入树脂、浸过树脂的亚麻布和锯屑等物，照原样缝好。尸体要全部埋入氧化钠中进行干燥。等到70天后，制作师再次取出尸体进行清洗，并在上面涂上油膏和香料，用大量的亚麻布包裹严，外面涂上树脂。包扎时，从手指和脚趾开始，要特别小心防止指甲脱落。腹部的切口处盖上盖子。这样包裹好的木乃伊，才能保持脱水前的形状。有的木乃伊头上还套有特别的面罩，酷似死者生前的面貌。
制作木乃伊的时间长、费用昂贵，除需要各种药品、香料、避邪物、护身符等，仅包一个尸体，有时就要用1000多米的优质亚麻布。因此，只有国王、皇亲国戚、贵族富豪才花销得起，穷人只能从简，甚至草草了事，大约只要几天时间就可以完成。皇室木乃伊的制作，时间可以长达数月。
但古埃及人究竟是使用什么药物对尸体进行防腐处理的还有待进一步研究，有考古学家指出，古埃及人很可能是利用中东地区提炼石油的焦油来制作木乃伊的。专家认为，埃及人显然发现了焦油的奥秘，它能起到天然的防水作用，在焦油的防水保护下，对尸体具有毁坏作用的潮气很难进入，因此用它处理过的尸体更容易保存。那么他们究竟是不是这样做的呢？我们无从得知。
最美丽的古尸——法国圣女百年不腐尸身
她是天主教会正式受封的圣女，已经过世100多年，但现在众多朝圣者还能看到她生前的样子，她就是法国圣女——贝尔纳黛特·苏毕胡。很早以前，她只是法国卢尔德的一名普通的农村少女。自从14岁开始，她曾多次梦见过圣母马利亚，不久她便离开了家人选择在讷韦尔的修道院修行。这名性格温和的修女终生体弱多病，但她却时常使周围人感受到鼓舞。在天主教会正式封她为圣徒前，所有认识她的人都认为她是圣人。