那是遥远的古代，世界的统治者是天神宙斯。宙斯很不喜欢人类，经常给他们降下灾难和痛苦。有一次，宙斯突然又发怒了。他决定要消灭人类，使世界上没有一个人生存。他放出南风，驱赶乌云，电闪雷鸣，降下倾盆大雨；他指派海神波塞冬，带领天下所有的河川，去淹没田野和村庄。
顷刻之间，大地变成了一片汪洋大海。人们还来不及想想是怎么一回事，就被洪水夺去了生命。有一些人爬上荒山，荒山上只有杂草和苔藓。成熟的庄稼在哪里？美丽的家园又在哪里？他们看不见，只看见洪水滔滔、滔滔洪水。他们无家可归，没有粮食充饥，没有衣服挡寒，又冻又饿。后来，这些荒山也被洪水淹没，他们也一个个淹死在洪水里。
宙斯坐在俄林波斯山上，看到人间的一切，十分得意。他狂妄地自言自语：“人类呀，你终于按照我的意志完全毁灭了。呵，我的意志是不可抗拒的！”
宙斯长久地欣赏着人间的灾难。他看呀，看呀，突然笑容从他的嘴角消失，眉头结成疙瘩。他指给众神看：“怎么那里还有两个人？他们驾着小船在洪水中漂流。我不允许他们留存下来。”于是，他又呼喊海神波塞冬，命令他去把幸存下来的两个人淹死。
那驾着小船在洪水中间漂流的，是一男一女。男的叫丢卡利翁，是英雄普罗密修斯的儿子；女的叫皮拉，是丢卡利翁的妻子。他们乘坐的这只船，是普罗密修斯制造的，是一只永远不会沉没的小船。他们的桨被洪水冲走了，只好从水中捞起两根大树枝当桨。渴了，喝一口污浊的水；饿了，从水中捞起一些漂浮的葡萄吃。他们划了很久很久，好不容易才看见帕耳那索斯山。现在陆地上只有这座山的山峰露在洪水上边了。看见这座山的山巅，好象在黑暗中看见一线光明。他们增加了勇气，用力向前划去。
这时，海神带着南风赶来了。狂风卷起巨浪，好象要把小船撕碎。皮拉手中的树枝被洪水卷走了。她双手紧攀着船舷，绝望地哭泣起来：“呵，呵，宙斯呀，难道你真的连一条生命也不存留？呵，呵，狠毒的宙斯呀！”
丢卡利翁紧握着树枝，拚命同风浪搏斗。他有足够的勇气，又有父亲普罗密修斯教给他的驾船的经验。小船在风浪中穿行，象一片树叶一样。虽然被风浪任意抛掷着，但始终没有沉没。
丢卡利翁听见妻子的哭泣，就鼓励她：“小船不会沉没的，人类也不会毁灭，皮拉，鼓起勇气来！”最后，他终于战胜风浪，把小船划到了帕耳那索斯山。夫妻二人摆脱了洪水的威胁，登上了山顶。
宙斯看到洪水没有吞没丢卡利翁夫妻两人，气得干瞪眼。过了一些时，洪水慢慢退去。海水回到海洋，河水回到河床。群山、树木、平地先后显露出来。大地复原，荒凉而寂寞。没有了活动的人群，树木只剩下光秃秃的枝条。
皮拉看到荒凉的陆地上，只剩下他们孤零零的两个人，不禁落下泪来：“危险是过去了，但在这荒凉的世界上，我们两个孤独的人又能做什么呢？”
丢卡利翁说：“我父亲普罗密修斯曾经创造了人类，我也要让人类获得再生！正义是不可战胜的，走，我们找正义女神去。”
他们走到山顶，来到正义女神忒弥斯的神庙前。神庙已经荒废了，但忒弥斯的神像还在那里。看上去，她慈祥而善良，不象宙斯那样凶狠。他们在神像前跪下，向着永生的女神请求：“女神呀，请告诉我们，人类怎样才能获得再生？”
“你们到山坡上去，”一个声音回答。“把母亲的骨胳抛到身后。这样，你们就会有很多很多的伙伴了。”
他们听不懂这谜一样的话语，闷闷不乐地来到山坡，坐在一块草地上。皮拉忧郁地说：“女神说的什么呀？我们到哪里去找母亲的骨胳呢？”
沉默了很久，丢卡利翁忽然说：“我知道了，大地生长万物，供给我们吃的和穿的，她就是我们的母亲呀！这坚硬的石头，不就是母亲的骨胳么？”
皮拉仔细想了想，觉得丢卡利翁猜得很对。于是决定试一试。他们来到一处石头最多的地方，把石头一块一块地向身后丢去。
一块块的石头，顺着山坡往下滚，骨碌骨碌，一直滚到山脚下。这时，一个奇迹出现了：石头一滚到山脚下，就变成了一个个活生生的人。男人抛出的石头变成男人，女人抛出的石头变成女人。丢卡利翁和皮拉不停地丢呵，丢呵，丢了九天九夜，山脚下聚集了成千上万的活人。
从此，帕耳那索斯山上山下又出现了活动的人群。丢卡利翁带领他们盖房子，开荒种地，饲养家畜，靠自己的双手重建家园。后来，这些人群分散到各地，从事开发和建设，创造了更美好的世界。