骨由骨矿物质和有机骨基质两部分组成的。由于骨细胞的活动，新骨不断形成，旧骨不断破坏，同时骨细胞代谢产物从骨中释放到血液中去，所以检测血、尿、便中这些物质的含量，可以间接地了解骨代谢的情况。生化检查测定的项目有：
（1）血钙和磷：根据骨质疏松发病过程中的变化，血钙和血磷可以偏高，有时血钙低而血磷高。一般情况下，均在正常范围，不是诊断骨质疏松的特别指标；（2）血清碱性磷酸酶（ALP）：是反映骨形成和转化的指标。在骨质疏松发病活动期，血清碱性磷酸酶活性增高；（3）尿羟脯氨酸（HOP）：反映骨基质的代谢情况，它与骨质吸收有关；（4）其他：反映骨代谢调节的化验检查有许多，如甲状旁腺素（PTH）、降钙素（CT）、雌激素（E.2）等。
生化检查只反映体内骨代谢情况，说明骨质疏松的病理变化，可作为骨质疏松诊断参考，不是特异性指标。
骨质疏松并非是一种单纯纯的疾病，很多疾病可以引起骨质疏松，而骨质疏松又可导致其他疾病，互为因果，这就要求要从多方面去考虑骨质疏松的防治。