1986—2001年，仍保持县、区、乡（镇）三级农机管理服务体系。2002年起，县对乡镇实行农机化目标考核，农机化管理服务职能由乡镇农业服务中心履行，县农机局组织考核。《中华人民共和国农业机械化促进法》、《中华人民共和国道路交通安全法》、《四川省农业机械管理条例》颁布实施后，全县农机管理逐步由行政管理向依法管理转变。农机局对农机生产、经营企业实行行业法规的监督管理和技术服务。依法整顿农机产品市场，规范农机市场秩序。县农机监理站依法对农用运输机械进行管理。
（第六节）畜禽管理
一、生猪屠宰管理
1997年，国务院颁布施行《生猪屠宰管理条例》，全县相关部门对247个屠宰场点进行全面清理整顿，重新规划布局160个生猪屠宰场点，并对其屠宰行为进行法制管理，全面实行驻场检疫制度，凭防疫耳标、产地检疫合格证明进行屠宰。
二、兽药市场管理
1987年，国务院颁发《兽药管理条例》，1988年农业部制定《兽药管理条例实施细则》，将兽药生产经营纳人法制管理轨道。全县兽药管理部门加强监督管理，对县兽药厂、中兽药厂生产的产品定期和不定期抽样监测，每年会同工商、公安等部门对兽药市场进行清理整顿，对经营人员进行条件审核，业务培训。合格者发给经营许可证。对外来产品，全面实行产品人县申报、抽检制度。
三、种畜禽管理
1994年，国务院颁发《种畜禽管理条例》。畜牧部门每年组织专门力量，会同公安等部门对县内种畜（禽）进行全面质量鉴定，淘汰低劣种畜禽。对种畜禽生产、经营业主进行定期业务及法规培训，全面推行《种畜禽合格证》和《种畜禽生产、经营许可证》制度，将种畜禽生产、经营纳人法制管理轨道。
（第七节）社会化服务管理
1984年前，农口各部门对农业、农村、农民的服务一律实行无偿服务。1984年首次实行有偿服务，按照“围绕推广搞经营、搞好经营促推广”的精神，农口各部门及其区乡各站，开始实行技物结合服务，经营种子、农药、肥料等农用物资，取得利润弥补事业费不足，由其上级部门进行财务监督。同时鼓励农业技术人员搞好公益性服务后开展有偿技术承包服务。2002年开始鼓励农业技术人员创建农业科技示范场、农业专业合作经济组织。
（第八节）农业执法
一、种植业执法
2000年前，县农业局种子站负责农作物种子的生产、经营管理，植保植检站负责植物检疫。2000年建立农业执法大队，负责贯彻执行各项农业法规。对农资市场进行监督管理，规范农业生产资料经营行为，杜绝伪劣种子、农药、化肥等进人市场。2005年共查处各类案件339件，结案率96.5%。
（一）查处违法生产种子案件2000年前，不具备杂交种子生产条件，违规生产杂交水稻、杂交玉米、杂交棉花种子的现象时有发生。2000年，华严镇福田村28户农民违法制杂交水稻种28.9亩，岳阳镇岳一村农民违规制杂交玉米种0.45公顷，均被铲除。
（二）查处违法经营种子案件1992年，白水乡部分干部私自购回不合格杂交水稻种卖给农民种植，造成减产，损失9万多元。县财政减免受害农民农业税6万元，其余损失部分由有关责任人赔偿。
2000年，姚市镇农技站私自外调杂交水稻种子“冈优151”销售，使200多公顷水稻减产27%，造成直接经济损失40多万元。有关部门吊销了镇农技站种子代销执照，撤销了镇农技站站长职务，农业行政主管部门代农民向供种的中农科贸公司索赔14万元，兑现到农民手中。2001年，龙台、永清等镇农民购买内江科丰种业公司“冈优725”杂交水稻种子，种植400公顷，因种子纯度仅77%，造成减产，农业行政主管部门代农民索赔28万元。
违规经营种子现象每年均有发生。
2005年，特兴发农产品开发有限公司非法销售未经审定的“特兴发2号”水稻种子1万多公斤，牟取暴利，使通贤、八庙、镇子等乡镇1万多亩水稻减产。农业行政主管部门做出责令停止经营推广，没收违法所得35万元的行政处罚，申请法院强制执行。有关人员被追究法律责任。同年，普州蔬菜协会无《营业执照》、无《种子经营许可证》，从云南省调人未经审定的“昭绿23号”、“昆岗2号”洋芋22.8吨当做种子出售给农民。农业行政主管部门责令协会将洋芋作蔬菜处理，退还购种农户购种款，处罚款1万元，申请法院强制执行。2005年，查处种子案125件，取缔非法经营种子摊点19个，没收违法经营种子439公斤。
（三）处理违法经营农药案件2000—2004年共查处无证经营农药案78件，查处出售无标签或更改标签或标签残缺不能使用的农药171起，查处冒用农药登记号的9起，查处毒性标识错误农药58起，查处经营未经登记不能使用的农药69起，查处出售禁用农药的63起，查处劣质农药4起，查处出售过期农药的139起。2005年查处农药经营案件139件，取缔非法经营农药摊点38个，没收违禁农药和假冒农药530公斤，甲磺隆2100包。
2003年开始清理整顿鼠药市场，至2004年共取缔无照经营鼠药摊点143个，清缴游商配制的“毒鼠强”、“闻到死”等剧毒鼠药13.6公斤，建立鼠药专柜96个。
（四）监督管理化肥经营先后查处10余家小化肥生产企业，无证生产或经营劣质化肥，2005年查处肥料经营案件75件，没收劣质锌、钾肥料1330公斤。
（五）保护森林资源1988年4月，林业局在思贤乡查处乱伐、盗伐林木案11件。1990年全县清查乱伐林木5.23万株，1992年查处毁幼林12万株等案件。至2005年查处盗伐、乱伐案4819件，依法给予判刑、拘留、罚款、缴纳育林费、赔偿林木损失费等处理。
（六）保护野生动物1989年林业局在市场上查获蛇188条、青蛙232公斤、鹰25只。1991年查获收购贩卖野生动物窝点11个，没收青蛙1118公斤、蛇732条、鹰29只、其他鸟14只、白面狸5只。
《野生动物保护法》实施后，收缴并放生蛇4620条446.5公斤、蛙1.74万只2428.25公斤，蟾蜍174只635公斤，鹰87只，其他鸟81只，兽10只，草龟1只。批准5家养殖场养殖美蛙、蛇、野鸡之类野生动物。
（七）植物检疫为杜绝农作物危险性病虫草鼠蔓延危害，县植保站常年坚持产地检疫和调运检疫，对农作物种子生产基地、果苗苗圃进行疫情调查，对调进调出的农作物种子、苗木、粮食和柠檬、通贤柚等鲜果进行检疫检查。每年有数千亩种子、果苗基地，近千吨农产品受检。
2004年开展柑桔溃疡病疫情普查，对全县1.7万公顷果园，20个苗圃，173万多株果苗，1400多万株果树进行调查，抽取120个样本送省植保站复验，销毁带溃疡病苗木40多万株。2005年，登记全县苗圃，并进行田间检疫。田间检疫400公顷杂交水稻、杂交玉米制种基地。调运检疫调出的玉米、水稻种296吨，柠檬鲜果9吨，红苕242吨，柠檬苗1500株，柠檬枝条8万枝，红苕种苗80吨，共75批次。
1990年林业局复核进县境木材《检疫证》。2002年设森林植物检疫站，检疫出人县境木、竹，年检上千吨。
（八）动物防疫检疫1990年，由基层兽医兼任畜禽防疫检疫。1993年设兽医卫生监督检验所，1999年成立动物防疫监督检验所，各中心畜牧站相应成立分所，执行产地检疫和运输检疫，实行凭检疫合格证销售、屠宰、运输制度。
二、牧政执法
1986—1990年，全县采取市场、屠场和运输检疫相结合的办法，对畜禽及其产品进行检疫检验。1993年县兽医卫生监督检验所成立后，挑选近300名技术骨干担任兽医卫生监督、检疫人员，实行考试考核合格上岗，推行兽医卫生证章制度。1999年，成立安岳县动物防疫监督检验所，各中心畜牧站成立动物防疫监督检验分所，全县重新配备300余名专门检疫人员，检疫队伍严格与防疫、诊疗（经营）分离，强力推行一、二类疫病强制免疫，实行防疫合格证和防疫耳标管理制度。检疫工作全面从市场检疫退出，推行产地检疫制度，强化屠宰场点驻场检疫和运输检疫，实行“凭检疫合格证明进行销售、屠宰、运输制度”，加强各环节检疫监督工作，严厉打击违法行为。
（第十一章）涉农机构
（第一节）县农办
1984年县政府农业办公室与财贸办公室、多种经营办公室合并为县政府农贸办公室，县委农业办公室与县委财贸办公室合并为县委农贸部。此后几经变化，2005年更名为中共安岳县委农村工作领导小组办公室（简称农办）。内设综合股、农业产业发展股（挂安岳县小康建设领导小组办公室和农业产业发展办公室两块牌子）、农村经营指导股。编制12名。历任主任：唐吉亨、黎德伦、范丹、李治华、李君贵、李天星。
（第二节）县农业局
2005年，安岳县农业局（简称县农业局）有干部、职工152人。内设行政机构有办公室、政策法规股、科教人事股、计财股、生产股。内设事业机构有农技站、土肥站、植保植检站、多经站、果树站、种子管理站、农产品质量检验检测站、四川省农业广播电视学校安岳分校。直属机构有：农业技术推广中心、棉花生产办公室、土地管理办公室。历任局长：汪权康、李治华、范丹、李胜军、龙刚池、刘权。
（第三节）县林业局
1986年，县林业局内设林业股、场管股、政工股、办公室、林产公司、林产品经销公司。1987年增设林业公安科。1988年成立国营安岳县林场，下设7个分场。1990年增设森林资源站、财会审计股、企业管理股。1992年增设森林病虫害防治检疫站。1999年增设执法大队，将原林政、资源二股合并为林政资源股。同年5月设龙台木材检查站。2004年撤执法大队，按国家统一要求设安岳县公安局森林警察大队。2005年，全局干部、职工49名。历任局长：曾凡杰、梅崇义、陈光良、唐能力、李胜军、彭大恒。
（第四节）县水务局
2000年10月，撤销安岳县水利电力局成立安岳县水务局（简称县水务局）。2001年12月，县水务局内设办公室（挂党委办公室牌子）、政工股（挂科教股牌子）、财务审计股、水政水资源办公室（挂水政监察大队牌子）、水利工程建设管理股（挂规划计划办公室、城乡供水管理站牌子）、水土保持股。局机关事业单位有：防汛抗旱指挥办公室、水土保持办公室、水利电力建筑勘察设计队、水利工程管理站、电力站、水利建设站、抗旱服务队、毗河供水工程办公室。局下属事业单位有：水产渔政局、节约用水办公室、鱼种站、书房坝水库管理所、磨滩河水库管理所、朝阳水库管理所、报花厅水库管理所、康家桥水库管理所。下属企业有：自来水公司、农贸机动车驾驶员培训学校、变压器厂。2005年有干部职工108人。历任局长是：闻学邮、徐道良、王同勋、周向阳。
（第五节）县畜牧食品局
1986年，安岳县畜牧局编制84人。1988年10月，撤销安岳县畜牧局，成立安岳县畜牧食品局，将食品公司、肉联厂划归管理，列人县政府序列局。机关编制27人。1992年5月，成立安岳县畜牧食品总公司，与畜牧食品局实行两块牌子一套人马，为管理服务型公司。1994年总公司全面停止运行。1996年畜牧食品局退出政府序列为县政府直属事业局，机关事业编制20人。历任局长：闻学禄、冷祯明、刘正华、颜成列、代胜勇。
（第六节）县农村经营管理局
安岳县农村经营管理局（简称县农经局），1995年3月成立，归县农业局管理。1998年2月，升格为全民所有制正局级事业单位，编制30人。内设办公室、农民负担管理站、农业承包合同管理站、农村合作经济审计站、农村财务管理站、农村经济发展指导站。历任局长：王荣贤，陈国友、张德永。
（第七节）县农机局
1996年前安岳县农业机械管理局（以下简称县农机局），是政府序列局，内设办公室、管理股、生技股、计财股、后增设执法股。1996年，确定为政府直属事业局，事业编制22名。2002年，生技股更名为行业指导股，计财股更名为财务股，局机关编制18名。2005年12月编制20名。历任局长：刘良君、谭兴平、吴忠明、周长均、王雪。
（第八节）县蚕桑局
1984年12月，建立安岳县蚕丝局，并与安岳县蚕丝公司实行两块牌子，一套班子。1985年6月，撤销县蚕丝公司保留蚕丝局，次年8月恢复县蚕丝公司。1995年12月，改为安岳县蚕桑局和安岳县蚕业总公司，仍实行两块牌子，一套班子。2003年4月蚕业总公司工商注册登记更名为四川省安岳县蚕业公司。局机关设计财股、人事保卫股、桑茧股和办公室，编制43人。历任局长：张诗伦、卢显东、康厚雄、张君林、雷卫东。
（第九节）县气象局
1989年前名安岳县气象站，1990年撤气象站，设县气象局。内设地面预报股、预报农气服务股、行政人降综合办公室、防雷中心，编织10人。历任局长：熊德渊、代述林、熊继东。
（第十节）县农村能源办
1979年10月，成立安岳县沼气局，事业编制10人。内设办公室、设计室、业务股。2004年11月，更名为安岳县农村能源办公室（简称县农能办），划归县农业局管理，内设综合股和业务股。历任主任：汪绍全、石政、唐茂新、杨朝关。
（第十一节）县柠檬办
1995年，成立安岳县柠檬开发办公室，编制3人。1996年，并人县农业局，与果树站合署办公，两块牌子，一套人马。2004年5月，柠檬开发办、柠檬研究所从农业局分出，更名为安岳县柠檬产业发展办公室（简称县柠檬办），编制15人。内设综合股、生产经营股和科研股。历任主任：唐能力、周齐铭、刘孝林。