菲律宾独立战争是1896~1898年菲律宾人民为推翻西班牙殖民统治和反抗美国侵略争取民族独立的战争，它是亚洲第一次资产阶级民族民主革命。
1873年爆发的甲米地起义，唤醒了菲律宾人民的民族意识。1892年7月，以“伟大山民”安德列斯·波尼法秀为首的资产阶级激进派成立了秘密组织“卡蒂普南”（意为“民族儿女至尊协会”）。
1895年底，“卡蒂普南”在圣马特奥山洞召开了一次具有历史意义的会议。会议决定准备发动武装起义，并提出了“菲律宾独立万岁”的口号。正当革命迅速发展之际，西班牙殖民当局发现了起义计划，开始进行镇压。8月23日，“卡蒂普南”在马尼拉近郊的巴林塔瓦克召开紧急会议，决定提前发动起义。会议成立了以哈辛托为首的战时内阁，统一领导起义。
8月26日，在“不战胜毋宁死”和“菲律宾独立万岁”的口号声中，人民开始举行起义，菲律宾独立战争正式爆发。
菲律宾独立战争可分为两个阶段。
1896年为第一阶段。菲律宾全民奋起，起义达到高潮。菲地主和资产阶级保守派的代表艾米利奥·阿奎那多响应波尼法秀的号召，于8月31日在甲米地发动起义，打败了西班牙军，占领甲米地全境。9月，击溃了西班牙阿吉雷指挥的军队，11月，起义军在诺维莱塔和比纳卡扬击溃了总督布兰科指挥的增援部队。
1897~1898年为第二阶段。菲律宾革命遇到了暂时挫折。西班牙当局为了加紧镇压菲律宾革命，于12月撤换了原总督布兰科，任命波拉维夏为菲律宾新总督。同时，从国内调来大批援军，并在菲组建由当地人组成的“忠诚志愿兵营”。此时，波拉维夏共有3.6万人。
1897年2月，西军分兵三路向甲米地发起进攻。菲起义军奋起反击，毙伤敌军1150人。4月23日，里维拉接任波拉维夏为新的菲律宾总督。然而，正当战争紧张进行之时，革命队伍内部发生了分裂。以阿奎那多为首的地主、资产阶级害怕农民革命会危及到自己的利益，为阻止革命深入发展，于1897年5月10日杀害了波尼法秀，篡夺了革命的领导权，并取消了“卡蒂普南”，起义阵营受到严重削弱。5月18日，西军占领甲米地全省，菲律宾革命政府迁到了布拉干的破石洞，继续领导抗战。起义军名将纳蒂比达在阿利亚加战役中击败了西军的进攻，在中吕宋7个省都建立了革命政权。
1897年11月2日，起义军成立了菲律宾共和国，并宣布了临时宪法，阿奎那多任总统。总督里维拉看到镇压已无希望，便向起义者诱降。阿奎那多在殖民者和买办资产阶级的威胁和利诱下，于12月14日与殖民当局签订了《破石洞条约》。阿奎那多从西班牙人处得到80万比索，同意缴械投降，自动解散政府，然后流亡香港。菲律宾独立战争遇到了暂时的挫折。但是，菲律宾人民争取民族独立斗争并未停止。起义军中不愿投降的将领马卡布洛斯等人率军反攻，解放了菲律宾中部的广大地区。
正当菲律宾人民同西班牙殖民者进行艰苦战争之际，美国军队也参加了在菲律宾对西班牙的作战，并插手菲律宾独立战争。1898年5月2日，美国海军在马尼拉湾歼灭西班牙舰队。不久阿奎那多乘美国军舰返回菲律宾。阿回国后，即号召菲律宾军队向西班牙殖民军发起进攻。至5月底，菲军攻占了甲米地全省，全歼西军2800人，俘获西军司令培尼亚将军。6月12日（即今菲律宾国庆节）阿奎那多在甲米地发表独立宣言，宣布菲律宾独立，成立了以阿为首的中央政府。到1898年8月，除马尼拉和南部某些地区外，菲军几乎解放了全部领土。这时，美军却阻挠菲军收复马尼拉，在私下里同西班牙总督达成秘密协定，西班牙把马尼拉“转让”给美国，由美海军陆战队在马尼拉登陆，并迫令菲军撤出马尼拉地区。尽管如此，菲军在各地继续向西班牙军发动进攻。1898年9月15日，菲议会在马拉洛斯举行，制定了宪法。11月29日，菲律宾通过了宪法。1899年1月23日，菲律宾共和国宣告成立，阿奎那多任总统，马比尼任内阁主席。菲律宾共和国的成立，标志着西班牙在菲300年的殖民统治的结束。菲律宾独立战争中的反西班牙战争，以菲人民的胜利而告终。