百日咳的传染性很强，尤其是在还没有出现典型痉咳的病初2～3周。因此，当明确是百日咳时，病儿要及早隔离。隔离期限从痉咳发作算起是40天。对尚未发病的健康儿童，要密切观察其咳嗽情况。孩子得了百日咳，若病情不十分严重，可在家治疗，没有并发症的百日咳患儿，不需卧床休息。
要保证得到充足的阳光和新鲜空气，房间要注意经常开窗通风换气，不要带孩子去公共场所，以减少传播机会。尽量避免会引起咳嗽的不良刺激因素，如接触煤烟、灰尘、哭闹、情绪紧张等。咳嗽时间长也影响食欲，再加上呕吐，会影响小儿的营养，因此应给予营养丰富易于消化的食物，少量多餐。如有呕吐，吐后应再喂。注意不要过热或着凉，防止发生肺炎。如咳嗽严重并发皮肤淤点或眼结膜出血，或并发肺炎时需送医院治疗。