最早发现《敦煌乐谱》的人,是我国清代光绪年间的道士王圆箓。
1900年5月26日,王圆箓在甘肃敦煌县的莫高窟第十六号窟中清理流沙时发现了一批曲谱。这些曲谱全都是唐代较流行的一些曲子,是后唐时期誊写的。由于这些乐谱发掘于敦煌这个地方,故被称为“敦煌乐谱”。
1908年,法国人伯希和向道士王圆箓骗买了大批的绘图、经书等,《敦煌乐谱》也在其中,使之流失国外。至今,《敦煌乐谱》及这批珍品,仍珍藏于法国巴黎国家图书馆内。