虽然他为和平的努力失败了，但是，他最后说服了普里阿摩斯，同意他和波吕克塞娜的婚事，不过约定的婚礼要在战争结束之前尽快举行。婚礼是在城外举行的，当阿喀琉斯打算离开婚礼现场时，背信弃义的帕里斯，偷偷地从后面靠近阿喀琉斯，将一支毒箭射进了阿喀琉斯最易受伤害的脚踝。就这样，一世英雄豪杰、创造了不朽战绩的阿喀琉斯，死于阴险的小人之手。
他的盔甲——伏尔甘打造的无价之宝，被尤利西斯和埃阿斯争夺不休。尤利西斯得到了令人垂涎的武器，埃阿斯却因与盔甲失之交臂而痛心疾首，最后精神失常，在一阵狂怒中杀死了自己。波吕克塞娜也因为情人的死亡，伤心欲绝，最后在特洛亚平原，安葬情人的豪华壮观的墓穴前，自杀身亡。
沉默了如此之久的神谕，此时告诉世人，除了赫丘利的毒箭，特洛亚城不会失手于他人。毒箭眼下在菲罗克忒忒斯手里。这位英雄开始他的远征后，因为脚受了伤，被留在勒罗斯岛。因为他脾气暴烈，攻击性强，所以，水手们也不喜欢他在船上。
从此以后，光阴荏苒，十年晃眼过去。虽然有一些希腊人出发去寻找过他，但是都不抱活着见到他的希望。他们沿着老路来到山洞，当年他就被安顿在里面。结果实在出乎他们的意料，他还活着。脚上的伤还没越合，菲罗克忒忒斯靠杀死接近他身边的野物活了下来。
回忆起希腊人对他的无情无义，菲罗克忒忒斯便怒不可遏，他拒绝随信使前往特洛亚。他说，除非赫丘利在他的梦中出现，吩咐他去，他才会去。只有那样，他才能找到埃斯科拉庇俄斯的儿子马喀翁，只有马喀翁才能治好他的伤。
赫丘利果真在他梦中出现了，于是，菲罗克忒忒斯重新加入了盟军，他的毒箭在敌人的队伍里制造了极大的麻烦。他的一支致命毒箭射着了帕里斯，毒液渗入了血液。帕里斯记得，他的第一个恋人俄诺涅，会制药剂，并善于应用。她曾经告诉他，若有创伤，派人叫她就行了。这样，帕里斯派了人去，但是，不巧，她正处在失恋的痛苦中，拒绝去治病，她要让他在折磨中死去。他真的死了，她却又后悔不已。帕里斯葬礼用的木柴已经堆成了山，她问道：“那上面火化的是谁？”老者如实相告：“一个没有得到医治的可怜人。”当焚烧遗体的火焰高高升起的时候，她知道了烧的是谁。她凄厉的呼叫了一声“我的爱人”，便纵身跳入火中，与他拥抱着一起葬身火海。
普里阿摩斯的两个儿子已经死了，但是，特洛亚城仍然没有落入希腊人手中。又一个神谕告诉他们，如果从天庭掉下来的、落在特洛亚城内的弥涅瓦的圣像在城内存在一天，城邦就不会落入敌人之手。既然是这样，一天晚上，尤利西斯和狄俄墨得斯，乔装打扮入了城，盗得圣像，几经有惊无险的逃避后，又成功地返回了营地。
毫无结果的长期战争已经使将士们失去了耐心，圣像取回来了，这一下大家欢呼雀跃了起来。尤利西斯提出智取特洛亚城，于是，他们开始制造一匹巨大的木马，马肚里是空的，可以容纳一些勇士隐匿其间。战士们假装一副战斗疲乏的样子，纷纷上船，大有要扬帆而去的味道。他们将木马留在海岸，像是给海神涅普顿的献礼。一个叫西依的狡猾奴隶，其实他是希腊人的奸细，竭力怂恿特洛亚人将木马运进城里，作为胜利的纪念品。
久困城内的特洛亚人，毫无防备地欢乐着。而此时的希腊舰队，也扬帆远去，不过，他们在登涅多司岛将船隐蔽起来，以麻痹敌人。快乐的特洛亚人冲出城外，去参观木马，西侬也装出对希腊人十二分怨恨的样子。在回答参观者提问时，西侬劝说特洛亚人，获取希腊人对海神涅普顿的最后祭献。
特洛亚人兴趣高昂，为这个了不起的建议欢呼。然而，涅普顿的祭司拉奥孔，恳求人们别动这匹木马，免得它将可怕的灾难降落在他们头上。拉奥孔向他的同胞呼吁：“可悲的乡亲们，是什么邪恶的疯狂蒙蔽了你们的眼睛？或许，它是希腊人布下的陷阱，或许，他们埋藏在什么地方，突然间像天兵一样从天而降。伪装的潜伏，不能相信呀，不能相信呀，特洛亚的乡亲们！”
但他们都对拉奥孔的警告充耳不闻，拼着气力将木马拖到城市的中心，为了让木马通过，他们拆了一处城墙。这时，拉奥孔跑到海岸，向天神祭献牺牲。他站在祭坛上，他的儿子们分站两边，做他的助手，只见两条蟒蛇从海浪中蹿跃出来，先是缠着他的儿子，用毒牙啮食他们的肢体。他们呼唤来了父亲的帮助，巨大的蛇又把他缠住，拉奥孔拼死挣扎，然而他已经浑身是血。面对冷漠的苍天，他爆发出歇斯底里的嚎叫。他和他的儿子被巨蟒活活地咬死了。
对这件可怕的事情的发生，人们解释说，天神生了拉奥孔的气，因为他介入了木马记。他那只多事的手，胆敢用长枪敲打木马，以证明它不是空的。可能容纳武装人员，这也为他招来了灾祸。后来，拉奥孔的故事，成了诗人和艺术家喜爱的创作题材。
希腊人一直隐蔽在登涅多司岛，天黑下来后，他们又回到十年来安营扎寨的地方。由西侬领进城，并将木马打开，放出隐蔽的武士。虽然袭击来得突然，但是特洛亚卫士仍然拼命抵抗，想将希腊人打退回去。但一切努力都晚了，希腊人已经攻进了民房和宫殿。一路上，他们烧杀抢掠，无恶不作。后世有诗人写道：“忧郁的年代，可悲的忧郁年代，恐怖半夜来，街头火光冲天，宫殿在毁坏中倒塌。无声的军旅从城门涌入，面对手无寸铁的人们，砍钝了他们的刀刃。”
在大屠杀中，王室成员也无一幸免，上了年纪的普里阿摩斯在看到他的儿子死后，自己也在死亡中得到解脱。
实现了目的的希腊人，迅速扬帆返程，他们的船舶满载掠夺而来的物品和奴隶。然而，回家的路并不是想象的那样充满欢乐。许多人没有死在战斗中，却死在海浪中，死在夜晚的篝火旁。
墨涅拉俄斯和他十年未老、依然十分漂亮的妻子海伦，被逆风吹送到埃及。这是天神对他们的惩罚，因为他们忽略了对天神的祭献。墨涅拉俄斯为此向普洛透斯咨询，普洛透斯告诉他怎样消除天神对他的愤怒，怎样才能求得一路顺风，将他们吹送回家。
希腊统帅阿伽门农的结局也是很悲惨的，他回到阿耳戈斯的家，就死在他的妻子克吕泰涅斯特拉和她的情人埃葵斯托斯的手中。对此，阿伽门农是早有预感的，可是，对于背后的阴谋，你是怎么也逃脱不了的。因为只要有心术不正者在，就有阴谋的产生。
只要有杀人者，就会有复仇人。埃葵斯托斯害怕阿伽门农的儿子俄瑞斯忒斯替父亲报仇，他也想阴谋杀死俄瑞斯忒斯。但阿伽门农的女儿厄勒克特拉发现了埃葵斯托斯的意图，所以就帮助自己的兄弟逃命，最后将他置于腓尼基国王斯特洛菲俄斯的保护下，国王的儿子皮拉得斯成了他生死患难的朋友。
虽然离事件发生的时间已经过去很久了，厄勒克特拉一直没有忘记父亲被谋杀的事。俄瑞斯忒斯长大成人了，她将他叫到跟前，告诉他去惩罚那些犯下罪恶的人，俄瑞斯忒斯杀死了埃葵斯托斯和克吕泰涅斯特拉。诗人荷马写道：“埃葵斯托斯霸占了别人的妻子，又杀了阿伽门农，违反公正，他的死是罪有应得。任何人做出这样的坏事，都该遭到毁灭。”然而，俄瑞斯忒斯却被自己的所作所为吓坏了，他弃家外出逃命。天神派遣复仇女神涅墨西斯去惩罚他。
到达特尔斐，俄瑞斯忒斯请求神谕，神谕说，如果他能将在托利斯的戴安娜神像带回希腊的话，他的罪过就可以得到赦免。年轻的王子，在永恒真诚的、从不离开他半步的朋友皮拉得斯的陪同下，来到托利斯的一处神殿，见到了他失散多年的姐妹伊菲革涅亚。在菲革涅亚的帮助下，他找到了神像，并把它带回到了故乡。涅墨西斯也因此停止了对他追踪。