阴阳是一切事物都具有的对立面的两个名词，是用以说明每一事物都有阴阳相对的矛盾性，而且说明一切事物都是在矛盾中发展变化的。所以《素问》说：“阴阳者，天地之道也（自然界对立统一的根本法则），万物之纲纪（一切事物只能遵循这个法则，不能违背它），变化之父母（一切事物的变化都是依据这个法则发生的），生杀之本始（一切生成毁灭都由这个法则起始的），神明之府也（这就是自然界一切奥妙的所在）。治病必求于本（人是自然界生物之一，治病必须寻求这个根本法则）。”
在中医的概念中，人体是由阴阳所代表的两性物质产生和形成的。所以《素问》说：“生之本，本于阴阳。”又说：“阳生阴长，阳杀阴藏。阳化气阴成形。”又认为人是阴阳对立的统一体，必须经常保持阴阳相对平衡，才能正常生活。所以《素问》说：“阴者藏精而起亟也，阳者卫外而为固也……阴平阳秘，精神乃治。”如果人体的阴阳一时出现不平衡，就必然生病，治病就是为了平衡阴阳。所以《素问》又指出：“阴胜则阳病，阳胜则阴病；阳胜则热，阴胜则寒；重寒则热，重热则寒……审其阴阳，以别刚柔，阳病治阴，阴病治阳。”既然人体是阴阳对立面的统一体，那么经常保持阴阳相对平衡，就能祛病延年。
由于自然界的一切事物都是阴阳对立的统一体，并且都是由阴阳所代表的两性物质产生的，因此，人体不仅要保持体内的阴阳平衡，而且还要和自然界的阴阳相适应。所以在《素问》中反复地说，“提挈天地，把握阴阳”，“和于阴阳，调于四时”，“处天地之和，从八风之理”，“法则天地，象似日月”。凡是能这样适应自然条件的，能保持内外环境平衡的，在养生和预防疾病方面，就能达到长寿和健康的目的。
中医的诊断，虽然有六经辨证、营卫气血和三焦的划分，脏腑经络的区别，但是，谈到中医诊断的原则高度，总不离阴阳表里寒热虚实——八纲。而八纲之中，阴阳又为其他六纲的总纲。这就是说，尽管疾病证候是千变万化的，但总不外乎阴阳的范畴。因此，不难理解，属于诊断方面的辨证原则，也当以阴阳为总纲领。所以《素问》有“善诊者，察色按脉，告别阴阳”，“审其阴阳，以别刚柔”，“脉有阴阳，知阳者知阴，知阴者知阳”，“谨熟阴阳，无与众谋”等等说法，都是说明阴阳是辨证的首要关键。
总的说来，中医诊断，主要是综合症状，反复观察，加以分析归纳，辨别其阴阳偏胜或偏衰。如阳偏胜则属阳症，阴偏胜则属于阴症。此外，还有由于阴衰而导致阳盛，或由阳衰而导致阴盛，或阴阳俱虚的现象，也是辨证上很重要的问题。掌握这些关键性问题，对于辨证施治才有准则，才能做到较有把握的治疗。
中药一般运用的规律有四气、五味、升降浮沉等。而这些规律，都是在阴阳说的指导下产生的。
以四气来说，则“寒、凉”属阴，“温、热”属阳；以五味来说，则“辛、甘”发散为阳，“酸、苦”涌泄为阴，“咸”味涌泄为阴，“淡”味渗泄为阳。在气味之中，又有厚薄之区别，如《素问》说：“味厚者为阴，薄为阴之阳；气厚者为阳，薄为阳之阴。”至于升降浮沉，则浮为阳，沉降为阴。应用中药，必须熟悉这些根本规律，才能正确地运用。