对血液系统
氯霉素抑制骨髓造血功能，可致粒细胸缺乏症、再生障碍性贫血、血小板减少性紫癜等。
危害肝脏
损害肝细胞，使转氨酶升高，肝脏脂肪浸润，导致肝原性黄疸、肝脂肪变（脂肪肝）、急性肝坏死。凡有肝病者禁用。
损害肾功能
导致浮肿、血尿、蛋白尿。
中毒性精神障碍
出现幻觉、认知障碍，精神病人忌用。
损害心肌
出现心音低钝，心电图T波倒置或低平改变，发生气促、苍白、紫绀。
危害孕妇及胎儿
氯霉素可通过胎盘危害胎儿，出现早产儿、紫绀、泄泻、呼吸循环衰竭。氯霉素可存在于乳汁中，哺乳女性勿用。
其他危害
头发消化性溃疡、胃炎、肌肉震颤、血压下降等。
温馨提示：
氯霉素是一种广谱抗生素，对革兰氏阳性和阴性细菌、立克次氏体等病原微生物均具有显著的抑制效应，临床曾用于各种细菌性感染尤以对伤寒及副伤寒的疗效为最好。由于它有较高的浓度可以渗入人的脑脊液内，因此常用来治疗化脓性脑膜炎或流行性脑膜炎。
但是，由于氯霉素的毒副作用较大，对机体的某些器官或系统有一定的危害与损伤，所以，近年来已很少应用其注射剂、糖衣片剂及胶囊制剂。