治疗痛经应主要以任脉和足太阴脾经的穴位为主，包括：关元、气海、血海、地机、三阴交等穴。
若患者有气滞血瘀症状，则在主穴基础上加用太冲穴，关元穴用捻转补法针刺，其他穴用捻转泻法，留针30分钟。若患者有寒湿内阻的情况，则对关元穴用捻转补法，其他穴用捻转泻法，留针30分钟，并同时对关元、气海穴施用温针灸。符患者有气血不足症状，则加用足三里穴，地机穴用捻转泻法，其他穴用捻转补法，留针30分钟，小腹冷痛者可对关元、气海穴施用温针灸。
针灸治疗痛经，需要从月经前1周开始治疗，每天1次，1周为1个疗程，治疗期间应停川止痛药。