苗肥是指出苗至拔节前追施的肥料。苗肥应早施、轻施和偏施，以氮素化肥为主，在基肥中未搭配速效肥料或未施种肥的田块，早施、轻施可弥补速效养分不足，有促根壮苗的作用。偏施可使弱苗变壮苗，全田生长均匀。苗肥一般在幼苗长出4片叶时，结合间、定苗进行，每公顷约施碳酸氢铵225千克，开穴施下，随即覆土。对未施基肥的夏玉米，则更应早施、重施苗肥，如以腐熟的有机肥配合氮素化肥施用，则效果更好。
拔节肥应稳施，稳施既可满足拔节阶段生长快，对营养吸收多的要求，达到叶片繁茂，茎秆粗壮的目的，又不会引起茎叶生长过旺而发生倒伏。因此，拔节肥应以有机肥为主，并适量掺和少量速效氮、速效磷肥。对基肥不足，苗势较弱的玉米，应增加化肥用量，一般每公顷可追施150～225千克碳酸氢铵或45～75千克尿素。拔节肥通常在玉米拔节前后、约出7～9片叶时开穴追施，地肥苗壮的应适当迟追、少追，地瘦苗弱的应早施、重施。
穗肥的作用是促进果穗的小穗小花分化，促使穗大粒多，同时使上部叶片增大，叶片功能期延长。穗肥一般在抽雄前10～15天，玉米出现大喇叭口时施用。对基肥不足，苗势差的田块，穗肥应提早施用。穗肥用量应根据苗情、地力和拔节肥施用情况而定，一般每公顷穴施碳酸氢铵225～300千克，或者尿素75～120千克。
粒肥能防止玉米后期脱肥早衰，提高叶片光合能力，因而使粒重增加。特别在穗肥不足，果穗节以下黄叶多的田块，补施粒肥有很好的效果，但对穗肥足，长势旺，叶色深，果穗节下绿叶多的不宜施用，以免延迟成熟。粒肥一般在果穗吐丝时施用为好，这样能使肥效在灌浆乳熟期发挥作用，粒肥用量不宜过多，每公顷穴施碳酸氢铵45～75千克即可，也可用1％～2％的尿素和磷酸二氢钾混合液作叶面喷施，每公顷喷液量750千克左右。