孙思邈把一生全部的精力都倾注于济世救人。他坚守“为医不仕”的志向。
北周大象元年（579），宣帝继位，因其皇后是杨坚（后来的隋文帝）的女儿，故封杨坚为隋王并任丞相，由杨坚总揽朝政。杨坚仰慕孙思邈的才华和影响，想征召孙思邈做国子监博士。杨坚辅政有意篡周，为壮大自己的势力，准备人才，特派人到孙家原村登门召请。
孙思邈深知政局动荡，“王室多故”，借口有病，坚决辞而不应。官员们竭尽努力，也未说动孙思邈。最后无奈，只好与孙思邈道别，怏怏策马回京复命。
孙思邈深知自己拒绝了北周朝廷的征召，官府肯定大为不悦，有抗旨之嫌。“恐征书之复至”，他毅然决定，离家隐居，去太白山。
孙思邈为什么要选择去太白山呢？
太白山山林茂密，峻峰高耸入云，灵丹草药千百态，去天三百浮云间，积雪捧海壮奇观，俯首满坡尽妙药。它是横贯我国中部的秦岭山脉的最高峰，主峰海拔3767米，位于陕西境内的眉县、太白、周至三县的交界处，南面接连佛坪、洋县等一部分山地，峰顶有冰川遗迹，降雪终年不化，故曰“太白积雪六月天”，为关中八景之一。正因太白山有独特的地理环境和瞬息万变的气候条件，使这里成为用之不尽、取之不竭的中草药天然宝库。其种子植物达1600多种，中草药640多种，动、矿物类药材100多种。名贵药材有太白贝母、太白米、太白三七、太白花、药王茶、手儿参等100多种。
乡亲们知道孙思邈要离家远行，纷纷前来劝阻、告别。孙思邈面对家人和群众依依不舍的伤感神情，说：“精研方药，远游行医，普救含灵之苦，乃吾之所志也。”
北周大象元年（579）深秋，孙思邈来到太白山开始了隐居生活。孙思邈在太白山，除了为山区群众行医治病，向群众访问医药外，每到七八月“开山”时节，就同山民、道士、游人一起，背上背篓，带上弓箭诸物，进深山，到峰顶，攀悬崖，爬峭壁，采集各种名贵药材。阴雨天则看书学习，研究药物。因其在太白山居住时最久，故史称“隐于太白”。
太白山关于他与中草药的神奇传说和故事，至今在民间脍炙人口，流传不息。同时，他曾隐居的遗址遗迹也尚还存在。药王洞在三清池南，山巅之阳，玉皇池东南十里有药王池，地极“幽僻，松林茂密，药产颇多，风景优美，形势佳胜，为一山之冠”。
现山上还有药王洞、药王祠、药王庙等。游人进山的路边，可以看到孙思邈当年开凿的石条、石板栈道和石壁上刻有“药王栈道”字样，可以想象当年孙思邈进山采药的艰难，和他为研究太白山药物所作出的伟大贡献与坚忍不拔的顽强决心。