中医的基本治则主要有：扶正祛邪，标本先后，调整阴阳，正治反治，因人、因时、因地制宜。
一、扶正祛邪
扶正与祛邪，是针对虚证和实证所制定的两个基本治疗原则。疾病的过程是正气与邪气之间互相斗争的过程，正盛邪衰则病退，邪盛正衰则病进。由于邪正斗争的消长盛衰变化，便形成了虚证或实证，故治疗疾病的根本目的就是扶助正气，祛除邪气，即所谓“虚则补之”、“实则泻之”。扶正与祛邪虽是两种不同的治则，但二者之间又是相互为用、相辅相成的。扶正的目的在于增强正气，正气充盛，机体抗御病邪和祛除病邪的能力就会提高，这样更有利于祛邪；而祛邪的目的在于祛除邪气，减少和终止邪气对正气的损害和干扰，这样更有利于正气的恢复。因此，扶正即可以祛邪，祛邪有助于扶正，只要运用得当，二者就会相得益彰，促使疾病早日好转和痊愈。使用扶正与祛邪治则，首先要分清证候虚实。若虚证用攻，会使正气愈加消减衰弱；实证用补，可使邪气愈加亢盛。其次，在用药上要注意轻重缓急。一般而言，扶正之法，药量宜先轻后重，贵在长期坚持，并注意保护脾胃的消化功能，否则会导致机体发生新的病变；祛邪之法，用药应注意中病即止，过用则易损伤人体正气，不利于恢复健康。
扶正与祛邪的具体运用，主要有以下3个方面：
（一）扶正与祛邪单独使用
扶正与祛邪治则的单独使用，适用于单纯的虚证或实证。
1.扶正 即扶助正气。是指使用扶助正气的药物，或施行针灸、推拿等疗法，或配合精神调摄、饮食调养、体育锻炼等，以增强体质，提高机体的抗病能力，达到战胜疾病、恢复健康的目的。扶正治则，适用于邪气轻微或邪气已除，以正气虚弱为主要矛盾的虚证。临床上常用的补气法、养血法、滋阴法、温阳法等，都是在扶正治则指导下所制定的治疗方法。
2.祛邪 即祛除邪气。是使用祛除邪气的药物，或针灸、推拿、手术等其他措施，以祛逐病邪，达到邪去而正复的目的。
祛邪治则，适用于正气未衰，以邪气亢盛为主要矛盾的实证。根据邪气的性质和邪气所在的部位，可以选择不同的祛邪方法，如邪在肌表，用发汗解表法；邪在胃肠，用通腑泻下法。有痰饮者，宜用祛痰蠲饮法；有瘀血者，宜用活血化瘀法等。在使用祛邪治则时要注意因势利导，使邪有出路，并做到祛邪务尽，以免留邪为患。
（二）扶正与祛邪兼用
扶正与祛邪兼用，适用于正虚邪盛的虚实错杂证，根据邪正盛衰变化而决定两者的主次。
1.扶正兼祛邪 即扶正为主，兼顾祛邪。适用于正虚为主，邪盛为次的虚实错杂证，如肾阳虚弱而水饮内停，治宜温补肾阳为主，兼利水湿之邪。
2.祛邪兼扶正 即祛邪为主，兼顾扶正。适用于邪盛为主，正虚为次的虚实错杂证，如夏季暑热之邪伤津耗气，治宜清热祛暑为主，兼以生津益气。
扶正与祛邪兼用时，必须以“扶正不致留邪，祛邪不致伤正”为原则。因扶正不当，易使邪气留恋；祛邪欠妥，反易耗伤正气，如高热刚退，便进服大剂补药或厚味食物，常易致余邪留恋，使身热复炽；如体虚兼外感，若过用峻猛发汗之品，也会更加耗伤人体之阴。
（三）扶正与祛邪先后使用
扶正与祛邪分先后使用，适用于正虚邪盛，但不适宜扶正与祛邪兼用的虚实错杂证。此时，将扶正与祛邪分先后使用，可以达到既不伤正，又不碍邪，达到邪祛而正复的目的。
1.先祛邪后扶正 在正虚邪盛的虚实错杂证中，若正气虽虚，但尚能耐攻；或邪盛为主，兼顾扶正反会助邪时，可先祛邪后扶正。例如瘀血所致的崩漏，虽有血虚症状，但瘀血不去，崩漏难止，故应先活血化瘀以祛邪，而后再予养血补虚以扶正。
2.先扶正后祛邪 在正虚邪盛的虚实错杂证中，若正气虚甚，不耐攻邪；或正虚为主，兼以攻邪反会更伤正气时，可先扶正后祛邪。例如某些虫积病人，因病久正气颇衰，若直接驱虫，恐难以耐受，故先用扶正健脾法使正气渐复，然后再予驱虫消积以祛邪。
二、标本先后
标与本是一个相对的概念，常用来说明疾病过程中的各种矛盾关系。标本具有多种含义，若以疾病的本质与现象而言，本质为本，现象为标；以发病的先后而言，先发之病为本，后发之病为标；以病因与症状而言，病因为本，症状为标等。应该注意的是，标本之“本”与治病求本之“本”，不属于同一层次上的概念，前者是相对于“标”而建立的概念，有着多种不同的具体含义，而后者的含义则较明确，指的就是病证变化规律的内在本质。
标本先后治则在临床上的运用，是强调了从复杂多变的病证中，分清其标本缓急，然后确定治疗上的先后主次。这一治则体现了处理疾病过程中各种矛盾的灵活方法，体现了重点突出、措施有节的治疗步骤，也是对治病求本原则的补充。
（一）急则治标
急则治标是指标病或标症甚急，有可能危及患者生命或影响对本病治疗时所采用的一种治疗原则。由于此时的标病或标症已成为疾病过程中某阶段矛盾的主要方面，也往往是疾病的关键所在，因此先治其标也是治本的必要前提。例如，大出血的病人，若短时间内出血量很多，甚至危及生命时，无论属于什么原因导致的出血，都应采取紧急措施以止血，待血止病情缓解后，再根据其出血的病因病机予以治本。又如水臌病，当出现大量腹水，呼吸喘促，大小便不利等急重症状时，应即用逐水通便之法先治其标，待大小便通利，腹水减轻或消除后，再调理肝脾以治其本。
（二）缓则治本
缓则治本是指标病或标症缓而不急时所采用的一种治疗原则。这是在治病求本原则指导下常用的治则。由于此时的本病是矛盾的主要方面，所以应当直接治其本，病本去而标自消。例如，风寒头痛，风寒之邪阻滞经络的病因病机为本，头痛的症状表现为标，采用疏风散寒法针对本质进行治疗，风寒之邪一除，则头痛自解。又如肺阴虚所致的咳嗽，肺阴虚为本，咳嗽为标，治疗用滋阴润肺之法，肺阴充足，则咳嗽亦随之而愈。
（三）标本兼治
标本兼治是指标病与本病错杂并重时采取的一种治疗原则。此时，单治本不治其标，或单治标不治其本，都不能适应治疗病证的要求，故必须标本兼顾而同治，才能取得较好的治疗效果。例如，阳热内盛，阴液亏损，出现腹满痛而便结，若单用清热泻下以治标，则进一步伤正；若仅用滋阴生津以治本，则热邪又不得祛除，只有采用滋阴与泻下并举的标本兼治法，才能使正盛邪退而病愈。
三、调整阴阳
人体的病理变化虽然复杂，但其根本原因是阴阳失调。调整阴阳，补偏救弊，促进阴平阳秘，就是针对阴阳失调这一基本病理变化而制定的治疗原则。正如《素问至真要大论》所说：“谨察阴阳所在而调之，以平为期。”在具体运用时，又要以扶正祛邪治则为指导，一方面补益人体阴阳之偏衰，另一方面祛除阴阳偏盛之邪气，从而达到阴阳平衡，使疾病痊愈的目的。
（一）损其有余
损其有余又称祛其偏盛，是针对阴阳偏盛病理变化所制定的治疗原则。阴阳偏盛是指阴邪或阳邪的亢盛，所谓“邪气盛则实”，故临床上表现为实证，当采用“实则泻之”的原则以损其有余。其中，阳邪偏盛导致实热证，应以寒清热，用“热者寒之”的方法祛除阳邪；阴邪偏盛导致实寒证，应以热散寒，用“寒者热之”的方法祛除阴邪。
《素问阴阳应象大论》指出：“阴胜则阳病，阳胜则阴病。”若阴阳偏盛进一步发展，损及人体正气明显者，则当兼顾其不足，在损其有余的同时，分别配以滋阴或温阳的治法。
（二）补其不足
补其不足又称补其偏衰，是针对阴阳偏衰病理变化所制定的治疗原则。由于阴阳偏衰是指人体正气之阴阳虚衰，即所谓“精气夺则虚”，故临床上表现为虚证，当采用“虚则补之”的治则以助其不足。其中，阳偏衰不能制阴而阴盛，出现虚寒证，当补阳以制阴，又称为“阴病治阳”或“益火之源，以消阴翳”，阴偏衰不能制阳而阳亢，出现虚热证，当养阴以制阳，又称为“阳病治阴”或“壮水之主，以制阳光。”
由于阴阳之间存在着互根互用的关系，所以阴阳偏衰的进一步发展，可以产生“阴阳互损”的病理变化，即阴虚日久可损及阳气而引起阳虚，阳虚日久可损及阴液而引起阴虚，其结果是出现阴阳两虚证。对此应采取阴阳并补的治法。
在治疗阴阳偏衰的病证时，还要注意“阴中求阳”、“阳中求阴”的阴阳相济之法。
“阴中求阳”是指在补阳时适当配用补阴药，以此来促进阳气的化生；“阳中求阴”是指在补阴时适当配用补阳药，以此来促进阴液的化生。正如《景岳全书新方八略引补略》所言：“善补阳者，必于阴中求阳，则阳得阴助而生化无穷；善补阴者，必于阳中求阴，则阴得阳升而泉源不竭。”
四、正治反治
正治与反治，是在“治病求本”根本原则指导下，针对病证有无假象而制定的两种治疗原则。
各种疾病的性质不同，病证本质所反映的现象亦非常复杂。临床上大多数病证的本质与所表现的现象是一致的，但有些病证，其本质与所表现的现象却不尽一致，即出现假象。正治与反治，就是指所用治法的性质与病证现象之间表现出逆从关系的两种治则，所谓“逆者正治，从者反治”（《素问至真要大论》）。
（一）正治
正，有常规之意。正治是指治疗用药的性质、作用趋向逆病证表象而治的一种常用治则。这一治则采用与病证性质相反的方药进行治疗，故又称为“逆治”，适用于本质与现象相一致的病证。
常用的正治法主要有以下4种。
1.寒者热之 寒性病证出现寒象，用温热性质的方药进行治疗，就称为“寒者热之”，如表寒证用辛温解表法，里寒证用辛热散寒法等。
2.热者寒之 热性病证出现热象，用寒凉性质的方药进行治疗，就称为“热者寒之”，如表热证用辛凉解表法，里热证用苦寒清热法等。
3.虚则补之 虚性病证出现虚象，用补益扶正的方药进行治疗，如阳气虚弱证用温阳益气法，阴血不足证用滋阴养血法等。
4.实则泻之 实性病证出现实象，用攻逐祛邪的方药进行治疗，如痰热壅滞证用清热化痰法，瘀血内阻证用活血化瘀法等。
（二）反治
反，与“正”相对，具有变异、非常规之意。反治是指所用药物的性质、作用趋向顺从病证的某些表象而治的一种治则。这一治则采用与病证表现的假象性质相一致的方药进行治疗，故又称为“从治”，适用于本质与现象不完全一致的病证。
常用的反治法主要有以下4种：
1.热因热用 用温热性质的方药治疗具有假热现象病证的治法，又称以热治热法。适用于阴寒内盛，格阳于外的真寒假热证，例如病人四肢厥冷、下利清谷、脉微欲绝等，病证本质属阳衰阴寒，但同时又见身热不恶寒、口渴面赤、脉大等阳气浮越于外的假热症状，应用温热的方药顺从假热属性治其真寒，待里寒一散，阳气得复，假热自然消失。
2.寒因寒用 用寒凉性质的方药治疗具有假寒现象病证的治法，即以寒治寒法。适用于阳热极盛，格阴于外的真热假寒证，例如病人渴喜冷饮、烦躁不安、便干尿黄、舌红苔黄，病证本质属里热炽盛，但同时又见四肢厥冷、脉沉等阳气被遏不能外达的假寒症状，故用寒凉的方药顺从假寒属性治其真热，待里热一清，阳气外达，假寒便会随之解除。
3.塞因塞用 用补益的方药治疗具有闭塞不通症状之虚性证候的治法，即以补开塞法。适用于真虚假实证。一般实邪内阻时，往往会出现闭塞不通的症状，但在人体气血津液不足，脏腑功能低下时，也会出现因虚而闭塞不通的现象，例如脾气虚运化无力，可出现脘腹胀满；肠腑阴液不足，可导致便秘；胞宫精血亏虚，易引起闭经等，这些病证的本质皆为虚，所以运用“塞因塞用”的反治法，分别给予补气健脾，滋阴润肠以及充养精血等补益的方法治疗，闭塞不通的症状便能缓解。
4.通因通用 用通利祛邪的方药治疗具有通泄症状之实性证候的治法，即以通治通法。一般气虚无力固摄时，往往会出现通利的症状，但当实邪阻滞，气化失司时，也可出现通泄下痢的现象，例如饮食积滞引起的腹泻，瘀血内停出现的崩漏，膀胱湿热导致的尿频等，这些病证的本质皆为实，故运用“通因通用”的反治法，分别给予消导泻下、活血化瘀和清利湿热等祛邪的方法治疗，通泄的症状即会痊愈。
总之，正治与反治，在所用药物性质与病证表象性质上存在着相逆与相从的差异，但对疾病的本质而言，二者都是逆其病证性质而治的法则，均属于治病求本，反治原则是治病求本原则在特殊状态下的体现。
五、因人、因时、因地制宜
因人、因时、因地制宜，是指治疗疾病时，要根据病人、时令、地理等具体情况，制订适宜的治疗方法。疾病的发生和发展变化是由多方面因素所决定的，人的年龄、性别、体质，时令气候变化，以及地理环境差异等，对病变都有一定的影响。因此，临床治疗时，除应掌握治疗疾病的一般规律外，还应知常达变，综合考虑以上因素，做到区别对待，灵活处理。